Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481639
• Subject: NM_012300.2
• Aligned Length: 1634
• Identities: 1563
• Gaps: 55

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAG-----------TTATGG--  61
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ..|||.|           ||.|||  
Sbjct    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATG---TGTTCTGTGCCAAGGTCTTTGTGGCT  71

Query   62  AAGAT----CAAAAT-GAAGA--------------TGAG--------------TCCCCAAAGAAAAAT-ACTCT  101
            |.|.|    |||..| |.|||              ||||              |.||||..|..|.|| .||| 
Sbjct   72  AGGCTGCGCCAACCTGGTAGAGAGCATGTGCGCACTGAGTTGCCTGCAGAGCATGCCCAGTGTCAGATGTCTC-  144

Query  102  TTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAG  175
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  ----CAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAG  214

Query  176  AAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATT  249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  AAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATT  288

Query  250  TCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTAC  323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  TCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTAC  362

Query  324  CGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTG  397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  CGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTG  436

Query  398  CAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGA  471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  CAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGA  510

Query  472  ATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAG  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  ATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAG  584

Query  546  ACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAG  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  ACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAG  658

Query  620  AATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTAC  693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  AATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTAC  732

Query  694  TGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAG  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  TGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAG  806

Query  768  CCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTG  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTG  880

Query  842  TAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCAC  915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  TAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCAC  954

Query  916  CACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGC  989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  CACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGC  1028

Query  990  TGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATG  1063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  TGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATG  1102

Query 1064  TAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACC  1137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  TAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACC  1176

Query 1138  TGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGT  1211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  TGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGT  1250

Query 1212  TAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGAC  1285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  TAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGAC  1324

Query 1286  ATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAA  1359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  ATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAA  1398

Query 1360  GTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACA  1433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1399  GTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACA  1472

Query 1434  TTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGA  1507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGA  1546

Query 1508  TTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATC  1581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  TTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATC  1620

Query 1582  TCTAGA  1587
            ||||||
Sbjct 1621  TCTAGA  1626