Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481572
• Subject: NM_001079844.2
• Aligned Length: 1701
• Identities: 1479
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||.||||..|||||||||||..|||||||.||||.||||||.||
Sbjct    1  ATGCCTTCTTGGATCCGGGCTGTGATTCTTCCTCTCTCCGGGCTGCTGCTGACCCTCCCGGCCGCGGCGGACGT  74

Query   75  GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC  148
            ||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGGCTCGGAGCTGCAGCGAGGTCCGTCAGGCTTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC  148

Query  149  AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG  222
            ||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAGATCGCAGGGGAGCACTTACGCATCTGCCCTCAGGAATATACCTGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG  222

Query  223  TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT  296
            .|.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct  223  CTGAGTCAACAGAGTAAACTGGAGTTTGAAAACCTTGTAGAAGAGACAAGCCACTTTGTGAGGACCACGTTTGT  296

Query  297  GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT  370
            |||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GTCGAGGCACAAGAAATTTGATGAGTTTTTCCGAGAGCTGCTGGAAAACGCAGAAAAGTCCCTAAATGACATGT  370

Query  371  TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG  444
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct  371  TTGTCCGGACCTACGGGATGCTGTACATGCAGAATTCAGAGGTATTCCAGGACCTCTTCACTGAGCTAAAGCGG  444

Query  445  TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT  518
            ||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  445  TACTACACAGGGGGTAACGTCAACCTGGAAGAGATGCTCAATGACTTCTGGGCTCGGCTCCTGGAGAGGATGTT  518

Query  519  TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA  592
            .||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  519  CCAGCTGATTAACCCTCAGTATCACTTCAGCGAGGACTACCTGGAGTGTGTAAGCAAGTACACAGACCAGCTGA  592

Query  593  AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||..|.|||||||||
Sbjct  593  AGCCATTTGGAGACGTGCCACGGAAACTGAAGATTCAGGTCACCCGCGCCTTCATCGCGGCTCGCACCTTTGTC  666

Query  667  CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC  740
            |||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct  667  CAGGGCCTGACAGTGGGCAGAGAGGTTGCCAACCGAGTTTCCAAGGTGAGCCCCACCCCTGGCTGCATCCGGGC  740

Query  741  CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTT-CCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTC  813
            .||||||||||||||||||||||||||||| |.|.||||| |||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  741  TCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTG-CCGAGGCTTGCCCACTGTGAGACCTTGCAACAACTACTGCCTC  813

Query  814  AACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCT  887
            ||||||||||||||||||.||||.||||||||.||..|.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  814  AACGTCATGAAGGGCTGCCTGGCCAATCAGGCAGATTTGGACACTGAGTGGAATCTCTTCATAGATGCAATGCT  887

Query  888  CTTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTG  961
            |||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  888  CTTGGTGGCTGAGCGACTGGAAGGGCCATTCAACATTGAGTCAGTCATGGACCCAATAGACGTCAAGATCTCTG  961

Query  962  AAGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAA  1035
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  962  AAGCCATTATGAACATGCAGGAAAACAGCATGCAGGTGTCAGCAAAGGTCTTTCAGGGCTGTGGCCAGCCCAAA  1035

Query 1036  CCTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGA  1109
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.|||||
Sbjct 1036  CCTGCTCCCGCTCTCAGATCTGCTCGCTCAGCTCCAGAAAATTTTAACACCCGTTTTCGGCCCTACAACCCTGA  1109

Query 1110  GGAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTG------------------------------G  1153
            |||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||                              |
Sbjct 1110  GGAAAGACCCACAACTGCAGCGGGCACGAGCTTGGACCGGCTGAGGACTGTGTGGAGGACCATGCAGCACAGTG  1183

Query 1154  TCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTCTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGAC  1227
            |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1184  TCACAGACATAAAAGAGAAGCTGAAGCTCTCTAAAAAGGTCTGGTCAGCATTGCCCTACACCATCTGCAAGGAC  1257

Query 1228  GAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGGAGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGA  1301
            ||..|.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1258  GAACGTGTGACAGCAGGAACCTCCAACGAGGAGGAGTGCTGGAACGGACACAGCAAAGCCAGATACCTGCCTGA  1331

Query 1302  GATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATCAACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTT  1375
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1332  GATCATGAACGATGGGCTGACCAACCAAATCAACAATCCTGAGGTGGAGGTGGACATCACGCGGCCAGACACTT  1405

Query 1376  TCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGTGATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTC  1449
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1406  TCATCAGACAGCAGATCATGGCTCTCCGTGTGATGACCAACAAACTGAAGAATGCGTACAATGGCAATGACGTC  1479

Query 1450  AATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTGGCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCAC  1523
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480  AACTTCCAAGACACAAGCGATGAATCCAGTGGCTCAGGCAGCGGCAGTGGTTGCATGGATGATGTGTGTCCCAC  1553

Query 1524  GGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCCGCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGC-----  1592
            ||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|.|||.|||||.||     
Sbjct 1554  GGAGTTCGAGTTTGTCACCACCGAGGCCCCGGCGGTGGACCCGGACCGCAGAGAAGAGGAATCTTCGGCCTCGA  1627

Query 1593  AGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCTCACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA  1665
            ||..||     ||..||||.||.|.|||||||||||...||||||.|||.||||.|||||||||||.|.||||
Sbjct 1628  AGTTCA-----GCTCCTCCTTGATTTCCTGGTCTCTGGTCTGCATGGTCTTGGCCCTGCAGAGACTCTACAGA  1695