Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481469
• Subject: XM_017023227.1
• Aligned Length: 2304
• Identities: 1983
• Gaps: 318

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGCTTAGGATGGTGGAGGCCATGTCCCAGCTCCAGGACGAGAAGACCCAGCTACAGGAGGAGCTGGTGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTACAGGAGAGGCTGGCCCTCCGCGACAGTGACCAGCAGGCCACGTCCACCCAGCTGCAGAACCAGGTAGAAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCTGAAGGAGAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCTGAGCTGGGGGGCACCGACTTG  222

Query    1  ---------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCT  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGAAGCACCGGGACCTGCTGATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATGCGGCGCTGTGAGGCCGAGCT  296

Query   54  GCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTG  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGTCCCTGCCCAGGTTGTGAGCACAGCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTG  370

Query  128  ACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAG  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTGTCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAG  444

Query  202  CAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGA  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCTGGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGA  518

Query  276  GCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGT  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGCGGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGT  592

Query  350  ATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAG  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTCAGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAG  666

Query  424  CACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGAACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCA  740

Query  498  GCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGG  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGGAGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGG  814

Query  572  AGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATG  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCCTTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATG  888

Query  646  AAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCAC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTTGCAGCCGGCACTGCGGACCCTCAC  962

Query  720  CAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCA  793
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGGCTTCCCACTGCTGCTGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCA  1036

Query  794  AGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAGCTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAG  1110

Query  868  CTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCG  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAACATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCG  1184

Query  942  GCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCA  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGACTTTCGATGCCGACGACGACTCCA  1258

Query 1016  TCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAG  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAGGTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAG  1332

Query 1090  CAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTA  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGGCTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTA  1406

Query 1164  CGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCC  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGAACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCC  1480

Query 1238  TGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAG  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTACACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAG  1554

Query 1312  ATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGA  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAAACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGA  1628

Query 1386  CGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGT  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGAGCGTGGACGACATCAACAAGGTGT  1702

Query 1460  TTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCACTG  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAGCACAGCTCCCGCTCGCACGCGCTG  1776

Query 1534  CTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTT  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCACGGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTT  1850

Query 1608  GGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGT  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGCGGGAGGCGCAGCACATCAACAAGT  1924

Query 1682  CGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAG  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGCCACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAG  1998

Query 1756  CTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGA  1829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCATGGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGA  2072

Query 1830  GAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGC  1903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGCGCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGC  2146

Query 1904  TACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAG  1977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGGGAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAG  2220

Query 1978  CCCTCGGCC-----------------------------------------------------------------  1986
            ||||||||.                                                                 
Sbjct 2221  CCCTCGGCACGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCCTGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCA  2294

Query 1987  ----------  1986
                      
Sbjct 2295  GCCCTCGGCC  2304