Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481469
- Subject:
- XM_017023222.1
- Aligned Length:
- 2736
- Identities:
- 1983
- Gaps:
- 750
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAATGTAGAGAATACAGGTGGGCGTCTCTTTGGCAGCAGGAGGTGCTCGAGCTTGTCGGGGCCACCAGGTGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCCCCCATGGTGCTTAGGATGGTGGAGGCCATGTCCCAGCTCCAGGACGAGAAGACCCAGCTACAGGAGGAGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGTGGTCCTACAGGAGAGGCTGGCCCTCCGCGACAGTGACCAGCAGGCCACGTCCACCCAGCTGCAGAACCAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTTGCAGAGGCCTCCCATCCTGGTCCTCCTTGTGCCCCATCTCCTTGCGGTTACCAGGGGCCAGGACCTTCCCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 ACTAGGAGGTGACGTAGATGTGAGTGGAGCAGGAAGGTGCGGGGTGCTTCCCACCCTGAGTCCACCCCATCTTC 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 GACGGTGCCCTGCACTGGGCAGCCTGAGCGGACAAAACTCATCAGATGGTCACCCCACAGGAGATTGGCATGAC 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GTTTCTTGTTCTTTTGATTTCTCGTTAAAGGTGGATGCTAGTTTGAGTGCATGTTGGGGAAGGGATCTCTCAAC 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 CTCTGGAAGCCAGGGAGAGCCAGGGTTCATGCAGGTAGAACACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGG 592
Query 1 --------------------------------------------------------------ATGGTGGAGAAT 12
||||||||||||
Sbjct 593 AAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCTGGGGGGCACCGACTTGGAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAAT 666
Query 13 GAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTG 86
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTG 740
Query 87 CCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGG 160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGG 814
Query 161 AAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTG 234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTG 888
Query 235 CGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGA 308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGA 962
Query 309 GACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCA 382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCA 1036
Query 383 AGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAG 456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAG 1110
Query 457 GTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCAT 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCAT 1184
Query 531 GTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACC 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACC 1258
Query 605 GGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGG 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGG 1332
Query 679 ACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCG 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCG 1406
Query 753 CGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCA 826
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCA 1480
Query 827 ACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTC 1554
Query 901 GTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGA 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGA 1628
Query 975 GGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGT 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGT 1702
Query 1049 CCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTC 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTC 1776
Query 1123 ACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGAT 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGAT 1850
Query 1197 GGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGG 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGG 1924
Query 1271 CGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGG 1344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGG 1998
Query 1345 AAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGAC 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGAC 2072
Query 1419 TGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGT 1492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGT 2146
Query 1493 TCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGC 1566
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCGCTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGC 2220
Query 1567 ACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGC 1640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGC 2294
Query 1641 CGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCC 1714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCC 2368
Query 1715 TGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGT 1788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGT 2442
Query 1789 GACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAA 1862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAA 2516
Query 1863 GTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCC 1936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCC 2590
Query 1937 AGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCC------------------------ 1986
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2591 AGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCT 2664
Query 1987 ------------------------------------------------------------------------ 1986
Sbjct 2665 GGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGGGAAGTCGCGGCCACTGCCTGTG 2736