Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481437
- Subject:
- XM_017023733.1
- Aligned Length:
- 1860
- Identities:
- 1758
- Gaps:
- 102
Alignment
Query 1 ATGGCAAGTGTTGCCCAGAAAAAGATTTACAAATATAAGAAAGTGCTGAGTAACCCAAGCCGCTGGGAAGTTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTGAAAGAGATCCGGACCCTGGTGGACATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------ATGGCCCTGACATCCCCCCTGCAGGATGACTCCATCAACCAGGCCC 46
Query 149 CACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 CACTGGAAATCGTCTCGAAACTGCTCTCAGAGAACACAAACTTGACCACCCAGGAGCATGAAAACATCATTGTG 120
Query 223 GCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GCAATCGCTCCTTTGCTGGAAAACAACCACCCACCACCAGATCTCTGTGAATTCTTTTGCAAGCACTGCAGAGA 194
Query 297 GCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GCGGCCCCGGTCCATGGTGGTCATCGAGGTGTTCACCCCCGTGGTGCAGCGAATCCTCAAGCATAACATGGACT 268
Query 371 TTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 TTGGGAAGTGCCCGCGACTGAGGCTGTTTACTCAGGAGTACATCCTTGCCTTGAACGAGCTCAACGCGGGGATG 342
Query 445 GAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 GAAGTGGTGAAGAAGTTCATTCAGAGCATGCACGGCCCCACAGGGCACTGCCCCCACCCCCGGGTCCTGCCCAA 416
Query 519 CCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CCTGGTGGCCGTGTGCCTGGCTGCCATCTACTCCTGCTATGAAGAGTTCATCAACAGCCGCGACAATTCCCCAA 490
Query 593 GCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 GCCTGAAGGAAATCCGGAACGGCTGCCAGCAGCCGTGCGACCGGAAGCCCACTTTACCTCTGCGCCTTCTGCAC 564
Query 667 CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CCCAGCCCGGACCTGGTGTCTCAGGAAGCCACGCTGTCTGAGGCCCGGCTCAAGTCGGTGGTCGTGGCCTCCAG 638
Query 741 TGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 TGAGATCCACGTGGAGGTGGAACGCACCAGCACTGCCAAGCCGGCGCTGACGGCCAGCGCAGGCAACGACAGCG 712
Query 815 AGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 AGCCCAACCTCATCGACTGCCTCATGGTCAGCCCCGCCTGCAGCACCATGAGCATCGAGCTGGGCCCCCAGGCC 786
Query 889 GACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 GACCGCACGCTCGGCTGCTACGTGGAAATCCTCAAGCTGCTGTCAGACTATGATGACTGGAGACCGTCTCTGGC 860
Query 963 CAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 CAGTTTGCTTCAACCCATTCCATTCCCCAAAGAAGCTCTCGCACATGAGAAGTTCACCAAGGAACTGAAGTACG 934
Query 1037 TGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 TGATTCAGAGGTTCGCCGAAGACCCCAGGCAAGAGGTCCACTCATGCCTGCTGAGCGTGCGGGCCGGCAAAGAT 1008
Query 1111 GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 GGCTGGTTCCAGCTCTACAGCCCCGGAGGGGTGGCCTGCGACGATGACGGGGAGCTGTTCGCCAGCATGGTGCA 1082
Query 1185 CATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 CATCCTCATGGGCTCCTGTTACAAGACCAAAAAATTCCTGCTCTCCCTGGCAGAAAACAAGCTGGGTCCCTGCA 1156
Query 1259 TGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 TGCTCCTGGCACTGAGGGGGAACCAGACCATGGTGGAGATCCTGTGCTTGATGCTGGAATACAACATCATCGAC 1230
Query 1333 AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 AACAACGACACCCAACTGCAGATCATCTCAACCCTGGAGAGCACAGACGTGGGGAAGCGCATGTACGAGCAGCT 1304
Query 1407 GTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 GTGTGACCGGCAGCGGGAGCTGAAGGAGCTGCAAAGGAAAGGCGGGCCCACCAGGCTAACACTGCCCTCCAAGT 1378
Query 1481 CCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 CCACAGACGCTGACTTGGCTCGTTTGCTGAGCTCCGGCTCCTTCGGAAACCTGGAGAACCTCAGTTTGGCCTTC 1452
Query 1555 ACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453 ACCAATGTAACCAGTGCCTGCGCCGAGCACCTCATCAAACTGCCTTCGCTCAAGCAGCTGAACCTGTGGTCCAC 1526
Query 1629 TCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527 TCAGTTTGGAGACGCTGGCCTTCGGCTCCTGTCGGAACACCTCACCATGCTCCAGGTGCTGAACCTGTGCGAGA 1600
Query 1703 CCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601 CCCCGGTCACAGACGCTGGCCTGCTGGCCCTGAGCTCCATGAAGAGTCTCTGCAGTTTAAACATGAACAGCACC 1674
Query 1777 AAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675 AAGCTCTCAGCTGACACCTACGAAGATCTGAAGGCCAAGCTTCCCAATTTGAAGGAAGTGGACGTCCGCTACAC 1748
Query 1851 CGAAGCCTGG 1860
||||||||||
Sbjct 1749 CGAAGCCTGG 1758