Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481639
- Subject:
- XM_017009279.1
- Aligned Length:
- 1633
- Identities:
- 1571
- Gaps:
- 53
Alignment
Query 1 -------------ATGGAGCCCGACTC-----GGTGATTGAGGACAAGACCATC------GAGCTCAT------ 44
|.||| |.|| ||..|||.||..|| .||||| ||.|||||
Sbjct 1 ATGATTATTAGTCAAGGA-----ATTCGCAAAGGAAATTCAGTTCA--GCCATCCTTTTGGATCTCATGGATTT 67
Query 45 ----------------GAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTT 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 CTAAATTTGACCAAGAGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGAAGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTT 141
Query 103 TGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGA 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 TGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGAGGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGA 215
Query 177 AAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTT 289
Query 251 CACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACC 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 CACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAAGCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACC 363
Query 325 GCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGC 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTTCGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGC 437
Query 399 AGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAA 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 AGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGAATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAA 511
Query 473 TGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGA 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 TGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGGGTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGA 585
Query 547 CCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGA 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 CCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAAAGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGA 659
Query 621 ATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACT 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 ATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGCCGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACT 733
Query 695 GTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGC 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 GTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAATTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGC 807
Query 769 CTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGT 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 CTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCTGTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGT 881
Query 843 AACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACC 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 AACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACGGGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACC 955
Query 917 ACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 ACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGTGACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCT 1029
Query 991 GTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGT 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 GTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCCTGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGT 1103
Query 1065 AGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCT 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 AGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGGACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCT 1177
Query 1139 GTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTT 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 GTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTGTCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTT 1251
Query 1213 AGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACA 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 AGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTGGTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACA 1325
Query 1287 TGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAG 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTCAGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAG 1399
Query 1361 TTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACAT 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 TTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCACATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACAT 1473
Query 1435 TCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGAT 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 TCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCAGCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGAT 1547
Query 1509 TTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCT 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 TTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGTTCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCT 1621
Query 1583 CTAGA 1587
|||||
Sbjct 1622 CTAGA 1626