Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481437
- Subject:
- NM_001163262.1
- Aligned Length:
- 2322
- Identities:
- 1679
- Gaps:
- 465
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATGTGACGAGCAGCTCGGGCGGCGGCGACCCCCGGCAGATCGAGGAGACCAAGCCGCTGCTTGGGAGCGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGTGTCTGGCCCCGAGGGCACCAAGGTGATGGGCGCCGTGCCTTGCCGCCGGGCCCTGCTGCTTTGCAACGGGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGAGGTACAAGCTGCTGCAGGAGGGCGACATTCAGGTCTGTGTCATCCGGCACCCTCGGACCTTTCTCAGCAAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ATCCTCACCTCCAAATTCCTGAGGCGCTGGGAGCCGCACCACCTAACGCTGGCCGACAACAGCTTAGCATCCGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CACGCCGTCTGGGTACATGGAAAACTCGGTCTCCTACAGCGCCATTGAAGACGTTCAGCCGCTGTCCTGGGAGA 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 ACGCCCCGAAGTACTGTTTACAGCTCACGATCCCCGGAGGGACCGTCCTGCTGCAGGCTGCCAACAGCTACCTG 444
Query 1 ----ATGGCAAGTGTTGCC--------------CAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCC 56
|| .||||.|.|| .|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CGAGAT---CAGTGGTTCCATTCTCTGCAGTGGAAGAAAAAGATTTACAAATACAAGAAAGTCCTGAGTAACCC 515
Query 57 AAGCCGCTGGGAAGTTGTCTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATG 130
||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||
Sbjct 516 AAGCCGCTGGGAGGTTGTCTTGAAGGAGATACGGACGCTGGTGGACATGGCCCTCACGTCGCCTCTGCAGGATG 589
Query 131 ACTCCATCAACCAGGCCCCACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAG 204
|.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 590 ATTCTATCAACCAGGCTCCGCTGGAAATCGTCTCAAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACCTGACCACTCAGGAG 663
Query 205 CATGAAAACATCATTGTGGCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTT 278
||.||.|||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 664 CACGAGAACATCATTGTGGCAATTGCGCCTCTGCTAGAAAACAACCACCCACCCCCAGACCTCTGCGAATTCTT 737
Query 279 TTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCC 352
.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.||||
Sbjct 738 CTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCTATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACACCAGTGGTTCAGAGGATCC 811
Query 353 TCAAGCATAACATGGACTTTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAAC 426
|.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.|||||
Sbjct 812 TTAAACATAATATGGACTTTGGGAAGTGCCCAAGGCTGAGGCTCTTCACCCAGGAGTATATTCTTGCCCTGAAC 885
Query 427 GAGCTCAACGCGGGGATGGAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCA 500
|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 886 GAGCTCAACGCAGGCATGGAGGTGGTAAAGAAGTTCATACAAAGCATGCATGGCCCCACAGGGCACTGCCCACA 959
Query 501 CCCCCGGGTCCTGCCCAACCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACA 574
.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 TCCCCGGGTCCTGCCCAATCTCGTGGCTGTGTGCCTGGCTGCCATATACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACA 1033
Query 575 GCCGCGACAATTCCCCAAGCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTA 648
|.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1034 GTCGCGACAACTCCCCCAGCCTGAAAGAGATCCGAAACGGCTGCCAGCAGCCATGCGACCGAAAGCCCACCTTA 1107
Query 649 CCTCTGCGCCTTCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTC 722
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1108 CCTCTGCGTCTGCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACATTGTCTGAGCCACGGCTGAAGTC 1181
Query 723 GGTGGTCGTGGCCTCCAGTGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCA 796
||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1182 GGTGGTTGTGGCCTCCAGCGAGGTCCACGTGGAGGTGGAGCGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACCGCCA 1255
Query 797 GCGCAGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATC 870
||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||||
Sbjct 1256 GCACGGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTTATTGACTGTCTGATGGTCAGCCCAGCCTGTGGGACCATGAGCATC 1329
Query 871 GAGCTGGGCCCCCAGGCCGACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGA 944
|||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1330 GAGCTGGGCCCCCAGGCCGGCCGCACGCTCGGTTGCCACGTGGAGATCCTCAAGCTGCTGTCCGACTACGATGA 1403
Query 945 CTGGAGACCGTCTCTGGCCAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCA 1018
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1404 CTGGAGACCGTCTCTGGCCAGCTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCCCACGAGAAGTTCA 1477
Query 1019 CCAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGC 1092
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1478 CAAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTTGCAGAAGATCCAAGACAGGAAGTCCACTCCTGTCTGCTGAGC 1551
Query 1093 GTGCGGGCCGGCAAAGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCT 1166
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1552 GTGCGGGCAGGCAAGGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCTGGAGGGGTGGCCTGTGATGATGACGGGGAGCT 1625
Query 1167 GTTCGCCAGCATGGTGCACATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAA 1240
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1626 GTTTGCCAGCATGGTGCACATTCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAGTTTCTGCTCTCACTGGCAGAAA 1699
Query 1241 ACAAGCTGGGTCCCTGCATGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTG 1314
||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700 ACAAGCTGGGCCCCTGTATGCTCCTGGCCCTGAGAGGGAACCAGACCATGGCAGAGATCCTGTGTTTGATGCTG 1773
Query 1315 GAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAA 1388
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1774 GAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCCACGCTGGAGAGCACGGACGTGGGCAA 1847
Query 1389 GCGCATGTACGAGCAGCTGTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGC 1462
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1848 GCGCATGTATGAACAGCTGTGCGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGACCCACCAGGC 1921
Query 1463 TAACACTGCCCTCCAAGTCCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAG 1536
||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1922 TAACACTGCCCTCCAAGTCCACGGATGCGGACCTGGCCCGCCTGCTGAGCTCTGGCTCCTTTGGAAACCTGGAG 1995
Query 1537 AACCTCAGTTTGGCCTTCACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCA 1610
||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1996 AACCTCAGCTTGGCCTTCACCAACGTCACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCCCTCAAGCA 2069
Query 1611 GCTGAACCTGTGGTCCACTCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGG 1684
|||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 2070 GCTCAATCTGTGGTCCACGCAGTTTGGAGACGCCGGCCTGCGGCTCCTTTCGGAGCACCTCACTATGCTCCAAG 2143
Query 1685 TGCTGAACCTGTGCGAGACCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGT 1758
|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2144 TGCTGAACCTGTGTGAGACCCCAGTCACCGACGCGGGCTTGCTGGCCCTCAGCTCCATGAAGAGTCTTTGCAGT 2217
Query 1759 TTAAACATGAACAGCACCAAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGA 1832
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.|||||
Sbjct 2218 TTAAATATGAACAGCACCAAGCTCTCGGCTGACACCTACGAGGATCTGAAGGCCAAGCTTCCTAACCTAAAGGA 2291
Query 1833 AGTGGACGTCCGCTACACCGAAGCCTGG 1860
.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2292 GGTTGATGTTCGCTACACGGAAGCCTGG 2319
