Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487718
• Subject: XM_011510158.2
• Aligned Length: 1458
• Identities: 857
• Gaps: 591

Alignment

Query    1  ATGCGGTGGCTGTGGCCCCTGGCTGTCTCTCTTGCTGTGATTTTGGCTGTGGGGCTAAGCAGGGTCTCTGGGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCCCCCCTGCACCTGGGCAGGCACAGAGCCGAGACCCAGGAGCAGCAGAGCCGATCCAAGAGGGGCACCGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAGGAGGCCAAGGGCGTGCAGCAGTATGTGCCTGAGGAGTGGGCGGAGTACCCCCGGCCCATTCACCCTGCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGCCTGCAGCCAACCAAGCCCTTGGTGGCCACCAGCCCTAACCCCGGCAGGGATGGGGGCACCCCAGACAGTGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCAGGAACTGAGGGGCAATCTGACAGGAGCACCAGGGCAGAGGCTACAGATCCAGAACCCCCTGTATCCGGTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCGAGAGCTCCTACAGTGCCTATGCCATCATGCTTCTGGCGCTGGTGGTGTTTGCGGTGGGCATTGTGGGCAAC  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CTGTCGGTCATGTGCATCGTGTGGCACAGCTACTACCTGAAGAGTGCCTGGAACTCCATCCTTGCCAGCCTG--  516
                                                                     ||.|||      |||  
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------ATGCTT------CTGAA  11

Query  517  --GCCCTCTGGGATTTTCTGGTCCTCTTTTTCTGCCTCCCTATTGTC-----------ATCTTCAACGAGATCA  577
              |      ||||                 ..||.||||...|||||           ||||||  |.|     
Sbjct   12  TAG------GGGA-----------------GATGGCTCCAGCTTGTCCAGAGAGAGGAATCTTC--CTA-----  55

Query  578  CCAAGCAGAGGCTACTGGGTGACGTTTCTTGTCGTGCCGTGCCCTTCATGGAGGTCTCCTCTCTGGGAGTCACG  651
              |||.||| .||||                                    |||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  --AAGTAGA-ACTAC------------------------------------AGGTCTCCTCTCTGGGAGTCACG  90

Query  652  ACTTTCAGCCTCTGTGCCCTGGGCATTGACCGCTTCCACGTGGCCACCAGCACCCTGCCCAAGGTGAGGCCCAT  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  ACTTTCAGCCTCTGTGCCCTGGGCATTGACCGCTTCCACGTGGCCACCAGCACCCTGCCCAAGGTGAGGCCCAT  164

Query  726  CGAGCGGTGCCAATCCATCCTGGCCAAGTTGGCTGTCATCTGGGTGGGCTCCATGACGCTGGCTGTGCCTGAGC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  CGAGCGGTGCCAATCCATCCTGGCCAAGTTGGCTGTCATCTGGGTGGGCTCCATGACGCTGGCTGTGCCTGAGC  238

Query  800  TCCTGCTGTGGCAGCTGGCACAGGAGCCTGCCCCCACCATGGGCACCCTGGACTCATGCATCATGAAACCCTCA  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  TCCTGCTGTGGCAGCTGGCACAGGAGCCTGCCCCCACCATGGGCACCCTGGACTCATGCATCATGAAACCCTCA  312

Query  874  GCCAGCCTGCCCGAGTCCCTGTATTCACTGGTGATGACCTACCAGAACGCCCGCATGTGGTGGTACTTTGGCTG  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  GCCAGCCTGCCCGAGTCCCTGTATTCACTGGTGATGACCTACCAGAACGCCCGCATGTGGTGGTACTTTGGCTG  386

Query  948  CTACTTCTGCCTGCCCATCCTCTTCACAGTCACCTGCCAGCTGGTGACATGGCGGGTGCGAGGCCCTCCAGGGA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  CTACTTCTGCCTGCCCATCCTCTTCACAGTCACCTGCCAGCTGGTGACATGGCGGGTGCGAGGCCCTCCAGGGA  460

Query 1022  GGAAGTCAGAGTGCAGGGCCAGCAAGCACGAGCAGTGTGAGAGCCAGCTCAACAGCACCGTGGTGGGCCTGACC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  GGAAGTCAGAGTGCAGGGCCAGCAAGCACGAGCAGTGTGAGAGCCAGCTCAACAGCACCGTGGTGGGCCTGACC  534

Query 1096  GTGGTCTACGCCTTCTGCACCCTCCCAGAGAACGTCTGCAACATCGTGGTGGCCTACCTCTCCACCGAGCTGAC  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  535  GTGGTCTACGCCTTCTGCACCCTCCCAGAGAACGTCTGCAACATCGTGGTGGCCTACCTCTCCACCGAGCTGAC  608

Query 1170  CCGCCAGACCCTGGACCTCCTGGGCCTCATCAACCAGTTCTCCACCTTCTTCAAGGGCGCCATCACCCCAGTGC  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  609  CCGCCAGACCCTGGACCTCCTGGGCCTCATCAACCAGTTCTCCACCTTCTTCAAGGGCGCCATCACCCCAGTGC  682

Query 1244  TGCTCCTTTGCATCTGCAGGCCGCTGGGCCAGGCCTTCCTGGACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGAGGAGTGC  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  TGCTCCTTTGCATCTGCAGGCCGCTGGGCCAGGCCTTCCTGGACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTGAGGAGTGC  756

Query 1318  GGCGGGGCTTCGGAGGCCTCTGCTGCCAATGGGTCGGACAACAAGCTCAAGACCGAGGTGTCCTCTTCCATCTA  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  GGCGGGGCTTCGGAGGCCTCTGCTGCCAATGGGTCGGACAACAAGCTCAAGACCGAGGTGTCCTCTTCCATCTA  830

Query 1392  CTTCCACAAGCCCAGGGAGTCACCCCCACTCCTGCCCCTGGGCACACCTTGC  1443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  CTTCCACAAGCCCAGGGAGTCACCCCCACTCCTGCCCCTGGGCACACCTTGC  882