Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000487764
Subject:
XM_011529537.2
Aligned Length:
2142
Identities:
2092
Gaps:
48

Alignment

Query    1  ATGCCGGCGGCGGCGGGGGACGGGCTCCTGGGGGAGCCGGCGGCGCCTGGGGGCGGCGGCGGCGCGGAGGACGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCGGCGGCGGCGGGGGACGGGCTCCTGGGGGAGCCGGCGGCGCCTGGGGGCGGCGGCGGCGCGGAGGACGC  74

Query   75  GGCCAGGCCCGCGGCGGCCTGCGAGGGAAGTTTCCTGCCTGCCTGGGTGAGCGGCGTGCCCCGCGAGCGGCTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCAGGCCCGCGGCGGCCTGCGAGGGAAGTTTCCTGCCTGCCTGGGTGAGCGGCGTGCCCCGCGAGCGGCTCC  148

Query  149  GCGACTTCCAGCACCACAAGCGCGTGGGCAACTACCTCATCGGCAGCAGGAAGCTGGGCGAGGGCTCCTTTGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGACTTCCAGCACCACAAGCGCGTGGGCAACTACCTCATCGGCAGCAGGAAGCTGGGCGAGGGCTCCTTTGCC  222

Query  223  AAGGTGCGCGAGGGGCTGCACGTGCTGACCGGGGAGAAGGTGGCCATAAAAGTCATTGATAAGAAGAGAGCCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGTGCGCGAGGGGCTGCACGTGCTGACCGGGGAGAAGGTGGCCATAAAAGTCATTGATAAGAAGAGAGCCAA  296

Query  297  AAAGGACACCTATGTCACCAAAAACCTGCGGCGAGAGGGTCAGATCCAGCAGATGATCCGCCACCCCAATATCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAAGGACACCTATGTCACCAAAAACCTGCGGCGAGAGGGTCAGATCCAGCAGATGATCCGCCACCCCAATATCA  370

Query  371  CTCAGCTCCTTGATATTTTAGAAACGGAAAACAGCTACTACCTGGTCATGGAGCTGTGCCCTGGGGGCAACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCAGCTCCTTGATATTTTAGAAACGGAAAACAGCTACTACCTGGTCATGGAGCTGTGCCCTGGGGGCAACCTG  444

Query  445  ATGCACAAGATCTATGAGAAGAAGCGGCTGGAGGAGTCCGAAGCCCGCAGATACATCCGACAGCTCATCTCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGCACAAGATCTATGAGAAGAAGCGGCTGGAGGAGTCCGAAGCCCGCAGATACATCCGACAGCTCATCTCTGC  518

Query  519  CGTAGAGCACCTGCACCGGGCCGGGGTGGTCCACAGAGACTTGAAGATAGAGAATTTGCTACTAGATGAAGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTAGAGCACCTGCACCGGGCCGGGGTGGTCCACAGAGACTTGAAGATAGAGAATTTGCTACTAGATGAAGACA  592

Query  593  ATAATATCAAGCTGATTGACTTTGGTTTGAGCAACTGCGCAGGGATCCTGGGTTACTCGGATCCGTTCAGCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATAATATCAAGCTGATTGACTTTGGTTTGAGCAACTGCGCAGGGATCCTGGGTTACTCGGATCCGTTCAGCACA  666

Query  667  CAGTGTGGCAGCCCTGCCTACGCTGCACCTGAACTGCTCGCCAGGAAGAAATACGGCCCCAAAATCGATGTCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTGTGGCAGCCCTGCCTACGCTGCACCTGAACTGCTCGCCAGGAAGAAATACGGCCCCAAAATCGATGTCTG  740

Query  741  GTCCATAGGTGTGAACATGTATGCCATGTTGACCGGGACGCTGCCTTTCACGGTGGAGCCTTTCAGCCTGAGGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTCCATAGGTGTGAACATGTATGCCATGTTGACCGGGACGCTGCCTTTCACGGTGGAGCCTTTCAGCCTGAGGG  814

Query  815  CTTTGTACCAGAAGATGGTAGACAAAGAAATGAACCCCCTCCCCACTCAGCTCTCCACAGGTGCCATCAGTTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTTGTACCAGAAGATGGTAGACAAAGAAATGAACCCCCTCCCCACTCAGCTCTCCACAGGTGCCATCAGTTTC  888

Query  889  CTGCGCTCTCTCCTGGAACCGGATCCTGTGAAGAGGCCAAATATTCAGCAGGCACTGGCGAATCGCTGGCTTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCGCTCTCTCCTGGAACCGGATCCTGTGAAGAGGCCAAATATTCAGCAGGCACTGGCGAATCGCTGGCTTAA  962

Query  963  TGAGAATTACACGGGCAAAGTGCCCTGTAATGTCACCTATCCCAACAGGATTTCTCTGGAAGATCTGAGCCCGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAGAATTACACGGGCAAAGTGCCCTGTAATGTCACCTATCCCAACAGGATTTCTCTGGAAGATCTGAGCCCGA  1036

Query 1037  GCGTCGTGCTGCACATGACCGAGAAGCTGGGTTACAAGAACAGCGACGTGATCAACACTGTGCTCTCCAACCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCGTCGTGCTGCACATGACCGAGAAGCTGGGTTACAAGAACAGCGACGTGATCAACACTGTGCTCTCCAACCGC  1110

