Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481658
- Subject:
- XM_005259209.3
- Aligned Length:
- 1478
- Identities:
- 1188
- Gaps:
- 130
Alignment
Query 1 ATGA-CCATGTC--------------------------CA-AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGG 46
|||| |.|| || || ||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1 ATGATCGAT-TCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA 73
Query 47 TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAAC 120
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 74 TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC 147
Query 121 TTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTT 194
||||||||||||||.||||||
Sbjct 148 TTCAGGAACCTGCTCTCAGTG----------------------------------------------------- 168
Query 195 TTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTC 268
|||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 169 ----------------------------------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC 202
Query 269 CAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCT 342
|||||||||||.|||||||||..|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct 203 CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT 276
Query 343 CAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATC 416
|||||..|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||
Sbjct 277 CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC 350
Query 417 TATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTG 490
||.|.|.||||||.||.|.|||||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.||||||
Sbjct 351 TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG 424
Query 491 ATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC 564
|||||||||||||..||...||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC 498
Query 565 TCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATT 638
|||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 499 TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT 572
Query 639 CAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTG 712
.||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 573 TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG 646
Query 713 GGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGT 786
|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 647 GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT 720
Query 787 GAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCC 860
|||..||||||||.|||.|||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 721 GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC 794
Query 861 ATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAG 934
||||||||||||.||||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct 795 ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAG 868
Query 935 GAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCA 1004
.|.|||||| |||| .|||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||
Sbjct 869 CAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCA 938
Query 1005 GACGATCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTT 1078
||.|||.||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||
Sbjct 939 GATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTT 1012
Query 1079 TGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAG 1152
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1013 TGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAG 1086
Query 1153 TCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTT 1226
||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1087 TCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTT 1160
Query 1227 TAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTG 1300
||||||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1161 TAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTG 1234
Query 1301 GAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGT 1374
||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1235 GAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGT 1308
Query 1375 GAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG 1446
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1309 GAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA 1380