Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481437
- Subject:
- NM_028941.1
- Aligned Length:
- 2058
- Identities:
- 1679
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGACCTTTGGTCCTGGGGATGAACATCCAGAGCCGTCTGGGTACATGGAAAACTCGGTCTCCTACAGCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CATTGAAGACGTTCAGCCGCTGTCCTGGGAGAACGCCCCGAAGTACTGTTTACAGCTCACGATCCCCGGAGGGA 148
Query 1 ------------------------------------ATGGCAAGTGTTGCC--------------CAGAAAAAG 24
|| .||||.|.|| .||||||||
Sbjct 149 CCGTCCTGCTGCAGGCTGCCAACAGCTACCTGCGAGAT---CAGTGGTTCCATTCTCTGCAGTGGAAGAAAAAG 219
Query 25 ATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAAGTTGTCTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGT 98
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 220 ATTTACAAATACAAGAAAGTCCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAGGTTGTCTTGAAGGAGATACGGACGCTGGT 293
Query 99 GGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCCCACTGGAAATCGTCTCGAAACTGC 172
||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 294 GGACATGGCCCTCACGTCGCCTCTGCAGGATGATTCTATCAACCAGGCTCCGCTGGAAATCGTCTCAAAACTGC 367
Query 173 TCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTGGCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAAC 246
|||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.||||.||||||
Sbjct 368 TCTCAGAGAACACAAACCTGACCACTCAGGAGCACGAGAACATCATTGTGGCAATTGCGCCTCTGCTAGAAAAC 441
Query 247 AACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCAT 320
|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 442 AACCACCCACCCCCAGACCTCTGCGAATTCTTCTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCTATGGTGGTCAT 515
Query 321 CGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACTTTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGC 394
||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||
Sbjct 516 CGAGGTGTTCACACCAGTGGTTCAGAGGATCCTTAAACATAATATGGACTTTGGGAAGTGCCCAAGGCTGAGGC 589
Query 395 TGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATGGAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAG 468
|.||.||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.
Sbjct 590 TCTTCACCCAGGAGTATATTCTTGCCCTGAACGAGCTCAACGCAGGCATGGAGGTGGTAAAGAAGTTCATACAA 663
Query 469 AGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAACCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGC 542
||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 664 AGCATGCATGGCCCCACAGGGCACTGCCCACATCCCCGGGTCCTGCCCAATCTCGTGGCTGTGTGCCTGGCTGC 737
Query 543 CATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAAGCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCT 616
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 738 CATATACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGTCGCGACAACTCCCCCAGCCTGAAAGAGATCCGAAACGGCT 811
Query 617 GCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAG 690
||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 GCCAGCAGCCATGCGACCGAAAGCCCACCTTACCTCTGCGTCTGCTGCACCCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAG 885
Query 691 GAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAGTGAGATCCACGTGGAGGTGGAACG 764
||||||||..||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||.||
Sbjct 886 GAAGCCACATTGTCTGAGCCACGGCTGAAGTCGGTGGTTGTGGCCTCCAGCGAGGTCCACGTGGAGGTGGAGCG 959
Query 765 CACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTCATCGACTGCCTCA 838
|||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 960 CACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACCGCCAGCACGGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTTATTGACTGTCTGA 1033
Query 839 TGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCCGACCGCACGCTCGGCTGCTACGTG 912
||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 1034 TGGTCAGCCCAGCCTGTGGGACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCCGGCCGCACGCTCGGTTGCCACGTG 1107
Query 913 GAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGCCAGTTTGCTTCAACCCATTCCATT 986
||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GAGATCCTCAAGCTGCTGTCCGACTACGATGACTGGAGACCGTCTCTGGCCAGCTTGCTTCAACCCATTCCATT 1181
Query 987 CCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACC 1060
||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1182 CCCCAAAGAAGCTCTCGCCCACGAGAAGTTCACAAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTTGCAGAAGATC 1255
Query 1061 CCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCC 1134
|.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256 CAAGACAGGAAGTCCACTCCTGTCTGCTGAGCGTGCGGGCAGGCAAGGATGGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCT 1329
Query 1135 GGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCACATCCTCATGGGCTCCTGTTACAA 1208
||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 GGAGGGGTGGCCTGTGATGATGACGGGGAGCTGTTTGCCAGCATGGTGCACATTCTCATGGGCTCCTGTTACAA 1403
Query 1209 GACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCATGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACC 1282
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1404 GACCAAAAAGTTTCTGCTCTCACTGGCAGAAAACAAGCTGGGCCCCTGTATGCTCCTGGCCCTGAGAGGGAACC 1477
Query 1283 AGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATC 1356
|||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 AGACCATGGCAGAGATCCTGTGTTTGATGCTGGAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCAACTGCAGATC 1551
Query 1357 ATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCTGTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAA 1430
|||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 ATCTCCACGCTGGAGAGCACGGACGTGGGCAAGCGCATGTATGAACAGCTGTGCGACCGGCAGCGGGAGCTGAA 1625
Query 1431 GGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGTCCACAGACGCTGACTTGGCTCGTT 1504
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||..
Sbjct 1626 GGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGACCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGTCCACGGATGCGGACCTGGCCCGCC 1699
Query 1505 TGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTCACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCC 1578
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1700 TGCTGAGCTCTGGCTCCTTTGGAAACCTGGAGAACCTCAGCTTGGCCTTCACCAACGTCACCAGTGCCTGCGCC 1773
Query 1579 GAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCACTCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCG 1652
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1774 GAGCACCTCATCAAACTGCCTTCCCTCAAGCAGCTCAATCTGTGGTCCACGCAGTTTGGAGACGCCGGCCTGCG 1847
Query 1653 GCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGACCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGC 1726
||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||.|||
Sbjct 1848 GCTCCTTTCGGAGCACCTCACTATGCTCCAAGTGCTGAACCTGTGTGAGACCCCAGTCACCGACGCGGGCTTGC 1921
Query 1727 TGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACCAAGCTCTCAGCTGACACCTACGAA 1800
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1922 TGGCCCTCAGCTCCATGAAGAGTCTTTGCAGTTTAAATATGAACAGCACCAAGCTCTCGGCTGACACCTACGAG 1995
Query 1801 GATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACACCGAAGCCTGG 1860
||||||||||||||||||||.||..|.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1996 GATCTGAAGGCCAAGCTTCCTAACCTAAAGGAGGTTGATGTTCGCTACACGGAAGCCTGG 2055