Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481450
• Subject: NM_001004176.2
• Aligned Length: 3440
• Identities: 2922
• Gaps: 76

Alignment

Query    1  ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCTGCCGCGAATGGCAGTAGTATTTGCATCAACAGTAGCCTGAACAGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct    1  ATGGGGGATTTCGCAGCCCCCGCTGCCGCCGCGAATGGTAGTAGTATCTGCATCAACAGCAGCCTGAGCAGCAG  74

Query   75  CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGTGTGAATAATACTCCCAATAGTACTCCCGCTGCTCCGAGTAGCAATCACCCGG  148
            |||||||||||||||||||||.|||   ||||||||||||||.|||||.|.||||||||||.||||||||||.|
Sbjct   75  CCTCGGCGGGGCCGGGATCGGCGTG---AATACTCCCAATAGCACTCCGGTTGCTCCGAGTGGCAATCACCCCG  145

Query  149  CAGCCGGTGGATGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCGGTTCGGCGGCCGTTCCCAAGCACAGCACCGTGGTG  222
            |.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.
Sbjct  146  CTGCCGGCGGCTGCGGCGGCTCCGGGGGCCCCGGCGGCAGCTCGGCGGCCGTCCCCAAGCACAGCACGGTAGTC  219

Query  223  GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGTCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTACCAGCAGGCTCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  220  GAGCGGCTCCGCCAGCGCATCGAGGGCTGCCGGCGGCACCACGTCAACTGCGAGAACAGGTATCAGCAGGCTCA  293

Query  297  GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTACCAGCGGACCCTGGAGCAGAGGGCCAAGA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  294  GGTGGAGCAGCTGGAGCTGGAGCGCCGGGACACCGTGAGCCTCTATCAGAGGACCCTGGAGCAGAGAGCCAAGA  367

Query  371  AATCGGGCGCCGGCACCGGCAAACAGCAGCACCCGAGCAAACCCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCGGCGGAG  444
            |||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  368  AATCGGGCGCCGGCAGCGGCAAGCAGCAGCACCCGAGTAAAACCCAGCAAGATGCGGAGGCTGCCTCAGCCGAG  441

Query  445  CAGAGGAACCACACGCTGATCATGCTACAAGAGACTGTGAAAAGGAAGTTGGAAGGAGCTCGATCACCACTTAA  518
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  442  CAGAGGAACCATACGCTGATCATGCTGCAAGAGACTGTGAAGAGGAAGTTGGAAGGGGCCCGATCGCCACTAAA  515

Query  519  TGGAGACCAGCAGAATGGTGCTTGTGATGGGAATTTTTCTCCGACTAGCAAACGAATTCGAAAGGACATTTCT-  591
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||||..||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||    ||| 
Sbjct  516  TGGGGACCAGCAGAATGGCGCTTGCGACGGGAGCTTCTCTCCCACAAGCAAGCGCATCCGAAAGGA----TCTT  585

Query  592  ---GCGGGGATGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAGTAACATGCCACTGCCTTCAGCTTCTCCTCTTCACCAACT  662
               .|||||.||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||.|.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  586  GGCACGGGGCTGGAAGCCATCAACAATTTGCCCAACAACATGCCCCTGACGTCAGCATCTCCCCTTCACCAACT  659

Query  663  TGACCTGAAACCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGTGGAACTCACACTCCTGGGCTTCTAGAAGATCTAAGTAAGA  736
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|...|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  660  TGACCTCAAGCCTTCTTTGCCCTTGCAGAACAGCGCTGCTCACACCCCTGGGCTTCTGGAAGATCTGAGTAAGA  733

Query  737  ATGGTAGGCTCCCTGAGATTAAACTTCCTGTCAACGGTTGCAGTGACCTGGAGGATAGCTTCACCATCTTGCAG  810
            |.||.||||||               ||||||||.||.||..|.||.||||||||||||||..|.|||||.|||
Sbjct  734  ACGGCAGGCTC---------------CCTGTCAATGGCTGTGGGGATCTGGAGGATAGCTTTGCTATCTTACAG  792

Query  811  AGCAAAGACCTCAAACAAGAACCTCTCGATGACCCTACTTGCATAGACACATCAGAAACATCTCTTTCAAATCA  884
            |.|||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  793  AACAAGGACCTCAAACAGGAGCCTCTTGACGACCCTGCCTGCATAGACACATCGGAGACGTCCCTTTCTAATCA  866

Query  885  GAACAAGCTGTTCTCAGACATTAATCTGAATGATCAGGAGTGGCAAGAATTAATAGATGAATTGGCCAACACGG  958
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  867  GAACAAGCTGTTCTCTGACATTAACCTGAATGACCAAGAGTGGCAAGAACTAATAGACGAACTGGCCAACACGG  940

