Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487764
- Subject:
- XM_011529537.2
- Aligned Length:
- 2142
- Identities:
- 2092
- Gaps:
- 48
Alignment
Query 1 ATGCCGGCGGCGGCGGGGGACGGGCTCCTGGGGGAGCCGGCGGCGCCTGGGGGCGGCGGCGGCGCGGAGGACGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCGGCGGCGGCGGGGGACGGGCTCCTGGGGGAGCCGGCGGCGCCTGGGGGCGGCGGCGGCGCGGAGGACGC 74
Query 75 GGCCAGGCCCGCGGCGGCCTGCGAGGGAAGTTTCCTGCCTGCCTGGGTGAGCGGCGTGCCCCGCGAGCGGCTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGCCAGGCCCGCGGCGGCCTGCGAGGGAAGTTTCCTGCCTGCCTGGGTGAGCGGCGTGCCCCGCGAGCGGCTCC 148
Query 149 GCGACTTCCAGCACCACAAGCGCGTGGGCAACTACCTCATCGGCAGCAGGAAGCTGGGCGAGGGCTCCTTTGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGACTTCCAGCACCACAAGCGCGTGGGCAACTACCTCATCGGCAGCAGGAAGCTGGGCGAGGGCTCCTTTGCC 222
Query 223 AAGGTGCGCGAGGGGCTGCACGTGCTGACCGGGGAGAAGGTGGCCATAAAAGTCATTGATAAGAAGAGAGCCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGGTGCGCGAGGGGCTGCACGTGCTGACCGGGGAGAAGGTGGCCATAAAAGTCATTGATAAGAAGAGAGCCAA 296
Query 297 AAAGGACACCTATGTCACCAAAAACCTGCGGCGAGAGGGTCAGATCCAGCAGATGATCCGCCACCCCAATATCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAGGACACCTATGTCACCAAAAACCTGCGGCGAGAGGGTCAGATCCAGCAGATGATCCGCCACCCCAATATCA 370
Query 371 CTCAGCTCCTTGATATTTTAGAAACGGAAAACAGCTACTACCTGGTCATGGAGCTGTGCCCTGGGGGCAACCTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCAGCTCCTTGATATTTTAGAAACGGAAAACAGCTACTACCTGGTCATGGAGCTGTGCCCTGGGGGCAACCTG 444
Query 445 ATGCACAAGATCTATGAGAAGAAGCGGCTGGAGGAGTCCGAAGCCCGCAGATACATCCGACAGCTCATCTCTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGCACAAGATCTATGAGAAGAAGCGGCTGGAGGAGTCCGAAGCCCGCAGATACATCCGACAGCTCATCTCTGC 518
Query 519 CGTAGAGCACCTGCACCGGGCCGGGGTGGTCCACAGAGACTTGAAGATAGAGAATTTGCTACTAGATGAAGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGTAGAGCACCTGCACCGGGCCGGGGTGGTCCACAGAGACTTGAAGATAGAGAATTTGCTACTAGATGAAGACA 592
Query 593 ATAATATCAAGCTGATTGACTTTGGTTTGAGCAACTGCGCAGGGATCCTGGGTTACTCGGATCCGTTCAGCACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATAATATCAAGCTGATTGACTTTGGTTTGAGCAACTGCGCAGGGATCCTGGGTTACTCGGATCCGTTCAGCACA 666
Query 667 CAGTGTGGCAGCCCTGCCTACGCTGCACCTGAACTGCTCGCCAGGAAGAAATACGGCCCCAAAATCGATGTCTG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGTGTGGCAGCCCTGCCTACGCTGCACCTGAACTGCTCGCCAGGAAGAAATACGGCCCCAAAATCGATGTCTG 740
Query 741 GTCCATAGGTGTGAACATGTATGCCATGTTGACCGGGACGCTGCCTTTCACGGTGGAGCCTTTCAGCCTGAGGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCCATAGGTGTGAACATGTATGCCATGTTGACCGGGACGCTGCCTTTCACGGTGGAGCCTTTCAGCCTGAGGG 814
Query 815 CTTTGTACCAGAAGATGGTAGACAAAGAAATGAACCCCCTCCCCACTCAGCTCTCCACAGGTGCCATCAGTTTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTTTGTACCAGAAGATGGTAGACAAAGAAATGAACCCCCTCCCCACTCAGCTCTCCACAGGTGCCATCAGTTTC 888
Query 889 CTGCGCTCTCTCCTGGAACCGGATCCTGTGAAGAGGCCAAATATTCAGCAGGCACTGGCGAATCGCTGGCTTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCGCTCTCTCCTGGAACCGGATCCTGTGAAGAGGCCAAATATTCAGCAGGCACTGGCGAATCGCTGGCTTAA 962
Query 963 TGAGAATTACACGGGCAAAGTGCCCTGTAATGTCACCTATCCCAACAGGATTTCTCTGGAAGATCTGAGCCCGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAGAATTACACGGGCAAAGTGCCCTGTAATGTCACCTATCCCAACAGGATTTCTCTGGAAGATCTGAGCCCGA 1036
