Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481437
• Subject: XM_006531435.3
• Aligned Length: 1860
• Identities: 1684
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCAAGTGTTGCCCAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAAGTTGT  74
            |||||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCTGGTGTTGCCCAGAAAAAGATTTACAAATACAAGAAAGTCCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAGGTTGT  74

Query   75  CTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCC  148
            ||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CTTGAAGGAGATACGGACGCTGGTGGACATGGCCCTCACGTCGCCTCTGCAGGATGATTCTATCAACCAGGCTC  148

Query  149  CACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTG  222
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  149  CGCTGGAAATCGTCTCAAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACCTGACCACTCAGGAGCACGAGAACATCATTGTG  222

Query  223  GCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGA  296
            |||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAATTGCGCCTCTGCTAGAAAACAACCACCCACCCCCAGACCTCTGCGAATTCTTCTGCAAGCACTGCAGAGA  296

Query  297  GCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACT  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  297  GCGGCCCCGGTCTATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACACCAGTGGTTCAGAGGATCCTTAAACATAATATGGACT  370

Query  371  TTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATG  444
            |||||||||||||..|.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  371  TTGGGAAGTGCCCAAGGCTGAGGCTCTTCACCCAGGAGTATATTCTTGCCCTGAACGAGCTCAACGCAGGCATG  444

Query  445  GAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAA  518
            ||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGTGGTAAAGAAGTTCATACAAAGCATGCATGGCCCCACAGGGCACTGCCCACATCCCCGGGTCCTGCCCAA  518

Query  519  CCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAA  592
            .||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  519  TCTCGTGGCTGTGTGCCTGGCTGCCATATACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGTCGCGACAACTCCCCCA  592

Query  593  GCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCAC  666
            |||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  GCCTGAAAGAGATCCGAAACGGCTGCCAGCAGCCATGCGACCGAAAGCCCACCTTACCTCTGCGTCTGCTGCAC  666

Query  667  CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACATTGTCTGAGCCACGGCTGAAGTCGGTGGTTGTGGCCTCCAG  740

Query  741  TGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCG  814
            .|||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  741  CGAGGTCCACGTGGAGGTGGAGCGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACCGCCAGCACGGGCAACGACAGCG  814

Query  815  AGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC  888
            ||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCAACCTTATTGACTGTCTGATGGTCAGCCCAGCCTGTGGGACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC  888

Query  889  GACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC  962
            |.||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCCGCACGCTCGGTTGCCACGTGGAGATCCTCAAGCTGCTGTCCGACTACGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC  962

Query  963  CAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACG  1036
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCCCACGAGAAGTTCACAAAGGAACTGAAGTACG  1036

Query 1037  TGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGAT  1110
            |||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1037  TGATTCAGAGGTTTGCAGAAGATCCAAGACAGGAAGTCCACTCCTGTCTGCTGAGCGTGCGGGCAGGCAAGGAT  1110

Query 1111  GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCA  1184
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCTGGAGGGGTGGCCTGTGATGATGACGGGGAGCTGTTTGCCAGCATGGTGCA  1184

Query 1185  CATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCA  1258
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1185  CATTCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAGTTTCTGCTCTCACTGGCAGAAAACAAGCTGGGCCCCTGTA  1258

Query 1259  TGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC  1332
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCTCCTGGCCCTGAGAGGGAACCAGACCATGGCAGAGATCCTGTGTTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC  1332

Query 1333  AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCT  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1333  AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCCACGCTGGAGAGCACGGACGTGGGCAAGCGCATGTATGAACAGCT  1406

Query 1407  GTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT  1480
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTGCGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGACCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT  1480

Query 1481  CCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTC  1554
            ||||.||.||.|||.||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  CCACGGATGCGGACCTGGCCCGCCTGCTGAGCTCTGGCTCCTTTGGAAACCTGGAGAACCTCAGCTTGGCCTTC  1554

Query 1555  ACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCAC  1628
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555  ACCAACGTCACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCCCTCAAGCAGCTCAATCTGTGGTCCAC  1628

Query 1629  TCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGA  1702
            .||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1629  GCAGTTTGGAGACGCCGGCCTGCGGCTCCTTTCGGAGCACCTCACTATGCTCCAAGTGCTGAACCTGTGTGAGA  1702

Query 1703  CCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACC  1776
            ||||.|||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1703  CCCCAGTCACCGACGCGGGCTTGCTGGCCCTCAGCTCCATGAAGAGTCTTTGCAGTTTAAATATGAACAGCACC  1776

Query 1777  AAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACAC  1850
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1777  AAGCTCTCGGCTGACACCTACGAGGATCTGAAGGCCAAGCTTCCTAACCTAAAGGAGGTTGATGTTCGCTACAC  1850

Query 1851  CGAAGCCTGG  1860
            .|||||||||
Sbjct 1851  GGAAGCCTGG  1860