Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481585
• Subject: XM_024453666.1
• Aligned Length: 1884
• Identities: 1785
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGAAGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGAAGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTG  74

Query   75  TCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTGATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTGATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGG  148

Query  149  AGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGCCTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGCCTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAA  222

Query  223  TCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATTTCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATTTCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACG  296

Query  297  TCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCAAGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCAAGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAA  370

Query  371  AGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTATAAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTATAAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAA  444

Query  445  TGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAACACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAACACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTT  518

Query  519  CCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGAAAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGAAAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTG  592

Query  593  GAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATGCTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATGCTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCA  666

Query  667  GAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGAATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGAATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCA  740

Query  741  GTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATGCTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATGCTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTC  814

Query  815  AGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGTGGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGTGGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCA  888

Query  889  CTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAAGGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAAGGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAA  962

Query  963  GAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAGCAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAGCAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTG  1036

Query 1037  TCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAAAAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAAAAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTA  1110

Query 1111  CATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAGAAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAGAAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAA  1184

Query 1185  ACCAGCAAAGGTCCTTTCCAGTCTCAGAAAAAGAACTTATTCCACAAAATTGTCAGCAAATATAAGCACAAAAA  1258
            ||||||                                                                    
Sbjct 1185  ACCAGC--------------------------------------------------------------------  1190

Query 1259  GGAGAAGCCCAATGTTCCGGAAAAAGGAAGTGGGGATAAATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTC  1332
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191  ----------------------AAAGGAAGTGGGGATAAATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTC  1242

Query 1333  ACCCTACAGAAGCCATATTTTCAGAAGACAGAAACACCATGGAGCCTGTTCATAAGGTTAAAAATATCCCATCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  ACCCTACAGAAGCCATATTTTCAGAAGACAGAAACACCATGGAGCCTGTTCATAAGGTTAAAAATATCCCATCC  1316

Query 1407  ATTTTCAACACTCCAGAGCCAACAACAACGCAAGAACCTTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  ATTTTCAACACTCCAGAGCCAACAACAACGCAAGAACCTTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAAC  1390

Query 1481  CAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGGTATCACCAGCAGGAGGTACTTTGGATGACAAACCAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||
Sbjct 1391  CAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGGTATCACCAGCAGGA---------GATGACAAACCAA  1455

Query 1555  AGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAGACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456  AGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAGACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAG  1529

Query 1629  GTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGCCGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530  GTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGCCGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGA  1603

Query 1703  AGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGTCAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1604  AGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGTCAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAA  1677

Query 1777  TGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAGTGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678  TGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAGTGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTAC  1751

Query 1851  CTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC  1884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752  CTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC  1785