Query 1037 GCGTCGTGCTGCACATGACCGAGAAGCTGGGTTACAAGAACAGCGACGTGATCAACACTGTGCTCTCCAACCGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCGTCGTGCTGCACATGACCGAGAAGCTGGGTTACAAGAACAGCGACGTGATCAACACTGTGCTCTCCAACCGC 1110
Query 1111 GCCTGCCACATCCTGGCCATCTACTTCCTCTTAAACAAGAAACTGGAGCGCTATTTGTCAGGGAAATCTGACAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTGCCACATCCTGGCCATCTACTTCCTCTTAAACAAGAAACTGGAGCGCTATTTGTCAGGGAAATCTGACAT 1184
Query 1185 CCAGGACAGCCTCTGCTACAAGACCCGGCTCTACCAGATAGAAAAGTACAGGGCCCCCAAGGAGTCCTATGAGG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGGACAGCCTCTGCTACAAGACCCGGCTCTACCAGATAGAAAAGTACAGGGCCCCCAAGGAGTCCTATG--- 1255
Query 1259 CCTCTCTGGACACCTGGACACGAGATCTTGAATTCCATGCCGTGCAGGATAAAAAGCCCAAAGAACAAGAAAAA 1332
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 ---------------------------------------------AGGATAAAAAGCCCAAAGAACAAGAAAAA 1284
Query 1333 AGAGGGGATTTTCTTCATCGACCATTCTCCAAGAAGTTGGACAAGAACCTGCCCTCGCACAAACAGCCCTCAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285 AGAGGGGATTTTCTTCATCGACCATTCTCCAAGAAGTTGGACAAGAACCTGCCCTCGCACAAACAGCCCTCAGG 1358
Query 1407 CTCGCTCATGACACAGATTCAGAACACCAAAGCCCTCCTGAAGGACCGGAAGGCCTCCAAGTCCAGCTTCCCCG 1480
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359 CTCGCTTATGACACAGATTCAGAACACCAAAGCCCTCCTGAAGGACCGGAAGGCCTCCAAGTCCAGCTTCCCCG 1432
Query 1481 ACAAAGATTCCTTTGGCTGCCGCAATATTTTCCGCAAAACCTCAGATTCCAATTGTGTGGCTTCTTCCTCCATG 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1433 ACAAAGATTCCTTTGGCTGCCGCAATATTTTCCGCAAAACCTCAGATTCCAATTGTGTGGCTTCTTCTTCCATG 1506
Query 1555 GAGTTCATCCCCGTGCCACCGCCCAGGACCCCGAGGATTGTGAAGAAACCGGAGCCCCATCAGCCAGGGCCCGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507 GAGTTCATCCCCGTGCCACCGCCCAGGACCCCGAGGATTGTGAAGAAACCGGAGCCCCATCAGCCAGGGCCCGG 1580
Query 1629 AAGCACTGGCATCCCCCACAAGGAAGACCCCCTGATGCTGGACATGGTGCGCTCCTTCGAGTCTGTGGATCGCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581 AAGCACTGGCATCCCCCACAAGGAAGACCCCCTGATGCTGGACATGGTGCGCTCCTTCGAGTCTGTGGATCGCG 1654
Query 1703 ACGACCACGTAGAAGTGCTGTCTCCCTCTCATCACTACAGGATTCTGAACTCCCCGGTCAGCTTGGCTCGCAGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655 ACGACCACGTAGAAGTGCTGTCTCCCTCTCATCACTACAGGATTCTGAACTCCCCGGTCAGCTTGGCTCGCAGA 1728
Query 1777 AATTCCAGCGAGAGGACGCTGTCCCCGGGTCTGCCATCCGGAAGCATGTCGCCTCTCCATACTCCTTTGCATCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729 AATTCCAGCGAGAGGACGCTGTCCCCGGGTCTGCCATCCGGAAGCATGTCGCCTCTCCATACTCCTTTGCATCC 1802
Query 1851 AACTCTGGTCTCTTTTGCTCACGAAGATAAGAACAGCCCCCCAAAAGAGGAGGGCCTGTGTTGCCCACCTCCGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803 AACTCTGGTCTCTTTTGCTCACGAAGATAAGAACAGCCCCCCAAAAGAGGAGGGCCTGTGTTGCCCACCTCCGG 1876
Query 1925 TTCCCAGCAATGGCCCCATGCAGCCTCTGGGGAGCCCCAATTGTGTGAAAAGCCGAGGCCGGTTCCCTATGATG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877 TTCCCAGCAATGGCCCCATGCAGCCTCTGGGGAGCCCCAATTGTGTGAAAAGCCGAGGCCGGTTCCCTATGATG 1950
Query 1999 GGCATCGGACAGATGTTAAGGAAGCGCCATCAGAGTCTGCAGCCATCTGCAGATAGGCCCCTGGAGGCCAGCCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951 GGCATCGGACAGATGTTAAGGAAGCGCCATCAGAGTCTGCAGCCATCTGCAGATAGGCCCCTGGAGGCCAGCCT 2024
Query 2073 GCCCCCACTGCAGCCCCTAGCCCCTGTGAACCTTGCCTTTGACATGGCCGATGGGGTCAAGACCCAGTGC 2142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025 GCCCCCACTGCAGCCCCTAGCCCCTGTGAACCTTGCCTTTGACATGGCCGATGGGGTCAAGACCCAGTGC 2094