Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487677
- Subject:
- XM_017320418.1
- Aligned Length:
- 1437
- Identities:
- 1174
- Gaps:
- 183
Alignment
Query 1 ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC 222
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1 -----------------------------------ATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAATACATTTATTATC 39
Query 223 AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC 296
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 40 AGATGTCTTCAGTGGACCACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACACCAGAGGAAAGAGAAGAGTGGAC 113
Query 297 AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC 370
.|||||||||||.||.|||||.|||.||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 114 GGAAGCTATCCAAGCCGTAGCCGACCGATTGCAGAGGCAAGAGGAGGAGAGGATGAATTGTAGCCCAACCTCAC 187
Query 371 AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 188 AGATTGATAATATAGGAGAAGAAGAGATGGATGCGTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACGATGAATGATTTT 261
Query 445 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262 GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA 335
Query 519 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 336 CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTTACTGAAAGCA 409
Query 593 GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 666
|||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410 GAGTACTAAAGAACACCAGACATCCATTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT 483
Query 667 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG 740
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 484 TTTGTGATGGAATATGTTAATGGCGGAGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGAGTGTTCTCTGAGGACCG 557
Query 741 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCGGAAAGATTGTGTACCGTGATC 814
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 558 CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCTTTGGACTATCTACATTCTGGAAAGATTGTGTACCGTGATC 631
Query 815 TCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAAGGG 888
||||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 632 TCAAGTTGGAGAATTTGATGCTAGATAAGGATGGCCATATAAAAATTACGGATTTTGGGCTTTGCAAAGAAGGG 705
Query 889 ATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGATAA 962
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 706 ATCACAGATGCAGCTACCATGAAGACATTCTGTGGCACACCAGAGTACCTGGCACCAGAGGTATTAGAAGATAA 779
Query 963 TGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTACCTT 1036
|||||||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 780 TGACTATGGCCGAGCCGTGGACTGGTGGGGCTTAGGTGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGAAGGTTGCCTT 853
Query 1037 TCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTCTCT 1110
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 854 TCTACAACCAGGATCATGAGAAACTCTTTGAATTAATACTAATGGAAGACATTAAATTCCCCCGAACACTCTCT 927
Query 1111 TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGATGA 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 928 TCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGGCCAGATGA 1001
Query 1185 TGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTGTAC 1258
||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1002 TGCAAAAGAAATCATGAGGCATAGTTTTTTTTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGACAAAAAGCTTGTAC 1075
Query 1259 CTCCTTTTAAACCTCAAGTAACATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACTATT 1332
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076 CTCCTTTTAAGCCTCAAGTAACATCTGAAACAGACACCCGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCTCAGACTATT 1149
Query 1333 ACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCCGCATTTCCC 1406
||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||.|||||||.||.|||||
Sbjct 1150 ACAATAACACCACCTGAAAAGTATGACGACGACGGCATGGACGGCATGGACAACGAGCGGCGGCCACACTTCCC 1223
Query 1407 TCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA 1437
|||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1224 TCAGTTCTCCTACTCTGCAAGCGGACGGGAA 1254