Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481639
• Subject: XM_006514434.3
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1404
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA  74
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGGAAGATCAAAATGA  17

Query   75  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   18  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAGTGCTCTTTGGCAGATCAGTAATGGAACGTCATCTGTGATTGTCTCCAGAAAGA  91

Query  149  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  222
            ||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  GGCCGTCAGAGGGGAACTACCAGAAAGAAAAGGACTTGTGCATTAAGTACTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  165

Query  223  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  296
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CAGGTGGAATTTGTGGAGCATCTTATCTCACGGATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  239

Query  297  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  240  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATCACTGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTCT  313

Query  371  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  444
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  314  CCTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTGTGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGG  387

Query  445  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  518
            |||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  388  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAGAGGATGGTGCGCACCGACCCTCTCTGGAAGGGACTCTCAGAAAGAAGAGG  461

Query  519  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  462  CTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCTACAGATGGCCCTCCCAACTCATTTTATAGATCATTATACCCAA  535

Query  593  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  536  AGATTATCCAGGACATAGAGACCATAGAATCCAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATCCAGTGC  609

Query  667  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  610  CGCTCTGAAAATAGTAAGGGTGTCTACTGTTTGCAATATGATGATGACAAAATTATCAGTGGCCTCCGGGACAA  683

Query  741  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  814
            .|||||.|||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  684  CTCTATCAAGATCTGGGATAAAAGCAGCTTGGAATGTTTGAAAGTGCTAACGGGCCACACAGGCTCTGTCCTCT  757

Query  815  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  888
            |.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  758  GCCTCCAGTATGATGAGCGAGTCATTGTAACTGGTTCTTCAGACTCCACGGTGAGAGTCTGGGATGTGAACACT  831

Query  889  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  962
            |||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  GGTGAGGTGCTCAACACACTCATCCACCACAATGAAGCCGTACTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  905

Query  963  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  1036
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  906  GACTTGTTCCAAGGACCGTTCCATTGCCGTGTGGGACATGGCTTCTGCCACCGATATCACTTTACGCCGTGTTC  979

Query 1037  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1110
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  980  TGGTTGGCCACCGTGCTGCTGTCAATGTAGTAGACTTTGATGATAAATACATCGTGTCTGCTTCAGGAGACAGG  1053

Query 1111  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1184
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1054  ACCATTAAAGTGTGGAGCACGAGCACATGTGAGTTTGTCCGCACTCTGAATGGGCACAAGCGAGGCATCGCCTG  1127

Query 1185  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1258
            |||.||||||.|.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||..||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1128  TCTGCAGTACCGCGACCGGCTTGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATCCGGTTATGGGATATTGAATGTG  1201

Query 1259  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1332
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1202  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGGCACGAAGAATTGGTCCGGTGCATCCGTTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1275

Query 1333  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1406
            |||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1276  AGTGGCGCCTATGATGGGAAGATTAAAGTCTGGGACTTGCAGGCTGCTCTTGACCCTCGGGCCCCAGCAAGCAC  1349

Query 1407  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1480
            |||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350  ATTGTGTCTGCGCACCTTGGTGGAACACTCTGGACGTGTGTTTCGGCTGCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1423

Query 1481  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1424  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGC  1497

Query 1555  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            ||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1498  TCTCCCTCCAGAACCTACACCTATATCTCCAGA  1530