Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481469
• Subject: XM_011523078.1
• Aligned Length: 2082
• Identities: 1983
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC  74
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Sbjct    1  ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCC  74

Query   75  AGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGC  148

Query  149  TGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCT  222

Query  223  GAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCG  296

Query  297  TGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGG  370
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Sbjct  297  TGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGG  370

Query  371  TGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCT  444
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Sbjct  371  TGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCT  444

Query  445  ATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGC  518
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Sbjct  445  ATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGC  518

Query  519  GCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAG  592
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Sbjct  519  GCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAG  592

Query  593  AGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTA  666
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Sbjct  593  AGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTA  666

Query  667  GCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAA  740
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Sbjct  667  GCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAA  740

Query  741  GCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCA  814
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Sbjct  741  GCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCA  814

Query  815  TCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGC  888
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Sbjct  815  TCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGC  888

Query  889  CACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGG  962
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Sbjct  889  CACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGG  962

Query  963  GGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGG  1036
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Sbjct  963  GGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGG  1036

Query 1037  GCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTG  1110
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Sbjct 1037  GCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTG  1110

Query 1111  CAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAA  1184
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Sbjct 1111  CAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAA  1184

Query 1185  GACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGG  1258
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Sbjct 1185  GACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGG  1258

Query 1259  TGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGG  1332
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Sbjct 1259  TGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGG  1332

Query 1333  GACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGT  1406
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Sbjct 1333  GACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGT  1406

Query 1407  ACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATC  1480

Query 1481  GCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGC  1554
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Sbjct 1481  GCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGC  1554

Query 1555  GTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGG  1628
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Sbjct 1555  GTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGG  1628

Query 1629  CAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACG  1702
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Sbjct 1629  CAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACG  1702

Query 1703  TCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGAT  1776
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Sbjct 1703  TCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGAT  1776

Query 1777  TCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCT  1850
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Sbjct 1777  TCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCT  1850

Query 1851  CTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGT  1924
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Sbjct 1851  CTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGT  1924

Query 1925  CCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCC------------  1986
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Sbjct 1925  CCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCA  1998

Query 1987  --------------------------------------------------------------------------  1986
                                                                                      
Sbjct 1999  GCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGGGAAGTCGCGGCC  2072

Query 1987  ----------  1986
                      
Sbjct 2073  ACTGCCTGTG  2082