Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487692
• Subject: NM_001167700.2
• Aligned Length: 1252
• Identities: 1021
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGGTTTTTGCTCACAGAATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCCTACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAA  74
                              |||||||||..|.||||.|.|.||.|.|.|.|.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ------------------ATGGATAACGACCAGCCGCCTGTGGTGACTGCCACCCTGCTGGTGCCCCTTCAGAA  56

Query   75  CCGCAGCTGCACTGAAACAGC-----CACACCT-CTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACA  142
            |.||||||||.|.|||.||||     |   ||| |||||   |||...||||||||.|||...|||||||||||
Sbjct   57  CAGCAGCTGCGCGGAAGCAGCTGAGGC---CCTGCTGCC---CCATGGCCTGATGGGATTGCATGAGGAGCACA  124

Query  143  GTTGGATGAGCAACCAAACAGACCTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCACAGCCAGCATCTTCTTT  216
            |.||||||||||||...|||||.|||||.||.|.||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  125  GCTGGATGAGCAACAGGACAGAGCTTCAGTACGAGCTGAACCCTGGAGAGGTGGCCACCGCCAGCATCTTCTTT  198

Query  217  GG-GATTCTGTGGTTGTTTTCTATCTTCGGCAATTCCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTC  289
            || |.|| ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||..||||..|||||||||
Sbjct  199  GGCGCTT-TGTGGTTGTTCTCCATCTTTGGCAATTCCCTGGTATGTCTGGTCATCCACCGGAGCCGGAGGACTC  271

Query  290  AGTCTACCACCAACTACTTTGTGGTCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGCCAGCACGCCTTTC  363
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  272  AGTCCACCACCAACTACTTCGTGGTGTCCATGGCGTGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTGGCCAGCACGCCGTTT  345

Query  364  GTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGAAGGTGGACGCTGGGTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATA  437
            |||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|.|||||||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  346  GTCGTGCTGCAGTTCACCACCGGGAGGTGGACCCTGGGTAGCGCCATGTGCAAGGTGGTCCGCTACTTCCAGTA  419

Query  438  TCTCACTCCAGGTGTCCAGATCTACGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCATCGTCTATCCTC  511
            .|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  420  CCTCACCCCCGGCGTGCAGATCTACGTGCTGCTCTCCATCTGCATCGACCGCTTCTATACCATCGTCTACCCGC  493

Query  512  TGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAAAAGCCAAGAAAATGATTGCGGCATCGTGGATCTTTGATGCAGGCTTTGTG  585
            |||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|.|||.|||
Sbjct  494  TGAGCTTCAAGGTGTCCCGAGAGAAGGCCAAGAAAATGATTGCAGCCTCCTGGATCTTGGACGCGGCCTTCGTG  567

Query  586  ACCCCTGTGCTCTTTTTCTATGGCTCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTCTTGGGAAGG  659
            ||.|||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.||
Sbjct  568  ACGCCTGTCTTCTTTTTCTACGGCTCTAACTGGGATAGTCACTGTAACTACTTCCTCCCTCCCTCCTGGGAGGG  641

Query  660  CACTGCCTACACTGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTTGTGATTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAA  733
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||..|.||||||||.|
Sbjct  642  AACTGCCTATACCGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTCGTGATTCCCTCCATCCTCATAATCCTGTTTTACCAGA  715

Query  734  AGGTCATAAAATATATTTGGAGAATAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGTCCCTCGG  807
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||..||
Sbjct  716  AGGTCATAAAGTATATCTGGAGAATAGGCACGGACGGGCGGACGCTGAGAAGGACGATGAACATTGTCCCCAGG  789

Query  808  ACAAAAGTGAAAACTATCAAGATGTTCCTCATTTTAAATCTGTTGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGT  881
            |||||.||||||||..|||||||||||||..|.||.||.||..||||..||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  790  ACAAAGGTGAAAACGGTCAAGATGTTCCTGCTCTTGAACCTAGTGTTCCTGTTCTCCTGGCTACCTTTCCATGT  863

Query  882  AGCTCAGCTATGGCACCCCCATGAACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATGGATAT  955
            .||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||..||||.|||.|||
Sbjct  864  GGCTCAGCTCTGGCATCCCCATGAGCAAGACTACAAGAAGAGCTCCCTTGTCTTCACGGCAGTCACGTGGGTAT  937

Query  956  CCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAACCTACTCTGTATTCAATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAG  1029
            |.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  CTTTCAGCTCTTCAGCCTCGAAACCCACTCTGTACTCTATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAG  1011

Query 1030  ACTTTTTGCATGTCCTCTATGAAATGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATTACAACAAGTTCAAGGATGGCCAA  1103
            ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||.||||||||||
Sbjct 1012  ACATTCTGCATGTCCTCGATGAAATGCTACCGCAGCAATGCCTACACCATCACGACCAGCTCACGGATGGCCAA  1085

Query 1104  AAAAAACTACGTTGGCATTTCAGAAATCCCTTCCATGGCCAAAACTATTACCAAAGACTCGATCTATGACTCAT  1177
            ||.||||||.||.||||||||.|||||||||.||.||..||..||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1086  AAGAAACTATGTGGGCATTTCGGAAATCCCTCCCGTGAGCAGGACCATAACCAAAGACTCCATCTATGACTCAT  1159

Query 1178  TTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAAAAGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTC  1245
            |||||.|.||.||||.|||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1160  TTGACCGGGAGGCCAGGGAGAAGAAGCTCGCCTGGCCCATCAACTCAAACCCTCCAAACACTTTTGTC  1227