Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487692
• Subject: XM_017019214.1
• Aligned Length: 1302
• Identities: 1243
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGTTTTTGCTCACAG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGAGGCCTCATTCTTCTTTTCCCCAACCAGAATTAAGAGAAAAAAAGTGAATATGGTTTTTGCTCACAG  74

Query   18  AATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCCTACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAACCGCAGCTGCACTGAAA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCCTACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAACCGCAGCTGCACTGAAA  148

Query   92  CAGCCACACCTCTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACAGTTGGATGAGCAACCAAACAGAC  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGCCACACCTCTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACAGTTGGATGAGCAACCAAACAGAC  222

Query  166  CTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCACAGCCAGCATCTTCTTTGGGATTCTGTGGTTGTTTTCTAT  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCACAGCCAGCATCTTCTTTGGGATTCTGTGGTTGTTTTCTAT  296

Query  240  CTTCGGCAATTCCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTCAGTCTACCACCAACTACTTTGTGG  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCGGCAATTCCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTCAGTCTACCACCAACTACTTTGTGG  370

Query  314  TCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGCCAGCACGCCTTTCGTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGA  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGCCAGCACGCCTTTCGTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGA  444

Query  388  AGGTGGACGCTGGGTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATATCTCACTCCAGGTGTCCAGATCTA  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGTGGACGCTGGGTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATATCTCACTCCAGGTGTCCAGATCTA  518

Query  462  CGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCATCGTCTATCCTCTGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAA  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCATCGTCTATCCTCTGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAA  592

Query  536  AAGCCAAGAAAATGATTGCGGCATCGTGGATCTTTGATGCAGGCTTTGTGACCCCTGTGCTCTTTTTCTATGGC  609
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCCAAGAAAATGATTGCGGCATCGTGGGTCTTTGATGCAGGCTTTGTGACCCCTGTGCTCTTTTTCTATGGC  666

Query  610  TCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTCTTGGGAAGGCACTGCCTACACTGTCATCCACTT  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTCTTGGGAAGGCACTGCCTACACTGTCATCCACTT  740

Query  684  CTTGGTGGGCTTTGTGATTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAAAGGTCATAAAATATATTTGGAGAA  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTGGTGGGCTTTGTGATTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAAAGGTCATAAAATATATTTGGAGAA  814

Query  758  TAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGTCCCTCGGACAAAAGTGAAAACTATCAAGATG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGTCCCTCGGACAAAAGTGAAAACTATCAAGATG  888

Query  832  TTCCTCATTTTAAATCTGTTGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGTAGCTCAGCTATGGCACCCCCATGA  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCTCATTTTAAATCTGTTGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGTAGCTCAGCTATGGCACCCCCATGA  962

Query  906  ACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATGGATATCCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAAC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATGGATATCCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAAC  1036

Query  980  CTACTCTGTATTCAATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAGACTTTTTGCATGTCCTCTATGAAA  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTACTCTGTATTCAATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAGACTTTTTGCATGTCCTCTATGAAA  1110

Query 1054  TGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATTACAACAAGTTCAAGGATGGCCAAAAAAAACTACGTTGGCATTTCAGA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATCACAACAAGTTCAAGGATGGCCAAAAAAAACTACGTTGGCATTTCAGA  1184

Query 1128  AATCCCTTCCATGGCCAAAACTATTACCAAAGACTCGATCTATGACTCATTTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAAA  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATCCCTTCCATGGCCAAAACTATTACCAAAGACTCGATCTATGACTCATTTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAAA  1258

Query 1202  AGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTC  1245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTC  1302