Query  959  TTCCTGAGGATGACATACAGGACCTGTTCAACGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCCAGAATTCTCGCAGCCA  1032
            ||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||.|||||.|||.||
Sbjct  941  TTCCGGAAGACGACATCCAGGACCTGTTCAATGAAGACTTTGAAGAGAAGAAGGAGCAGGAGTTCTCACAGACA  1014

Query 1033  GCAACTGAGACCCCTCTCTCCCAGGAGAGTGCGAGCGTGAAGAGCGACCCCTCTCACTCTCCCTTCGCACATGT  1106
            .|.|..|||||.||.||||||||||||||.|.|||.|||||||||||..|||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1015  ACCATGGAGACGCCACTCTCCCAGGAGAGCGTGAGTGTGAAGAGCGATGCCTCTCACTCTCCTTTTGCACACGT  1088

Query 1107  CTCCATGGGATCTCCCCAGGCGAGGCCTTCTTCTTCTGGTCCTCCCTTTTCTACTGTCTCCACGGCCACTAGTT  1180
            |||..|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||..|
Sbjct 1089  CTCTCTGGGATCGCCTCAGGCCAGACCCTCATCTTCTGGTCCTCCCTTTTCCACTGTCTCCACAGGCACTAACT  1162

Query 1181  TACCTTCTGTTGCCAGCACTCCCGCAGCTCCAAACCCTGCAAGCTCACCAGCAAACTGTGCTGTCCAGTCCCCT  1254
            |.||.||.||.||||.||||||||..||||.|||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1163  TGCCATCCGTGGCCAACACTCCCGGGGCTCAAAACCCTGCCAGCTCGCCAGCTAACTGTGCTGTCCAGTCCCCC  1236

Query 1255  CAAACTCCAAACCAAGCCCACACTCCAGGCCAAGCTCCACCTCGGCCTGGAAATGGTTATCTCCTGAATCCGGC  1328
            ||.|||||||.||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||.|.
Sbjct 1237  CAGACTCCAACCCAAGCCCACACCCCAGGTCAAGCCCCACCTAGGCCTGGCAATGGCTATCTCCTTAATCCAGT  1310

Query 1329  AGCAGTGACAGTGGCCGGTTCAGCGTCAGGGCCTGTGGCTGTGCCCAGCTCTGACATGTCTCCAGCAGAACAGC  1402
            ..|.|||.||||..|.|||||||.||||||..|||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1311  CTCTGTGGCAGTATCTGGTTCAGGGTCAGGCTCTGTGGCAGGGCCCAGCTCTGACATGTCCCCAGCAGAGCAGC  1384

Query 1403  TCAAACAGATGGCTGCACAGCAGCAACAAAGGGCCAAACTCATGCAGCAGAAGCAGCAACAGCAACAGCAGCAG  1476
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1385  TCAAACAGATGGCTGCCCAGCAACAACAGAGGGCAAAACTCATGCAGCAGAAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAG  1458

Query 1477  CAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCACTCAAATCAGACTTCAAATTGGTCTCCCTT  1550
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.|||      ||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1459  CAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAACAACAACAG------CAGCACTCAAATCAGACTTCAAGTTGGTCTCCCTT  1526

Query 1551  AGGACCTCCCTCTAGTCCATATGGAGCAGCTTTTACTGCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTACCCCCAAG  1624
            |||.|||||.||.||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  AGGGCCTCCGTCAAGTCCATATGGAACAGCTTTTGCTTCAGAAAAACCAAATAGCCCAATGATGTACCCCCAAG  1600

Query 1625  CCTTTAACAACCAAAACCCTATAGTGCCTCCAATGGCAAACAACCTGCAGAAGACAACAATGAATAACTACCTC  1698
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1601  CCTTTAACAACCAAAACACTATAGTGCCTGCAATGGCAAACAGCCTGCAGAAGACGACCATGAACAACTACCTC  1674

Query 1699  CCTCAGAATCACATGAATATGATCAATCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAACAGCACAA  1772
            |||...|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  CCTTCCAATCACATGAATATGATCAGTCAGCAGCCAAATAACTTGGGTACAAACTCCTTAAACAAACAGCACAA  1748

Query 1773  TATTCTGACTTATGGCAACACTAAACCCCTGACCCACTTCAATGCAGACCTGAGTCAGAGGATGACACCACCAG  1846
            ||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||||.|||.|||||.||.||..
Sbjct 1749  TATTCTCACCTATGGCAACACTAAGCCTCTGACCCATTTTAATGCGGACTTGAGTCCGAGAATGACGCCCCCTA  1822

