Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000481598
Subject:
NM_014230.4
Aligned Length:
1881
Identities:
1788
Gaps:
93

Alignment

Query    1  ATGGCTGCTGAGAAGCAGGTCCCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCTGAGAAGCAGGTCCCAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCGGCGGCGGTGGCAGTGGCGGCGG  74

Query   75  CGGTAGCGGCGGTGGACGTGGTGCCGGAGGGGAAGAAAATAAAGAAAACGAACGCCCTTCGGCCGGATCGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTAGCGGCGGTGGACGTGGTGCCGGAGGGGAAGAAAATAAAGAAAACGAACGCCCTTCGGCCGGATCGAAGG  148

Query  149  CAAACAAAGAATTTGGGGATAGCCTGAGTTTGGAGATTCTTCAGATTATTAAGGAATCCCAGCAGCAGCATGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAACAAAGAATTTGGGGATAGCCTGAGTTTGGAGATTCTTCAGATTATTAAGGAATCCCAGCAGCAGCATGGT  222

Query  223  TTACGGCATGGAGATTTTCAGAGGTACAGGGGCTACTGTTCCCGTAGACAAAGACGTCTTCGAAAAACACTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTACGGCATGGAGATTTTCAGAGGTACAGGGGCTACTGTTCCCGTAGACAAAGACGTCTTCGAAAAACACTCAA  296

Query  297  CTTCAAGATGGGTAACAGACACAAATTCACAGGGAAGAAAGTGACTGAAGAGCTTCTGACCGATAATAGATACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCAAGATGGGTAACAGACACAAATTCACAGGGAAGAAAGTGACTGAAGAGCTTCTGACCGATAATAGATACT  370

Query  371  TGCTTCTGGTTCTGATGGATGCTGAAAGAGCCTGGAGCTACGCCATGCAGCTGAAACAGGAAGCCAACACTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCTTCTGGTTCTGATGGATGCTGAAAGAGCCTGGAGCTACGCCATGCAGCTGAAACAGGAAGCCAACACTGAA  444

Query  445  CCCCGAAAACGGTTTCACTTGTTATCTCGCCTACGCAAAGCCGTGAAGCATGCAGAGGAATTGGAACGCTTGTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCCGAAAACGGTTTCACTTGTTATCTCGCCTACGCAAAGCCGTGAAGCATGCAGAGGAATTGGAACGCTTGTG  518

Query  519  TGAGAGCAATCGCGTGGATGCCAAGACCAAATTAGAGGCTCAGGCTTACACAGCTTACCTCTCAGGAATGCTAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGAGCAATCGCGTGGATGCCAAGACCAAATTAGAGGCTCAGGCTTACACAGCTTACCTCTCAGGAATGCTAC  592

Query  593  GTTTTGAACATCAAGAATGGAAAGCTGCCATTGAGGCTTTTAACAAATGCAAAACTATCTATGAGAAGCTAGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTTTGAACATCAAGAATGGAAAGCTGCCATTGAGGCTTTTAACAAATGCAAAACTATCTATGAGAAGCTAGCC  666

Query  667  AGTGCTTTCACAGAGGAGCAGGCTGTGCTGTATAACCAACGTGTGGAAGAGATTTCACCCAACATCCGCTATTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTGCTTTCACAGAGGAGCAGGCTGTGCTGTATAACCAACGTGTGGAAGAGATTTCACCCAACATCCGCTATTG  740

Query  741  TGCATATAATATTGGGGACCAGTC--------------------------------------------------  764
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct  741  TGCATATAATATTGGGGACCAGTCAGCCATCAATGAACTCATGCAGATGAGATTGAGGTCTGGGGGCACTGAGG  814

Query  765  -------------------------------------------AGCCAAACAGGCAGCTACCATGAGTGAAGTG  795
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCTCTTGGCTGAAAAATTGGAGGCTTTGATCACTCAGACTCGAGCCAAACAGGCAGCTACCATGAGTGAAGTG  888

Query  796  GAGTGGAGAGGGAGAACGGTTCCAGTGAAGATTGACAAAGTGCGCATTTTCTTATTAGGACTGGCTGATAACGA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTGGAGAGGGAGAACGGTTCCAGTGAAGATTGACAAAGTGCGCATTTTCTTATTAGGACTGGCTGATAACGA  962

