Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481469
• Subject: NM_001318713.1
• Aligned Length: 2061
• Identities: 1974
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC  74

Query   75  AGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGC  148

Query  149  TGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCT  222

Query  223  GAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCG  296

Query  297  TGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGG  370

Query  371  TGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCT  444

Query  445  ATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGC  518

Query  519  GCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAG  592

Query  593  AGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTA  666

Query  667  GCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAA  740

Query  741  GCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCA  814
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCA  814

Query  815  TCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGC  888

Query  889  CACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGG  962

Query  963  GGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGG  1036

Query 1037  GCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTG  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||
Sbjct 1037  GCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGAC---------GAGGTG  1101

Query 1111  CAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  CAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAA  1175

Query 1185  GACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  GACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGG  1249

Query 1259  TGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGG  1323

Query 1333  GACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  GACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGT  1397

Query 1407  ACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1398  ACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATC  1471

Query 1481  GCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  GCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGC  1545

Query 1555  GTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  GTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGG  1619

Query 1629  CAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620  CAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACG  1693

Query 1703  TCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694  TCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGAT  1767

Query 1777  TCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768  TCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCT  1841

Query 1851  CTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1842  CTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGT  1915

Query 1925  CCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCC------------  1986
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.            
Sbjct 1916  CCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCA  1989

Query 1987  ---------------------------------------------------------------  1986
                                                                           
Sbjct 1990  GCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC  2052