Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481519
• Subject: XM_006521309.3
• Aligned Length: 1008
• Identities: 842
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATG----------GACGGGGAGGA-GCAGCAGCCACCGCACGAGGCCAAC-GTGGAACCTG-TTGT-GCCGTCA  60
            |||          |||||.|.|.| ||..||.||..| ||||     .|| || ||.||.| |.|| |||    
Sbjct    1  ATGAAACTGAAACGACGGCGTGAACGCCCCAACCTTC-CACG-----TACAGT-GACCCAGCTAGTGGCC----  63

Query   61  GAGGCTTCAGAGCCGGTGCCCAGGGTGTACGTGGTGGGGACAGCCCACTTCAGCGACGACAGCAAGAGGGACGT  134
            ||||.|         |.|..|||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct   64  GAGGAT---------GGGAGCAGGGTGTATGTGGTGGGCACTGCTCACTTCAGTGATGATAGCAAGAGAGATGT  128

Query  135  TGTGAAGACCATCCGGGAGGTGCAGCCTGACGTGGTGGTCGTGGAGCTCTGCCAATATCGTGTGTCCATGCTGA  208
            .||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  129  AGTAAAGACTATCCGGGAGGTGCAACCGGATGTGGTCGTGGTGGAGCTCTGTCAGTACCGGGTGTCCATGCTCA  202

Query  209  AGATGGACGAGAGCACGCTGCTGCGGGAGGCCCAGGAGCTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCCGTGAGGCAG  282
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  203  AGATGGACGAGAGGACGCTGCTGCGAGAGGCCAAGGAGGTCAGCCTGGAGAAGCTGCAGCAGGCTGTCAGGCAG  276

Query  283  AACGGGCTCATGTCGGGGCTGATGCAGATGCTGCTGCTGAAGGTGTCTGCACACATCACCGAGCAGCTGGGCAT  356
            ||.|||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  277  AATGGGCTTATGTCTGGACTCATGCAGATGTTGCTGCTGAAGGTGTCTGCTCACATCACTGAGCAGCTGGGCAT  350

Query  357  GGCCCCAGGTGGCGAGTTCAGGGAGGCCTTCAAGGAGGCCAGCAAGGTGCCTTTCTGCAAGTTCCACCTGGGTG  430
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  351  GGCCCCTGGTGGCGAGTTCAGGGAGGCCTTCAAAGAGGCCAGCAAGGTACCATTCTGCAAATTCCACCTGGGTG  424

Query  431  ACCGACCCATCCCCGTCACCTTCAAGAGGGCCATCGCAGCGCTCTCCTTCTGGCAGAAGGTCAGGCTGGCTTGG  504
            |||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||.||||||.|||
Sbjct  425  ACCGACCAATCCCAGTCACCTTTAAGAGGGCCATTGCTGCACTCTCCTTCTGGCAGAAAGTCAAGCTGGCCTGG  498

Query  505  GGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCCATCAGCAAGGATGACGTGGAACGCTGCAAGCAGAAGGACCTACTGGAGCA  578
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct  499  GGCCTGTGCTTCCTGTCAGACCCAATCAGCAAAGACGACGTGGAGCGCTGCAAACAGAAGGACCTGTTGGAGCA  572

Query  579  GATGATGGCCGAGATGATTGGCGAGTTCCCAGACCTGCACCGCACCATCGTCTCGGAGCGCGACGTCTACCTAA  652
            |||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct  573  GATGATGGCCGAGATGATTGGGGAGTTTCCTGACCTGCATCGCACCATTGTCTCAGAGCGTGACGTCTATCTGA  646

Query  653  CCTACATGCTGCGCCAGGCCGCGCGGCGCCTCGAGCTGCCTCGGGCCTCTGACGCCGAGCCCAGGAAGTGCGTC  726
            ||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  647  CCTATATGCTGCGGCAGGCCGCACGGCGCCTTGAGCTTCCCCGCGCCTCTGATGCTGAGCCCAGGAAGTGTGTC  720

Query  727  CCCTCCGTGGTCGTGGGCGTCGTGGGCATGGGCCACGTGCCTGGCATCGAGAAGAACTGGAGCACCGACCTCAA  800
            ||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  721  CCGTCTGTGGTTGTGGGCGTCGTTGGCATGGGGCATGTGCCTGGCATTGAGAAGAACTGGAGTACCGACCTCAA  794

Query  801  CATCCAGGAGATCATGACCGTGCCCCCGCCGTCCGTCTCCGGCAGAGTGTCTCGGTTGGCCGTGAAGGCCGCCT  874
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||.||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||.||||
Sbjct  795  CATCCAGGAGATCATGACAGTCCCCCCACCGTCCATCTCAGGCAGAGTGTCCCGGGTGGCTGTGAAGGCGGCCT  868

Query  875  TCTTCGGCCTGCTGGGCTACAGCCTGTACTGGATGGGCCGCCGCACCGCGAGCCTGGTCCTGTCGCTGCCCGCC  948
            ||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||..||.||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  869  TCTTTGGTCTCCTGGGCTATAGCCTGTACTGGATGGGCCGTCGGACCCTGAACCTGGTCCTGTCACTGCCTGCT  942

Query  949  GCGCAGTACTGCCTGCAGAGGGTGACCGAGGCCCGGCACAAG----  990
            ||.||||.||||||.||||||||||.|||.||||||| ||.|    
Sbjct  943  GCACAGTTCTGCCTCCAGAGGGTGAGCGAAGCCCGGC-CAGGCCGG  987