Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487677
- Subject:
- XM_011238805.2
- Aligned Length:
- 1452
- Identities:
- 1226
- Gaps:
- 147
Alignment
Query 1 ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
Query 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGCTATAAGGAGAAACCTCAAGATGTGGACTTACCTTATC 148
Query 149 CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 222
|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 149 CCCTCAACAACTTCTCAGTGGCAAAATGTCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAATACATTTATTATC 222
Query 223 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 296
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 AGATGTCTTCAGTGGACCACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACACCAGAGGAAAGAGAAGAGTGGAC 296
Query 297 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 370
.|||||||||||.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 297 GGAAGCTATCCAAGCCGTAGCCGACCGATTGCAGAGGCAAGAGGAGGAGAGGATGAATTGTAGCCCAACCTCAC 370
Query 371 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AGATTGATAATATAGGAGAAGAAGAGATGGATGCGTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACGATGAATGATTTT 444
Query 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
Query 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTTACTGAAAGCA 592
Query 593 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 666
|||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGTACTAAAGAACACCAGACATCCATTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 666
Query 667 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 740
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGCGGAGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGAGTGTTCTCTGAGGACCG 740
Query 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCGGAAAGATTGTGTACCGTGATC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCTTTGGACTATCTACATTCTGGAAAGATTGTGTACCGTGATC 814
Query 815 TCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAAGGG 888
||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 TCAAGTTGGAGAATTTGATGCTAGATAAGGATGGCCATATAAAAATTACGGATTTTGGGCTTTGCAAAGAAGGG 888
Query 889 ATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGATAA 962
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 ATCACAGATGCAGCTACCATGAAGACATTCTGTGGCACACCAGAGTACCTGGCACCAGAGGTATTAGAAGATAA 962
Query 963 TGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTACCTT 1036
|||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 963 TGACTATGGCCGAGCCGTGGACTGGTGGGGCTTAGGTGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGAAGGTTGCCTT 1036
Query 1037 TCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTCTCT 1110
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1037 TCTACAACCAGGATCATGAGAAACTCTTTGAATTAATACTAATGGAAGACATTAAATTCCCCCGAACACTCTCT 1110
Query 1111 TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGATGA 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGGCCAGATGA 1184
Query 1185 TGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAG------- 1251
||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1185 TGCAAAAGAAATCATGAGGCATAGTTTTTTTTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGACAAAAAGACAGGGT 1258
Query 1252 CT-----TGTACCTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACA 1320
|| ||||.| |||....||||| || ||| .|||.| ||||.|
Sbjct 1259 CTCACTGTGTATC-CCTGGGTAACCT--AG-AAC-----GGACTG----------------TGAAAA------- 1300
Query 1321 GCTCAGACT---ATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAG 1391
||||||| .||..|.|.|
Sbjct 1301 --TCAGACTGGCCTTGAACTCA---------------------------------------------------- 1320
Query 1392 GCGGCCGCATTTCCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1437
Sbjct 1321 ---------------------------------------------- 1320