Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481469
• Subject: NM_001318712.2
• Aligned Length: 2172
• Identities: 1983
• Gaps: 186

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATCAAGGTAGAACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCT  74

Query    1  -------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGC  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGC  148

Query   38  GCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAG  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAG  222

Query  112  AGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCT  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCT  296

Query  186  GAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGA  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGA  370

Query  260  AGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAG  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAG  444

Query  334  TCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTC  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTC  518

Query  408  CCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGC  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGC  592

Query  482  TGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCC  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCC  666

Query  556  CATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG  629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAG  740

Query  630  AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGG  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGG  814

Query  704  CACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAG  777
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAG  888

Query  778  GCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCG  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCG  962

Query  852  CAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAG  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAG  1036

Query  926  TGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGAT  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGAT  1110

Query 1000  GCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTC  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTC  1184

Query 1074  CCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATG  1147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATG  1258

Query 1148  TCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGT  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGT  1332

Query 1222  ATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCAC  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCAC  1406

Query 1296  CGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGA  1369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGA  1480

Query 1370  TCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGAC  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGAC  1554

Query 1444  GACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTC  1517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTC  1628

Query 1518  CCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGC  1591
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGC  1702

Query 1592  TGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCG  1665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCG  1776

Query 1666  CAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCC  1739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCC  1850

Query 1740  CTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTAC  1813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTAC  1924

Query 1814  AGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTG  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTG  1998

Query 1888  GAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGC  1961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGC  2072

Query 1962  TTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCC-------------------------------------------------  1986
            ||||||||||||||||||||||||.                                                 
Sbjct 2073  TTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCA  2146

Query 1987  --------------------------  1986
                                      
Sbjct 2147  TCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC  2172