Query 1847  TGGCCAACCCCAACAAAAACCCCTTGATGCCGTATATCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAGCAACAGCAG  1920
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||   |||||||..||||||..|||.||||..||||.|
Sbjct 1823  TGGCCAACCCCAACAAAACCCCCTTGATGCCCTACATC---CAGCAGCCTCAGCAGTCGCAGCAGCCCCAGCCG  1893

Query 1921  CAGCAGCAGCAGCAGCAGCCACCACCT---CCACAGCTCCAGGCCCCCAGGGCACACCTGAGCGAAGACCAGAA  1991
            ||||.||..||||||||||||||.|||   ||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1894  CAGCCGCCCCAGCAGCAGCCACCGCCTCCCCCGCAGCTGCAGGCTCCCAGGGCGCACCTGAGCGAGGACCAGAA  1967

Query 1992  ACGCCTGCTTCTCATGAAGCAGAAAGGAGTGATGAATCAGCCCATGGCTTACGCTGCACTTCCATCCCACGGTC  2065
            ||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|..||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1968  ACGCATGCTTCTCATTAAGCAGAAAGGAGTGATGAACCCACCCATGGCCTATGCTGCGCTTCCTGCCCACGGTC  2041

Query 2066  AGGAGCAGCATCCAGTTGGACTTCCCCGAACCACAGGCCCCATGCAGTCCTCCGTGCCCCCAGGCTCAGGTGGC  2139
            ||||||||||..||||.||..|||||||.|||||||||||.||||||..|||.||||||.|.||.||.||..||
Sbjct 2042  AGGAGCAGCACGCAGTCGGTATTCCCCGGACCACAGGCCCTATGCAGAACTCTGTGCCCTCGGGGTCGGGCAGC  2115

Query 2140  ATGGTCTCAGGAGCCAGTCCCGCAGGCCCCGGCTTCCTGGGCAGCCAGCCCCAAGCAGCCATCATGAAGCAGAT  2213
            ||||||||.|||||||||||.|..||||..||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2116  ATGGTCTCCGGAGCCAGTCCTGGGGGCCTTGGATTTCTAGGCAGCCAGCCACAGGCAGCCATCATGAAGCAGAT  2189

Query 2214  GCTCATTGATCAGCGGGCCCAGTTGATAGAGCAGCAGAAGCAACAGTTCCTGCGGGAGCAAAGG----------  2277
            |||.||.||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||          
Sbjct 2190  GCTAATGGACCAACGGGCCCAGCTGATGGAGCACCAGAAGCAACAGTTCCTTCGGGAGCAGAGGCAGCAGCAGC  2263

Query 2278  --------------------CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATTTTGGCGGAACAGCAGTTGCAGCAATCA  2331
                                ||||||||||||||||||||||||||..||||.||.||||||||.|||||..|.
Sbjct 2264  AACAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGATCCTGGCTGAGCAGCAGTTACAGCAGCCG  2337

Query 2332  CATCTACCCCGGCAGCACCTCCAGCCACAGCGGAATCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAATCAGTTTCAAGGTTC  2405
            ||.||.|||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2338  CACCTGCCCCGTCAGCACCTCCAGCAACAGCGGAACCCATACCCAGTGCAGCAGGTCAACCAGTTTCAAGGTTC  2411

Query 2406  TCCCCAGGATATAGCAGCCGTAAGAAGCCAAGCAGCCCTCCAGAGCATGCGAACGTCACGGCTGATGGCACAGA  2479
            .||||||||.||||||||.||.||||.|||.|..||.|||||||||||||||.|.||..||.||||.|||||||
Sbjct 2412  ACCCCAGGACATAGCAGCTGTGAGAAACCAGGTGGCTCTCCAGAGCATGCGAGCATCGAGGTTGATTGCACAGA  2485

Query 2480  ACGCAGGCATGATGGGAATAGGACCCTCCCAGAACCCTGGGACGATGGCCACCGCAGCTGCGCAGTCGGAGATG  2553
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2486  ATGCGGGCATGATGGGAATGGGACCCTCCCAGAACCCAGGGACGATGGCTACGGCAGCAGCGCAGTCAGAGATA  2559

Query 2554  GGACTGGCCCCTTATAGCACCACGCCTACCAGCCAACCAGGAATGTACAATATGAGCACAGGCATGACCCAAAT  2627
            ||.||||||.||||.||..||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 2560  GGTCTGGCCTCTTACAGTGCCCCTCCAACCAGCCAACCAGGAATGTACAACATGAACACAGGAATGACCCAAAT  2633

