Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487781
• Subject: NM_027874.2
• Aligned Length: 1227
• Identities: 1105
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGAGTCGGGAACAGGTACCGGCTGGGCCGGAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAGGGTCGGGAACAGGTACCGACTGGGCCGCAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT  74

Query   75  CGGTACGGACATTGCTGCAGGAGAAGAGGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACACCCTCAGCTCC  148
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CGGTACGGACATTGCTGCGGGAGAAGAAGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACATCCTCAGCTCC  148

Query  149  ACATTGAGAGCAAAATCTACAAGATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCCACCATCAGATGGTGCGGGGCAGAG  222
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  ACATTGAGAGCAAGATCTACAAAATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCTACCATCAGATGGTGTGGGGCTGAG  222

Query  223  GGGGACTACAACGTCATGGTGATGGAGCTGCTGGGGCCAAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGCTCCAGGAA  296
            |||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  GGGGACTACAATGTCATGGTGATGGAGCTACTGGGACCCAGCCTGGAAGACCTGTTCAACTTCTGTTCAAGGAA  296

Query  297  ATTCAGCCTCAAAACCGTCCTGCTGCTTGCTGACCAAATGATCAGTCGCATCGAATACATTCATTCAAAGAACT  370
            .||.||.||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  297  GTTTAGTCTCAAAACTGTTCTGTTGCTTGCTGACCAAATGATAAGTCGTATTGAGTACATTCATTCGAAGAATT  370

Query  371  TCATCCACCGGGATGTGAAGCCAGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTGTACATCATC  444
            |.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TTATCCACCGAGATGTGAAGCCAGATAACTTCCTCATGGGGCTGGGAAAGAAAGGCAACCTGGTCTACATCATT  444

Query  445  GACTTCGGGCTGGCCAAGAAGTACCGGGATGCACGCACCCACCAGCACATCCCCTATCGTGAGAACAAGAACCT  518
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTTGGGCTGGCCAAGAAGTATCGGGATGCACGCACCCACCAGCATATCCCCTATCGAGAGAACAAGAACCT  518

Query  519  CACGGGGACGGCGCGGTACGCCTCCATCAACACGCACCTTGGAATTGAACAATCCCGAAGAGATGACTTGGAGT  592
            |||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  519  CACAGGGACAGCACGCTATGCCTCCATCAACACGCACCTTGGCATTGAACAATCTCGAAGGGATGACTTGGAGT  592

Query  593  CTCTGGGCTACGTGCTAATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCTGCCACCAAGAGA  666
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  CTCTGGGGTACGTGCTGATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCCGCCACCAAGAGG  666

Query  667  CAGAAATACGAAAGGATTAGCGAGAAGAAAATGTCCACCCCCATCGAAGTGTTGTGTAAAGGCTACCCTTCCGA  740
            |||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  667  CAGAAGTATGAGAGGATCAGTGAGAAGAAGATGTCCACTCCCATTGAAGTGCTGTGCAAGGGCTATCCTTCTGA  740

Query  741  ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTGCGTTTTGACGACAAGCCTGACTACTCGTACCTGCGGCAGC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct  741  ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTACGTTTTGATGACAAACCTGACTACTCCTACCTGAGACAGC  814

Query  815  TTTTCCGGAATCTGTTCCATCGCCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT  888
            |.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTCAGAAATCTGTTCCATCGCCAAGGCTTCTCCTACGACTATGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT  888

Query  889  GCCAGCCGGGCCGCCGATGACGCCGAGCGGGAGCGCAGGGACCGAGAGGAGCGGCTGAGACACTCGCGGAACCC  962
            |||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.||..|.||||||||.|||||.||
Sbjct  889  GCCAGCCGGGCTGCAGATGATGCTGAGCGGGAACGCCGGGATCGAGAAGAACGATTAAGACACTCCCGGAATCC  962

Query  963  GGCTACCCGCGGCCTCCCTTCCACAGCCTCCGGCCGCCTGCGGGGGACGCAGGAAGTGGCTCCCCCCACACCCC  1036
            .||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  963  AGCCACTCGTGGCCTCCCTTCTACAGCTTCCGGCCGTCTGCGGGGAACCCAGGAAGTGGCTCCCCCAACGCCCC  1036

Query 1037  TCACCCCTACCTCACACACGGCTAACACCTCCCCCCGGCCCGTCTCCGGCATGGAGAGAGAGCGGAAAGTGAGT  1110
            |.||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||.|||||.||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TTACCCCTACCTCACACACGGCCAACACCTCTCCGAGGCCTGTCTCTGGCATGGAACGAGAACGGAAAGTGAGT  1110

Query 1111  ATGCGGCTGCACCGCGGGGCCCCCGTCAACATCTCCTCGTCCGACCTCACAGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT  1184
            ||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGCGGCTGCACCGTGGGGCCCCAGTCAACGTCTCCTCATCTGATCTCACGGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT  1184

Query 1185  GTCCACCTCACAGAATAGCATTCCTTTCGAACACCACGGCAAG  1227
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCCACCTCACAGAATAGCATTCCTTTCGAACACCACGGCAAG  1227