Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481391
• Subject: XM_011544770.1
• Aligned Length: 1199
• Identities: 1129
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCTAAAGGCCGAGGGCGCCGCACTCGACTGCTTCGAGGTGACGCTGAAATGCGAGGAAGGGGAGGACGA  74

Query   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGAGGCCATGGTGGTGGCCGTAATTCCGCGGCCCGAGCCGATGCTCAGAGTGACCCAACAGGAGAAGACCC  148

Query  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCGCCTAGACCCAGCCCGCTAGAGGCAGGCAGTGATGGCTGTGAGGAGCCGAAGCAGCAGGTGTCTTGGGAG  222

Query  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGTTCCTGGTGGGCAGCAGCCCAGGAGGCAGCGGGCGGGCACTGTGCATGGTGTGTGGCGCTGAGATCCG  296

Query  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACCCTCGGCCGACACAGCTCGCTCGCACATCTTGGAGCAGCACCCTCACACCTTGGACCTGAGCCCTTCTG  370

Query  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAGAGCAATATCCTGGAGGCCTGGAGTGAAGGGGTGGCCCTCTTGCAAGACGTGAGAGCTGAGCAGCCGTCC  444

Query  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACCCAACTCAGACTCGGGCCAGGATGCCCACCCAGACCCAGACGCCAACCCAGACGCTGCCAGAATGCCAGC  518

Query  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCAGGCCCAGGGGACTCCGCC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAATCGTCGTTCTCCTTGACTCTGAGGATAACCCATCCCTCCCTAAAAGGAGCCGGCCCAGGGGACTCCGCC  592

Query  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTCGAGCTTCCTGCTGTCCCTGCCACAGAGCCAGGAAATAAGAAGCCCCGTGGTCAGAGATGGAAGGAACCC  666

Query  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCAGGGGAAGAGCCAGTCAGAAAGAAAAGAGGCAGACCTATGACCAAAAACCTGGACCCTGACCCAGAGCCCCC  740

Query  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCGCCAGACTCGCCCACGGAGACTTTCGCAGCACCAGCCGAGGTCCGACACTTCACTGACGGCAGCTTCCCCG  814

Query  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGGCTTCGTCTTGCAGCTCTTCTCCCACACCCAGCTCAGGGGCCCAGACAGCAAGGACTCACCCAAAGACAGG  888

Query  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGCTCCCCCTC----CGGGGCTCC-GCGGG  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||....|||||    |..|  ||| |.||.
Sbjct  889  GAAGTGGCAGAAGGAGGCCTTCCCCGGGCGGAGAGCCCCTCTCCAGGGAGCCCTCATTTCAAG--TCCTGGGGT  960

Query  958  ACACTG-----GATCTCCA------------GGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTC  1014
            ||.|||     .|.|||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ACCCTGTGCGCAAACTCCATCTATCTGGAGTGGTTATCCGCGTGCGGATGGAGGAGCCCCCAGCGGTCAGCCTC  1034

Query 1015  CTGCAAGACTGGTCCAGGCACCCCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGT  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  CTGCAAGACTGGTCCAGGCACCCCCAGGGCACCAAGCGTGTGGGAGCAGGTGACACCTCAGACTGGCCCACAGT  1108

Query 1089  TCTGTCAGAATCCAGCACCACTGTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTG-------------------  1143
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct 1109  TCTGTCAGAATCCAGCACCACTGTGGCAGGGAAGCCGGAAAAAGGGAATGGAGTGTAAATTCTTGCTTTCCTGG  1182

Query 1144  ---------------  1143
                           
Sbjct 1183  GGAGGGAGGGAGGGA  1197