Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481437
- Subject:
- XM_011248527.2
- Aligned Length:
- 2142
- Identities:
- 1679
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATCCATCCTTGGCTCTAAGCGCAGAGTCTGCATGGAGTCAGAAGCCGCCACCTATTGGTACATCTATGAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGACCTTCTTGTGGACAAATACCTGATCAGAAGCAACTTACAGAGGCCGTCTGGGTACATGGAAAACTCGGTCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCTACAGCGCCATTGAAGACGTTCAGCCGCTGTCCTGGGAGAACGCCCCGAAGTACTGTTTACAGCTCACGATC 222
Query 1 ----------------------------------------------ATGGCAAGTGTTGCC------------- 15
|| .||||.|.||
Sbjct 223 CCCGGAGGGACCGTCCTGCTGCAGGCTGCCAACAGCTACCTGCGAGAT---CAGTGGTTCCATTCTCTGCAGTG 293
Query 16 -CAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAAGTTGTCTTGAAAGAGATCC 88
.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 294 GAAGAAAAAGATTTACAAATACAAGAAAGTCCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAGGTTGTCTTGAAGGAGATAC 367
Query 89 GGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCCCACTGGAAATCGTC 162
||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 368 GGACGCTGGTGGACATGGCCCTCACGTCGCCTCTGCAGGATGATTCTATCAACCAGGCTCCGCTGGAAATCGTC 441
Query 163 TCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTGGCAATCGCTCCTTT 236
||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 442 TCAAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACCTGACCACTCAGGAGCACGAGAACATCATTGTGGCAATTGCGCCTCT 515
Query 237 GCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCCA 310
|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 516 GCTAGAAAACAACCACCCACCCCCAGACCTCTGCGAATTCTTCTGCAAGCACTGCAGAGAGCGGCCCCGGTCTA 589
Query 311 TGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACTTTGGGAAGTGCCCG 384
||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 590 TGGTGGTCATCGAGGTGTTCACACCAGTGGTTCAGAGGATCCTTAAACATAATATGGACTTTGGGAAGTGCCCA 663
Query 385 CGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATGGAAGTGGTGAAGAA 458
.|.||||||||.||.||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 664 AGGCTGAGGCTCTTCACCCAGGAGTATATTCTTGCCCTGAACGAGCTCAACGCAGGCATGGAGGTGGTAAAGAA 737
Query 459 GTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAACCTGGTGGCCGTGT 532
||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 738 GTTCATACAAAGCATGCATGGCCCCACAGGGCACTGCCCACATCCCCGGGTCCTGCCCAATCTCGTGGCTGTGT 811
Query 533 GCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAAGCCTGAAGGAAATC 606
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 812 GCCTGGCTGCCATATACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGTCGCGACAACTCCCCCAGCCTGAAAGAGATC 885
Query 607 CGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCACCCCAGCCCGGACCT 680
||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 886 CGAAACGGCTGCCAGCAGCCATGCGACCGAAAGCCCACCTTACCTCTGCGTCTGCTGCACCCCAGCCCGGACCT 959
Query 681 GGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAGTGAGATCCACGTGG 754
||||||||||||||||||..||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 960 GGTGTCTCAGGAAGCCACATTGTCTGAGCCACGGCTGAAGTCGGTGGTTGTGGCCTCCAGCGAGGTCCACGTGG 1033
Query 755 AGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTCATC 828
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1034 AGGTGGAGCGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACCGCCAGCACGGGCAACGACAGCGAGCCCAACCTTATT 1107
Query 829 GACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCCGACCGCACGCTCGG 902
|||||.||.|||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1108 GACTGTCTGATGGTCAGCCCAGCCTGTGGGACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCCGGCCGCACGCTCGG 1181
Query 903 CTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGCCAGTTTGCTTCAAC 976
.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1182 TTGCCACGTGGAGATCCTCAAGCTGCTGTCCGACTACGATGACTGGAGACCGTCTCTGGCCAGCTTGCTTCAAC 1255
Query 977 CCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTC 1050
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1256 CCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCCCACGAGAAGTTCACAAAGGAACTGAAGTACGTGATTCAGAGGTTT 1329
Query 1051 GCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGATGGCTGGTTCCAGCT 1124
||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330 GCAGAAGATCCAAGACAGGAAGTCCACTCCTGTCTGCTGAGCGTGCGGGCAGGCAAGGATGGCTGGTTCCAGCT 1403
Query 1125 CTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCACATCCTCATGGGCT 1198
|||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 CTACAGCCCTGGAGGGGTGGCCTGTGATGATGACGGGGAGCTGTTTGCCAGCATGGTGCACATTCTCATGGGCT 1477
Query 1199 CCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCATGCTCCTGGCACTG 1272
|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1478 CCTGTTACAAGACCAAAAAGTTTCTGCTCTCACTGGCAGAAAACAAGCTGGGCCCCTGTATGCTCCTGGCCCTG 1551
Query 1273 AGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCA 1346
||.||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 AGAGGGAACCAGACCATGGCAGAGATCCTGTGTTTGATGCTGGAATACAACATCATCGACAACAACGACACCCA 1625
Query 1347 ACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCTGTGTGACCGGCAGC 1420
|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1626 ACTGCAGATCATCTCCACGCTGGAGAGCACGGACGTGGGCAAGCGCATGTATGAACAGCTGTGCGACCGGCAGC 1699
Query 1421 GGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGTCCACAGACGCTGAC 1494
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1700 GGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGACCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGTCCACGGATGCGGAC 1773
Query 1495 TTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTCACCAATGTAACCAG 1568
.||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1774 CTGGCCCGCCTGCTGAGCTCTGGCTCCTTTGGAAACCTGGAGAACCTCAGCTTGGCCTTCACCAACGTCACCAG 1847
Query 1569 TGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCACTCAGTTTGGAGACG 1642
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1848 TGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCCCTCAAGCAGCTCAATCTGTGGTCCACGCAGTTTGGAGACG 1921
Query 1643 CTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGACCCCGGTCACAGAC 1716
|.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1922 CCGGCCTGCGGCTCCTTTCGGAGCACCTCACTATGCTCCAAGTGCTGAACCTGTGTGAGACCCCAGTCACCGAC 1995
Query 1717 GCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACCAAGCTCTCAGCTGA 1790
||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1996 GCGGGCTTGCTGGCCCTCAGCTCCATGAAGAGTCTTTGCAGTTTAAATATGAACAGCACCAAGCTCTCGGCTGA 2069
Query 1791 CACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACACCGAAGCCTGG 1860
|||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2070 CACCTACGAGGATCTGAAGGCCAAGCTTCCTAACCTAAAGGAGGTTGATGTTCGCTACACGGAAGCCTGG 2139