Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481594
• Subject: XM_006716073.4
• Aligned Length: 2340
• Identities: 2243
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAAATTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCTGACCACAATGGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCAAGTGGAGATCCTGAGGAAATTCATCCAGAGGGTCCAGGCCATGAAGAGTCCTGACCACAATGGGGA  74

Query   75  GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGGTTAAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATATATCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACAACTTCGCCCGGGACTTCATGCGGTTAAGAAGATTGTCTACCAAATATAGAACAGAAAAGATATATCCCA  148

Query  149  CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCCACTGGAGAAAAAGAAGAAAATGTTAAAAAGAACAGATACAAGGACATACTGCCATTTGATCACAGCCGA  222

Query  223  GTTAAATTGACATTAAAGACTCCTTCACAAGATTCAGACTATATCAATGCAAATTTTATAAAGGGCGTCTATGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  223  GTTAAATTGACATTAAAGACTCCTTCACAAGATTCAGACTATATCAATGCAAATTTTATAAA------------  284

Query  297  GCCAAAAGCATATGTAGCAACTCAAGGACCTTTAGCAAATACAGTAATAGATTTTTGGAGGATGATATGGGAGT  370
                                                                                      
Sbjct  285  --------------------------------------------------------------------------  284

Query  371  ATAATGTTGTGATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT  444
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  ----------GATCATTGTAATGGCCTGCCGAGAATTTGAGATGGGAAGGAAAAAATGTGAGCGCTATTGGCCT  348

Query  445  TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  TTGTATGGAGAAGACCCCATAACGTTTGCACCATTTAAAATTTCTTGTGAGGATGAACAAGCAAGAACAGACTA  422

Query  519  CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  CTTCATCAGGACACTCTTACTTGAATTTCAAAATGAATCTCGTAGGCTGTATCAGTTTCATTATGTGAACTGGC  496

Query  593  CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  CAGACCATGATGTTCCTTCATCATTTGATTCTATTCTGGACATGATAAGCTTAATGAGGAAATATCAAGAACAT  570

Query  667  GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  GAAGATGTTCCTATTTGTATTCATTGCAGTGCAGGCTGTGGAAGAACAGGTGCCATTTGTGCCATAGATTATAC  644

Query  741  GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  GTGGAATTTACTAAAAGCTGGGAAAATACCAGAGGAATTTAATGTATTTAATTTAATACAAGAAATGAGAACAC  718

Query  815  AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AAAGGCATTCTGCAGTACAAACAAAGGAGCAATATGAACTTGTTCATAGAGCTATTGCCCAACTGTTTGAAAAA  792

Query  889  CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  CAGCTACAACTATATGAAATTCATGGAGCTCAGAAAATTGCTGATGGAGTGAATGAAATTAACACTGAAAACAT  866

Query  963  GATCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG  1036
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GGTCAGCTCCATAGAGCCTGAAAAACAAGATTCTCCTCCTCCAAAACCACCAAGGACCCGCAGTTGCCTTGTTG  940

Query 1037  AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  AAGGGGATGCTAAAGAAGAAATACTGCAGCCACCGGAACCTCATCCAGTGCCACCCATCTTGACACCTTCTCCC  1014

Query 1111  CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CCTTCAGCTTTTCCAACAGTCACTACTGTGTGGCAGGACAATGATAGATACCATCCAAAGCCAGTGTTGCATAT  1088

Query 1185  GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGTTTCATCAGAACAACATTCAGCAGACCTCAACAGAAACTATAGTAAATCAACAGAACTTCCAGGGAAAAATG  1162

Query 1259  AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AATCAACAATTGAACAGATAGATAAAAAATTGGAACGAAATTTAAGTTTTGAGATTAAGAAGGTCCCTCTCCAA  1236

Query 1333  GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GAGGGACCAAAAAGTTTTGATGGGAACACACTTTTGAATAGGGGACATGCAATTAAAATTAAATCTGCTTCACC  1310

Query 1407  TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  TTGTATAGCTGATAAAATCTCTAAGCCACAGGAATTAAGTTCAGATCTAAATGTCGGTGATACTTCCCAGAATT  1384

Query 1481  CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  CTTGTGTGGACTGCAGTGTAACACAATCAAACAAAGTTTCAGTTACTCCACCAGAAGAATCCCAGAATTCAGAC  1458

Query 1555  ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  ACACCTCCAAGGCCAGACCGCTTGCCTCTTGATGAGAAAGGACATGTAACGTGGTCATTTCATGGACCTGAAAA  1532

Query 1629  TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  TGCCATACCCATACCTGATTTATCTGAAGGCAATTCCTCAGATATCAACTATCAAACTAGGAAAACTGTGAGTT  1606

Query 1703  TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  TAACACCAAGTCCTACAACACAAGTTGAAACACCTGATCTTGTGGATCATGATAACACTTCACCACTCTTCAGA  1680

Query 1777  ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  ACACCCCTCAGTTTTACTAATCCACTTCACTCTGATGACTCAGACTCAGATGAAAGAAACTCTGATGGTGCTGT  1754

Query 1851  GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  GACCCAGAATAAAACTAATATTTCAACAGCAAGTGCCACAGTTTCTGCTGCCACTAGTACTGAAAGCATTTCTA  1828

Query 1925  CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829  CTAGGAAAGTATTGCCAATGTCCATTGCTAGACATAATATAGCAGGAACAACACATTCAGGTGCTGAAAAAGAT  1902

Query 1999  GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903  GTTGATGTTAGTGAAGATTCACCTCCTCCCCTACCTGAAAGAACTCCTGAATCGTTTGTGTTAGCAAGTGAACA  1976

Query 2073  TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977  TAATACACCTGTAAGATCGGAATGGAGTGAACTTCAAAGTCAGGAACGATCTGAACAAAAAAAGTCTGAAGGCT  2050

Query 2147  TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051  TGATAACCTCTGAAAATGAGAAATGTGATCATCCAGCGGGAGGTATTCACTATGAAATGTGCATAGAATGTCCA  2124

Query 2221  CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125  CCTACTTTCAGTGACAAGAGAGAACAAATATCAGAAAATCCAACAGAAGCCACAGATATTGGTTTTGGTAATCG  2198

Query 2295  ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA  2340
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199  ATGTGGAAAACCCAAAGGACCAAGAGATCCACCTTCAGAATGGACA  2244