Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481578
• Subject: NM_002908.4
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1761
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCCGGTGCGTATAACCCGTATATAGAGATAATTGAACAACCCAGGCAGAGGGGAATGCGTTTTAGATA  74

Query   75  CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAATGTGAAGGGCGATCAGCAGGCAGCATTCCAGGGGAGCACAGCACAGACAACAACCGAACATACCCTTCTA  148

Query  149  TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCAGATTATGAACTATTATGGAAAAGGAAAAGTGAGAATTACATTAGTAACAAAGAATGACCCATATAAACCT  222

Query  223  CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATCCTCATGATTTAGTTGGAAAAGACTGCAGAGACGGCTACTATGAAGCAGAATTTGGACAAGAACGCAGACC  296

Query  297  TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTGTTTTTCCAAAATTTGGGTATTCGATGTGTGAAGAAAAAAGAAGTAAAAGAAGCTATTATTACAAGAATAA  370

Query  371  AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGCAGGAATCAATCCATTCAATGTCCCTGAAAAACAGCTGAATGATATTGAAGATTGTGACCTCAATGTGGTG  444

Query  445  AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGACTGTGTTTTCAAGTTTTTCTCCCTGATGAACATGGTAATTTGACGACTGCTCTTCCTCCTGTTGTCTCGAA  518

Query  519  CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAATTTATGACAACCGTGCTCCAAATACTGCAGAATTAAGGATTTGTCGTGTAAACAAGAATTGTGGAAGTG  592

Query  593  TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGAGGAGGAGATGAAATATTTCTACTTTGTGACAAAGTTCAGAAAGATGACATAGAAGTTCGTTTTGTGTTG  666

Query  667  AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACGATTGGGAAGCAAAAGGCATCTTTTCACAAGCTGATGTACACCGTCAAGTAGCCATTGTTTTCAAAACTCC  740

Query  741  ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCATATTGCAAAGCTATCACAGAACCCGTAACAGTAAAAATGCAGTTGCGGAGACCTTCTGACCAGGAAGTTA  814

Query  815  GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGAATCTATGGATTTTAGATATCTGCCAGATGAAAAAGATACTTACGGCAATAAAGCAAAGAAACAAAAGACA  888

Query  889  ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCAC-----------------------------------------  921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  889  ACTCTGCTTTTCCAGAAACTGTGCCAGGATCACGTAGAAACAGGGTTTCGCCATGTTGACCAGGATGGTCTTGA  962

Query  922  -------------------------------------------------------GTTAATTTTCCTGAGAGAC  940
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACTCCTGACATCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGTTAATTTTCCTGAGAGAC  1036

Query  941  CAAGACCTGGTCTCCTCGGTTCAATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGAT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAGACCTGGTCTCCTCGGTTCAATTGGAGAAGGAAGATACTTCAAAAAAGAACCAAACTTGTTTTCTCATGAT  1110

Query 1015  GCAGTTGTGAGAGAAATGCCTACAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTC  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGTTGTGAGAGAAATGCCTACAGGGGTTTCAAGTCAAGCAGAATCCTACTATCCCTCACCTGGGCCCATCTC  1184

Query 1089  AAGTGGATTGTCACATCATGCCTCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCC  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTGGATTGTCACATCATGCCTCAATGGCACCTCTGCCTTCTTCAAGCTGGTCATCAGTGGCCCACCCCACCC  1258

Query 1163  CACGCTCAGGCAATACAAACCCACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCA  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACGCTCAGGCAATACAAACCCACTGAGTAGTTTTTCAACAAGGACACTTCCTTCTAATTCGCAAGGTATCCCA  1332

Query 1237  CCATTCCTGAGAATACCTGTTGGGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACAT  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCATTCCTGAGAATACCTGTTGGGAATGATTTAAATGCTTCTAATGCTTGCATTTACAACAATGCCGATGACAT  1406

Query 1311  AGTCGGAATGGAAGCGTCATCCATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATT  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTCGGAATGGAAGCGTCATCCATGCCATCAGCAGATTTATATGGTATTTCTGATCCCAACATGCTGTCTAATT  1480

Query 1385  GTTCTGTGAATATGATGACAACCAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAAT  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTCTGTGAATATGATGACAACCAGCAGTGACAGCATGGGAGAGACTGATAATCCAAGACTTCTGAGCATGAAT  1554

Query 1459  CTTGAAAACCCCTCATGTAATTCAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAG  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTTGAAAACCCCTCATGTAATTCAGTGTTAGACCCAAGAGACTTGAGACAGCTCCATCAGATGTCCTCTTCCAG  1628

Query 1533  TATGTCAGCAGGCGCCAATTCCAATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCA  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TATGTCAGCAGGCGCCAATTCCAATACTACTGTTTTTGTTTCACAATCAGATGCATTTGAGGGATCTGACTTCA  1702

Query 1607  GTTGTGCAGATAACAGCATGATAAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTT  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTGTGCAGATAACAGCATGATAAATGAGTCGGGACCATCAAACAGTACTAATCCAAACAGTCATGGTTTTGTT  1776

Query 1681  CAAGATAGTCAGTATTCAGGTATTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTT  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAAGATAGTCAGTATTCAGGTATTGGCAGTATGCAAAATGAGCAATTGAGTGACTCCTTTCCATATGAATTTTT  1850

Query 1755  TCAAGTA  1761
            |||||||
Sbjct 1851  TCAAGTA  1857