Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487785
• Subject: NM_001346489.2
• Aligned Length: 2694
• Identities: 2692
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT  74

Query   75  TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAATGAGGTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct   75  TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAGTGAGGTGG  148

Query  149  TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA  222

Query  223  TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT  296

Query  297  GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA  370

Query  371  TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT  444

Query  445  AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC  518

Query  519  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT  592

Query  593  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC  666

Query  667  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC  740

Query  741  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT  814

Query  815  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACGTGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATGCA  888

Query  889  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCCTT  962

Query  963  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGGCA  1036

Query 1037  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAGTC  1110

Query 1111  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTCGT  1184

Query 1185  GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCAATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTACCC  1258

Query 1259  AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGGTT  1332

Query 1333  ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGGCG  1406

Query 1407  CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCTAC  1480

Query 1481  AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTATC  1554

Query 1555  ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAGAA  1628

Query 1629  AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAATGA  1702

Query 1703  ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACACA  1776

Query 1777  CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAGCG  1850

Query 1851  GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCAGA  1924

Query 1925  AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACACG  1998

Query 1999  TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAATAA  2072

Query 2073  GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCATGG  2146

Query 2147  AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATCAC  2220

Query 2221  CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAACT  2294

Query 2295  TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGAGG  2368

Query 2369  CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGAGC  2442

Query 2443  AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGCAG  2516

Query 2517  AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAACC  2590

Query 2591  TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGGTT  2664

Query 2665  ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2694
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA  2694