Query 2628  GTTGCAGCATCCAAACCAAAGTGGCATGAGCATCACACATAACCAAGCCCAGGGACCGAGGCAACCTGCCTCTG  2701
            ||||||||||.|.||.||.|||||.|||.|||||.||||.||||||.||||||||||.||||..||.|||||..
Sbjct 2634  GTTGCAGCATTCCAATCAGAGTGGAATGGGCATCCCACACAACCAATCCCAGGGACCCAGGCCGCCAGCCTCCA  2707

Query 2702  GGCAGGGGGTTGGAATGGTGAGTGGCTTTGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCAGCCATTACCCAGCAACATCCA  2775
            |.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||..|..|.|||||.|| |||
Sbjct 2708  GCCAGGGGGTCGGCATGGTGAGCGGCTTCGGTCAGAGCATGCTGGTGAACTCGGCTCTCTCGCAGCAGCA-CCA  2780

Query 2776  -CAGATGAAAGGGCCAGTAGGCCAGGCCTTGCCTAGGCCCCAAGCCCCTCCAAGGCTGCAGAGCCTTATGGGAA  2848
             |||.||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||..|.|||||||
Sbjct 2781  GCAGCTGAAAGGGTCTGTGGGCCAGGCCTTGCCTAGGCCCCAGGGCCCTCCAAGGCTTCAGAGTGTCATGGGAA  2854

Query 2849  CAGTCCAGCAAGGAGCACAAAGCTGGCAACAGAGGAGCTTGCAGGGCATGCCTGGGAGGACTAGTGGAGAATTG  2922
            |.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2855  CCGTCCAGCAAGGAGCACAAAACTGGCAACAGAGGAGCTTACAAGGGGTGCCTGGGAGGACTAGTGGGGAGTTG  2928

Query 2923  GGACCATTCAACAATGGCGCCAGCTACCCTCTTCAAGCTGGGCAGCCGAGACTGACCAAGCAGCACTTCCCACA  2996
            |||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2929  GGACCATTCAACAATGGCGCCAGCTACCCATTGCAAGCCGGTCAGCCAAGACTGACCAAACAGCACTTCCCACA  3002

Query 2997  GGGACTGAGCCAGTCAGTCGTGGATGCTAACACGGGCACAGTGAGGACCCTCAACCCAGCTGCCATGGGTCGGC  3070
            |||.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 3003  GGGGCTGAGCCAGCCCGTCATGGATGCTAACACTGGCGCAGTGAGAACCCTCAACCCAGCAGCTATGGGACGTC  3076

Query 3071  AGATGATGCCATCGCTCCCGGGGCAGCAAGGCACCAGCCAGGCGAGGCCAATGGTCATGTCTGGCCTGAGCCAG  3144
            |||||||||||.|.||..|.||.|||||..|..|||||||||.|||||||.||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 3077  AGATGATGCCAACCCTGGCAGGACAGCAGAGTGCCAGCCAGGTGAGGCCATTGGTCATGCCTGGTCTGAGCCAG  3150

Query 3145  GGAGTCCCAGGCATGCCAGCGTTCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATACCCAGTGGCAGCTTTGCTCCAAG  3218
            ||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|.||
Sbjct 3151  GGTGTCCCTGGCATGCCAGCATTCAGCCAGCCCCCAGCACAGCAGCAGATAGCAGGTGGCAACTTTGCTGCGAG  3224

Query 3219  CAGCCAGAGCCAAGCCTATGAGCGGAATGCCC---CTCAGGACGTGTCATACAATTACAGTGGCGACGGAGCTG  3289
            ||.||||.||||.|||||||||||||   |||   ||||||||.|||||||||.|||.||.|||||.||.|..|
Sbjct 3225  CAACCAGGGCCAGGCCTATGAGCGGA---CCCCTGCTCAGGACATGTCATACAGTTATAGCGGCGAAGGTGTCG  3295

Query 3290  GGGGTTCCTTCCCTGGCCTCCCGGACGGTGCAGACCTTGTGGACTCCATCATCAAAGGCGGGCCAGGGGACGAG  3363
            |||.|.||||||||||||||||.|||.||.|||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||.
Sbjct 3296  GGGCTGCCTTCCCTGGCCTCCCAGACAGTACAGACCTCGTGGACTCCATCATCAAAAGTGGCCCAGGGGATGAA  3369

Query 3364  TGGATGCAGGAGCTTGATGAATTGTTTGGTAACCCC  3399
            ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 3370  TGGATGCAAGAGCTTGATGAACTGTTTGGTAACCCC  3405