Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481469
• Subject: NM_001145832.1
• Aligned Length: 2065
• Identities: 1765
• Gaps: 83

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC  74
            ||||||||||||||||..||||||||||||.||.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..|    ||
Sbjct    1  ATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGGCAGGAGCTGAGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGGC----CC  70

Query   75  AGCAGGT----CCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTG  144
            |||.|||    ||||||...||.|||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  AGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTG  144

Query  145  CAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCT  218
            |||.||||..||||.||.|.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  145  CAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAAGGCATGCTGTCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGGACCGGCT  218

Query  219  GGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCC  292
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct  219  GGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAAGGACTGTCTGGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGCCGGCGCC  292

Query  293  TGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTG  366
            |||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  293  TGCGTGACAGCCATGAGACTATCGCCAGTCTGAGGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAAGACAGTG  366

Query  367  GAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGT  440
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  367  GAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAAGT  440

Query  441  GGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCC  514
            |||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..|.|.|.|
Sbjct  441  GGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAGCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTCCAGTTGC  514

Query  515  GGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTG  588
            ||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  515  GGGCTCAGATTGCCATGTATGAGGCAGAGCTGGAGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCTTG  588

Query  589  GAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAA  662
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  589  GAGGAGGATAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTACACGAGAA  662

Query  663  TCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGC  736
            .||.|||||.|||.||||||||.|||||||..|||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCTGCTGACGCTGCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGC  736

Query  737  TCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAG  810
            ||||||||||||||||.|.||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  737  TCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCCCCTTGCTGCTGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGATCGGCCAG  810

Query  811  GCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAA  884
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct  811  GCCATCGAGGAGGTTAATAGCAACAACCAGGAGCTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGCGCAAGAA  884

Query  885  GTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGG  958
            .|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  885  ATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCTGAAGGGAAACATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACCAAGGAGG  958

Query  959  ATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCAC  1032
            ||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||..|.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  ATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCAATGCTGTGACCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCTGCTGCAC  1032

Query 1033  AAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGA  1106
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  AAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGTTCCAGGA  1106

Query 1107  GGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCG  1180
            ||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1107  GGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTGCATCGATGGCTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACAGGTGCCG  1180

Query 1181  GCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCC  1254
            |||||||.||.||.|||||||||||..|.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1181  GCAAGACATATACAATGGAGGGGACTCCCGAGAACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCG  1254

Query 1255  GAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCT  1328
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1255  GAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGCAGTACAACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATGAAGTCCT  1328

Query 1329  CAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGT  1402
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1329  CAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCCTCAGGAGAAGCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGGCAACTGT  1402

Query 1403  ATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACT  1476
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..
Sbjct 1403  ATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCCAGGTGCAGAGCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCTACAAC  1476

Query 1477  AATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCG  1550
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1477  AACCGCACCACCGAGTTCACCAACCTGAACGAACACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGACAGTGAG  1550

Query 1551  AGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCG  1624
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|
Sbjct 1551  AGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCAGAGCGTG  1624

Query 1625  TGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGG  1698
            ||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||||||
Sbjct 1625  TGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCAACCGCCTGCGAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGCCCTGGGG  1698

Query 1699  GACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCA  1772
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1699  GACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCTCGACAAGGCCATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACCTGCTGCA  1772

Query 1773  GGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGA  1846
            |||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1773  GGACTCACTCAGTGGTGACAGCAAGACCCTTATGGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACCAGCGAGA  1846

Query 1847  CGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTT  1920
            |.||.||.|||||||..||||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||...|||.|..|||||||.
Sbjct 1847  CTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTGAGAGGGTTCGCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCACAGAGCTG  1920

Query 1921  GGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCC---------------  1979
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||               
Sbjct 1921  GGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCACCTGGAGTGGGAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCACGAGCCCA  1994

Query 1980  CTCGGCC------------------------------------------------------------  1986
            |||.|||                                                            
Sbjct 1995  CTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCAGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGCC  2061