Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481572
• Subject: XM_011521044.2
• Aligned Length: 1665
• Identities: 1455
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGCCTTCTTGGATCGGGGCTGTGATTCTTCCCCTCTTGGGGCTGCTGCTCTCCCTCCCCGCCGGGGCGGATGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGGCTCGGAGCTGCGGAGAGGTCCGCCAGGCGTACGGTGCCAAGGGATTCAGCCTGGCGGACATCCCCTACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAGATCGCAGGGGAACACTTAAGAATCTGTCCTCAGGAATATACATGCTGCACCACAGAAATGGAAGACAAG  222
                                                                          ||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGGAAGACAAG  12

Query  223  TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  TTAAGCCAACAAAGCAAACTCGAATTTGAAAACCTTGTGGAAGAGACAAGCCATTTTGTGCGCACCACTTTTGT  86

Query  297  GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  GTCCAGGCATAAGAAATTTGACGAATTTTTCCGAGAGCTCCTGGAGAATGCAGAAAAGTCACTAAATGATATGT  160

Query  371  TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  TTGTACGGACCTATGGCATGCTGTACATGCAGAATTCAGAAGTCTTCCAGGACCTCTTCACAGAGCTGAAAAGG  234

Query  445  TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  TACTACACTGGGGGTAATGTGAATCTGGAGGAAATGCTCAATGACTTTTGGGCTCGGCTCCTGGAACGGATGTT  308

Query  519  TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  TCAGCTGATAAACCCTCAGTATCACTTCAGTGAAGACTACCTGGAATGTGTGAGCAAATACACTGACCAGCTCA  382

Query  593  AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  AGCCATTTGGAGACGTGCCCCGGAAACTGAAGATTCAGGTTACCCGCGCCTTCATTGCTGCCAGGACCTTTGTC  456

Query  667  CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  CAGGGGCTGACTGTGGGCAGAGAAGTTGCAAACCGAGTTTCCAAGGTCAGCCCAACCCCAGGGTGTATCCGTGC  530

Query  741  CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  CCTCATGAAGATGCTGTACTGCCCATACTGTCGGGGGCTTCCCACTGTGAGGCCCTGCAACAACTACTGTCTCA  604

Query  815  ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  ACGTCATGAAGGGCTGCTTGGCAAATCAGGCTGACCTCGACACAGAGTGGAATCTGTTTATAGATGCAATGCTC  678

Query  889  TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  TTGGTGGCAGAGCGACTGGAGGGGCCATTCAACATTGAGTCGGTCATGGACCCGATAGATGTCAAGATTTCTGA  752

Query  963  AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  AGCCATTATGAACATGCAAGAAAACAGCATGCAGGTGTCTGCAAAGGTCTTTCAGGGATGTGGTCAGCCCAAAC  826

Query 1037  CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  CTGCTCCAGCCCTCAGATCTGCCCGCTCAGCTCCTGAAAATTTTAATACACGTTTCAGGCCCTACAATCCTGAG  900

Query 1111  GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  GAAAGACCAACAACTGCTGCAGGCACAAGCTTGGACCGGCTGGTCACAGACATAAAAGAGAAATTGAAGCTCTC  974

Query 1185  TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  975  TAAAAAGGTCTGGTCAGCATTACCCTACACTATCTGCAAGGACGAGAGCGTGACAGCGGGCACGTCCAACGAGG  1048

Query 1259  AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1049  AGGAATGCTGGAACGGGCACAGCAAAGCCAGATACTTGCCTGAGATCATGAATGATGGGCTCACCAACCAGATC  1122

Query 1333  AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1123  AACAATCCCGAGGTGGATGTGGACATCACTCGGCCTGACACTTTCATCAGACAGCAGATTATGGCTCTCCGTGT  1196

Query 1407  GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1197  GATGACCAACAAACTAAAAAACGCCTACAATGGCAATGATGTCAATTTCCAGGACACAAGTGATGAATCCAGTG  1270

Query 1481  GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1271  GCTCAGGGAGTGGCAGTGGGTGCATGGATGACGTGTGTCCCACGGAGTTTGAGTTTGTCACCACAGAGGCCCCC  1344

Query 1555  GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1345  GCAGTGGATCCCGACCGGAGAGAGGTGGACTCTTCTGCAGCCCAGCGTGGCCACTCCCTGCTCTCCTGGTCTCT  1418

Query 1629  CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA  1665
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1419  CACCTGCATTGTCCTGGCACTGCAGAGACTGTGCAGA  1455