Query 1111  GCCTGCCACATCCTGGCCATCTACTTCCTCTTAAACAAGAAACTGGAGCGCTATTTGTCAGGGAAATCTGACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTGCCACATCCTGGCCATCTACTTCCTCTTAAACAAGAAACTGGAGCGCTATTTGTCAGGGAAATCTGACAT  1184

Query 1185  CCAGGACAGCCTCTGCTACAAGACCCGGCTCTACCAGATAGAAAAGTACAGGGCCCCCAAGGAGTCCTATGAGG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1185  CCAGGACAGCCTCTGCTACAAGACCCGGCTCTACCAGATAGAAAAGTACAGGGCCCCCAAGGAGTCCTATG---  1255

Query 1259  CCTCTCTGGACACCTGGACACGAGATCTTGAATTCCATGCCGTGCAGGATAAAAAGCCCAAAGAACAAGAAAAA  1332
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ---------------------------------------------AGGATAAAAAGCCCAAAGAACAAGAAAAA  1284

Query 1333  AGAGGGGATTTTCTTCATCGACCATTCTCCAAGAAGTTGGACAAGAACCTGCCCTCGCACAAACAGCCCTCAGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  AGAGGGGATTTTCTTCATCGACCATTCTCCAAGAAGTTGGACAAGAACCTGCCCTCGCACAAACAGCCCTCAGG  1358

Query 1407  CTCGCTCATGACACAGATTCAGAACACCAAAGCCCTCCTGAAGGACCGGAAGGCCTCCAAGTCCAGCTTCCCCG  1480
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  CTCGCTTATGACACAGATTCAGAACACCAAAGCCCTCCTGAAGGACCGGAAGGCCTCCAAGTCCAGCTTCCCCG  1432

Query 1481  ACAAAGATTCCTTTGGCTGCCGCAATATTTTCCGCAAAACCTCAGATTCCAATTGTGTGGCTTCTTCCTCCATG  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1433  ACAAAGATTCCTTTGGCTGCCGCAATATTTTCCGCAAAACCTCAGATTCCAATTGTGTGGCTTCTTCTTCCATG  1506

Query 1555  GAGTTCATCCCCGTGCCACCGCCCAGGACCCCGAGGATTGTGAAGAAACCGGAGCCCCATCAGCCAGGGCCCGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507  GAGTTCATCCCCGTGCCACCGCCCAGGACCCCGAGGATTGTGAAGAAACCGGAGCCCCATCAGCCAGGGCCCGG  1580

Query 1629  AAGCACTGGCATCCCCCACAAGGAAGACCCCCTGATGCTGGACATGGTGCGCTCCTTCGAGTCTGTGGATCGCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  AAGCACTGGCATCCCCCACAAGGAAGACCCCCTGATGCTGGACATGGTGCGCTCCTTCGAGTCTGTGGATCGCG  1654

Query 1703  ACGACCACGTAGAAGTGCTGTCTCCCTCTCATCACTACAGGATTCTGAACTCCCCGGTCAGCTTGGCTCGCAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  ACGACCACGTAGAAGTGCTGTCTCCCTCTCATCACTACAGGATTCTGAACTCCCCGGTCAGCTTGGCTCGCAGA  1728

Query 1777  AATTCCAGCGAGAGGACGCTGTCCCCGGGTCTGCCATCCGGAAGCATGTCGCCTCTCCATACTCCTTTGCATCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729  AATTCCAGCGAGAGGACGCTGTCCCCGGGTCTGCCATCCGGAAGCATGTCGCCTCTCCATACTCCTTTGCATCC  1802

Query 1851  AACTCTGGTCTCTTTTGCTCACGAAGATAAGAACAGCCCCCCAAAAGAGGAGGGCCTGTGTTGCCCACCTCCGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803  AACTCTGGTCTCTTTTGCTCACGAAGATAAGAACAGCCCCCCAAAAGAGGAGGGCCTGTGTTGCCCACCTCCGG  1876

Query 1925  TTCCCAGCAATGGCCCCATGCAGCCTCTGGGGAGCCCCAATTGTGTGAAAAGCCGAGGCCGGTTCCCTATGATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  TTCCCAGCAATGGCCCCATGCAGCCTCTGGGGAGCCCCAATTGTGTGAAAAGCCGAGGCCGGTTCCCTATGATG  1950

Query 1999  GGCATCGGACAGATGTTAAGGAAGCGCCATCAGAGTCTGCAGCCATCTGCAGATAGGCCCCTGGAGGCCAGCCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951  GGCATCGGACAGATGTTAAGGAAGCGCCATCAGAGTCTGCAGCCATCTGCAGATAGGCCCCTGGAGGCCAGCCT  2024

Query 2073  GCCCCCACTGCAGCCCCTAGCCCCTGTGAACCTTGCCTTTGACATGGCCGATGGGGTCAAGACCCAGTGC  2142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025  GCCCCCACTGCAGCCCCTAGCCCCTGTGAACCTTGCCTTTGACATGGCCGATGGGGTCAAGACCCAGTGC  2094