Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481639
• Subject: XM_017009280.2
• Aligned Length: 1587
• Identities: 1530
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGAGCCCGACTCGGTGATTGAGGACAAGACCATCGAGCTCATGAACACTTCAGTTATGGAAGATCAAAATGA  74
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGGAAGATCAAAATGA  17

Query   75  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  AGATGAGTCCCCAAAGAAAAATACTCTTTGGCAGATAAGTAATGGAACATCATCTGTGATCGTCTCCAGAAAGA  91

Query  149  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   92  GGCCATCAGAAGGAAACTATCAAAAAGAAAAAGACTTGTGTATTAAATATTTTGACCAGTGGTCTGAATCAGAT  165

Query  223  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  166  CAAGTGGAATTTGTGGAACATCTTATTTCACGAATGTGTCATTATCAGCATGGACATATTAACTCTTACCTGAA  239

Query  297  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  240  GCCCATGTTGCAGCGGGACTTTATTACCGCTTTACCAGAGCAAGGCTTAGATCACATAGCAGAAAACATTCTTT  313

Query  371  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  314  CGTACCTGGATGCCAGGTCTCTGTGTGCAGCAGAGCTGGTATGTAAAGAATGGCAGCGAGTGATCTCAGAAGGA  387

Query  445  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  388  ATGCTTTGGAAGAAGCTGATTGAACGAATGGTACGCACTGATCCCCTATGGAAAGGACTTTCAGAAAGAAGAGG  461

Query  519  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  462  GTGGGATCAGTACCTGTTTAAAAACAGACCCACAGATGGCCCTCCAAATTCATTTTATAGGTCATTATACCCAA  535

Query  593  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  536  AGATTATCCAGGATATAGAGACTATAGAATCTAACTGGCGGTGTGGACGACACAACTTGCAGAGGATTCAGTGC  609

Query  667  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  610  CGCTCTGAAAATAGTAAAGGTGTCTACTGTTTACAGTACGATGATGAAAAAATTATCAGTGGCCTACGAGATAA  683

Query  741  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  684  TTCTATTAAGATATGGGATAAAACCAGCCTGGAATGTTTGAAAGTGTTAACAGGACACACAGGCTCTGTCCTCT  757

Query  815  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  758  GTCTGCAGTATGATGAGCGTGTCATTGTAACTGGCTCTTCAGATTCTACGGTGAGAGTGTGGGATGTGAACACG  831

Query  889  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  832  GGTGAAGTTCTTAACACATTGATCCACCACAATGAGGCTGTATTGCACTTACGCTTCAGCAATGGACTGATGGT  905

Query  963  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  906  GACCTGTTCCAAGGACCGCTCCATTGCTGTGTGGGACATGGCTTCTGCGACCGACATCACTTTACGCCGTGTCC  979

Query 1037  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  980  TGGTTGGCCACCGGGCTGCCGTCAATGTAGTAGACTTTGACGACAAGTACATCGTGTCTGCCTCTGGTGACAGG  1053

Query 1111  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054  ACCATCAAAGTCTGGAGCACGAGCACCTGTGAATTTGTTCGTACTCTCAATGGGCACAAGCGGGGCATTGCCTG  1127

Query 1185  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128  TCTCCAGTACAGGGATCGCCTGGTTGTTAGTGGATCATCAGATAATACCATTAGGCTCTGGGATATTGAATGTG  1201

Query 1259  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202  GTGCCTGTTTAAGAGTCCTAGAGGGACATGAAGAATTGGTCCGATGCATCCGGTTTGATAACAAGAGGATTGTC  1275

Query 1333  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276  AGTGGGGCCTATGATGGGAAAATTAAAGTTTGGGACTTGCAAGCTGCTCTTGACCCTCGAGCCCCAGCAAGCAC  1349

Query 1407  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350  ATTGTGTTTGCGCACATTGGTGGAACATTCTGGACGTGTGTTTCGGCTCCAGTTTGATGAGTTTCAGATCATCA  1423

Query 1481  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424  GCAGCTCCCATGATGACACTATTTTGATTTGGGATTTCTTAAATGTGCCTCCCAGTGCCCAGAATGAGACCCGT  1497

Query 1555  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1587
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498  TCTCCCTCCAGAACATACACTTACATCTCTAGA  1530