Query  870  AGCAGCTATTGTCCAGGCTGAAAGCGAAGAAACTAAGGAGCGCCTGTTTGAATCAATGCTCAGCGAGTGTCGGG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGCTATTGTCCAGGCTGAAAGCGAAGAAACTAAGGAGCGCCTGTTTGAATCAATGCTCAGCGAGTGTCGGG  1036

Query  944  ACGCCATCCAGGTGGTTCGGGAGGAGCTCAAGCCAGATCAGAAACAGAGAGATTATATCCTTGAAGGAGAGCCA  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCCATCCAGGTGGTTCGGGAGGAGCTCAAGCCAGATCAGAAACAGAGAGATTATATCCTTGAAGGAGAGCCA  1110

Query 1018  GGGAAGGTGTCTAATCTTCAATACTTGCATAGCTACCTGACTTACATCAAGCTATCAACGGCAATCAAGCGTAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGAAGGTGTCTAATCTTCAATACTTGCATAGCTACCTGACTTACATCAAGCTATCAACGGCAATCAAGCGTAA  1184

Query 1092  TGAGAACATGGCCAAAGGTCTGCAGAGGGCTCTGCTGCAGCAGCAGCCAGAGGATGACAGCAAGCGCTCACCCC  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGAACATGGCCAAAGGTCTGCAGAGGGCTCTGCTGCAGCAGCAGCCAGAGGATGACAGCAAGCGCTCACCCC  1258

Query 1166  GGCCCCAGGACCTGATCCGACTCTATGACATCATCTTACAGAATCTGGTGGAATTGCTCCAGCTTCCTGGTTTA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGCCCCAGGACCTGATCCGACTCTATGACATCATCTTACAGAATCTGGTGGAATTGCTCCAGCTTCCTGGTTTA  1332

Query 1240  GAGGAAGACAAAGCCTTCCAGAAAGAGATAGGCCTCAAGACTCTGGTGTTCAAAGCTTACAGGTGTTTTTTCAT  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGAAGACAAAGCCTTCCAGAAAGAGATAGGCCTCAAGACTCTGGTGTTCAAAGCTTACAGGTGTTTTTTCAT  1406

Query 1314  TGCTCAGTCCTATGTGCTGGTGAAGAAGTGGAGCGAAGCCCTTGTCCTGTATGACAGAGTCCTGAAATATGCAA  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCTCAGTCCTATGTGCTGGTGAAGAAGTGGAGCGAAGCCCTTGTCCTGTATGACAGAGTCCTGAAATATGCAA  1480

Query 1388  ATGAAGTAAATTCTGATGCTGGCGCCTTCAAGAACAGCCTAAAGGACCTGCCTGATGTGCAAGAGCTCATCACT  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGAAGTAAATTCTGATGCTGGCGCCTTCAAGAACAGCCTAAAGGACCTGCCTGATGTGCAAGAGCTCATCACT  1554

Query 1462  CAAGTGCGGTCAGAGAAGTGCTCCCTGCAGGCCGCAGCCATCCTTGATGCAAACGACGCTCATCAAACAGAGAC  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAAGTGCGGTCAGAGAAGTGCTCCCTGCAGGCCGCAGCCATCCTTGATGCAAACGACGCTCATCAAACAGAGAC  1628

Query 1536  CTCCTCCTCCCAAGTCAAGGACAATAAGCCTCTGGTTGAACGGTTTGAGACATTCTGCCTGGACCCTTCCCTTG  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTCCTCCTCCCAAGTCAAGGACAATAAGCCTCTGGTTGAACGGTTTGAGACATTCTGCCTGGACCCTTCCCTTG  1702

Query 1610  TCACCAAGCAAGCCAACCTTGTGCACTTCCCACCAGGCTTCCAGCCCATTCCCTGCAAGCCTTTGTTCTTTGAC  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCACCAAGCAAGCCAACCTTGTGCACTTCCCACCAGGCTTCCAGCCCATTCCCTGCAAGCCTTTGTTCTTTGAC  1776

Query 1684  CTGGCCCTCAACCATGTGGCTTTCCCACCCCTTGAGGACAAGTTGGAACAGAAGACCAAGAGTGGCCTCACTGG  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGCCCTCAACCATGTGGCTTTCCCACCCCTTGAGGACAAGTTGGAACAGAAGACCAAGAGTGGCCTCACTGG  1850

Query 1758  ATACATCAAGGGCATCTTTGGATTCAGGAGC  1788
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ATACATCAAGGGCATCTTTGGATTCAGGAGC  1881