Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487749
• Subject: XM_011512911.2
• Aligned Length: 933
• Identities: 792
• Gaps: 141

Alignment

Query   1  ATGCAGACTTTCACAATGGTTCTAGAAGAAATCTGGACAAGTCTTTTCATGTGGTTTTTCTACGCATTGATTCC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  ATGTTTGCTCACAGATGAAGTGGCCATTCTGCCTGCCCCTCAGAACCTCTCTGTACTCTCAACCAACATGAAGC  148
                                                                              |||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------------------------------ATGAAGC  7

Query 149  ATCTCTTGATGTGGAGCCCAGTGATCGCGCCTGGAGAAACAGTGTACTATTCTGTCGAATACCAGGGGGAGTAC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   8  ATCTCTTGATGTGGAGCCCAGTGATCGCGCCTGGAGAAACAGTGTACTATTCTGTCGAATACCAGGGGGAGTAC  81

Query 223  GAGAGCCTGTACACGAGCCACATCTGGATCCCCAGCAGCTGGTGCTCACTCACTGAAGGTCCTGAGTGTGATGT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  82  GAGAGCCTGTACACGAGCCACATCTGGATCCCCAGCAGCTGGTGCTCACTCACTGAAGGTCCTGAGTGTGATGT  155

Query 297  CACTGATGACATCACGGCCACTGTGCCATACAACCTTCGTGTCAGGGCCACATTGGGCTCACAGACCTCAGCCT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 156  CACTGATGACATCACGGCCACTGTGCCATACAACCTTCGTGTCAGGGCCACATTGGGCTCACAGACCTCAGCCT  229

Query 371  GGAGCATCCTGAAGCATCCCTTTAATAGAAACTCAACCATCCTTACCCGACCTGGGATGGAGATCACCAAAGAT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 230  GGAGCATCCTGAAGCATCCCTTTAATAGAAACTCAACCATCCTTACCCGACCTGGGATGGAGATCACCAAAGAT  303

Query 445  GGCTTCCACCTGGTTATTGAGCTGGAGGACCTGGGGCCCCAGTTTGAGTTCCTTGTGGCCTACTGGAGGAGGGA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 304  GGCTTCCACCTGGTTATTGAGCTGGAGGACCTGGGGCCCCAGTTTGAGTTCCTTGTGGCCTACTGGAGGAGGGA  377

Query 519  GCCTGGTGCCGAGGAACATGTCAAAATGGTGAGGAGTGGGGGTATTCCAGTGCACCTAGAAACCATGGAGCCAG  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 378  GCCTGGTGCCGAGGAACATGTCAAAATGGTGAGGAGTGGGGGTATTCCAGTGCACCTAGAAACCATGGAGCCAG  451

Query 593  GGGCTGCATACTGTGTGAAGGCCCAGACATTCGTGAAGGCCATTGGGAGGTACAGCGCCTTCAGCCAGACAGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 452  GGGCTGCATACTGTGTGAAGGCCCAGACATTCGTGAAGGCCATTGGGAGGTACAGCGCCTTCAGCCAGACAGAA  525

Query 667  TGTGTGGAGGTGCAAGGAGAGGCCATTCCCCTGGTACTGGCCCTGTTTGCCTTTGTTGGCTTCATGCTGATCCT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 526  TGTGTGGAGGTGCAAGGAGAGGCCATTCCCCTGGTACTGGCCCTGTTTGCCTTTGTTGGCTTCATGCTGATCCT  599

Query 741  TGTGGTCGTGCCACTGTTCGTCTGGAAAATGGGCCGGCTGCTCCAGTACTCCTGTTGCCCCGTGGTGGTCCTCC  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 600  TGTGGTCGTGCCACTGTTCGTCTGGAAAATGGGCCGGCTGCTCCAGTACTCCTGTTGCCCCGTGGTGGTCCTCC  673

Query 815  CAGACACCTTGAAAATAACCAATTCACCCCAGAAGTTAATCAGCTGCAGAAGGGAGGAGGTGGATGCCTGTGCC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 674  CAGACACCTTGAAAATAACCAATTCACCCCAGAAGTTAATCAGCTGCAGAAGGGAGGAGGTGGATGCCTGTGCC  747

Query 889  ACGGCTGTGATGTCTCCTGAGGAACTCCTCAGGGCCTGGATCTCA  933
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 748  ACGGCTGTGATGTCTCCTGAGGAACTCCTCAGGGCCTGGATCTCA  792