Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481469
- Subject:
- NM_001318710.2
- Aligned Length:
- 2544
- Identities:
- 1983
- Gaps:
- 558
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGCGCCAGCGCGTGCAAGGACACGGCTGCCTGGTGCCCCGAGGAGGCTGCTGAGCCCCAGGCCATGGTCCC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTCTCGCAGGACGTGGAACCTGGGAGCCACGCCCTCGCTGCGGGGCCTGTGGAGAGTGGGCCGGGCCCCGGAGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCGAGCCGGGGATGGCTCGCCCCGCCCCAGCCCCAGCCAGCCCGGCCGCCCGCCCTTTCCCACACACCGGCCCG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGAGGTTGAGAACTGGGCGTGGAAAAGATACCCCAGTCTGCGGTGACGAGGACTCCAGTGCCCGAAGTGCAGC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TCGCCCAGCCCTAGCTCAGTGCCGAGCCCTTAGCGTGGACTGGGCTGGCCCCGGAAGCCCCCACGGGCTCTACC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 TGACCCTGCAGGTAGAACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAG 444
Query 1 ---------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCG 35
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCG 518
Query 36 GCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGG 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGG 592
Query 110 AGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAG 183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAG 666
Query 184 CTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGA 257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGA 740
Query 258 GAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCC 331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCC 814
Query 332 AGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAG 405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAG 888
Query 406 TCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCA 479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCA 962
Query 480 GCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGG 553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGG 1036
Query 554 CCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCC 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCC 1110
Query 628 AGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCC 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCC 1184
Query 702 GGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGG 775
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGG 1258
Query 776 AGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTG 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTG 1332
Query 850 CGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCG 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCG 1406
Query 924 AGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCG 997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCG 1480
Query 998 ATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTC 1554
Query 1072 TCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAA 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAA 1628
Query 1146 TGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAG 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAG 1702
Query 1220 GTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATC 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATC 1776
Query 1294 ACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGA 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGA 1850
Query 1368 GATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGG 1441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGG 1924
Query 1442 ACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGC 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGC 1998
Query 1516 TCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAA 1589
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TCCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAA 2072
Query 1590 GCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGG 1663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGG 2146
Query 1664 CGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTG 1737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTG 2220
Query 1738 CCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGT 1811
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGT 2294
Query 1812 ACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTG 1885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTG 2368
Query 1886 TGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCG 1959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCG 2442
Query 1960 GCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCC----------------------------------------------- 1986
||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2443 GCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATC 2516
Query 1987 ---------------------------- 1986
Sbjct 2517 CATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC 2544