Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487785
- Subject:
- XM_011248221.2
- Aligned Length:
- 2696
- Identities:
- 1953
- Gaps:
- 514
Alignment
Query 1 ATGCGTAAAGGGGTGCTGAAGGACCCAGAGATTGCCGATCTATTCTACAAAGATGATCCTGAGGAACTTTTTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGGTTTGCATGAAATTGGACATGGAAGTTTTGGAGCAGTTTATTTTGCTACAAATGCTCACACCAATGAGGTGG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGGCAATTAAGAAGATGTCCTATAGTGGGAAGCAGACCCATGAGAAATGGCAAGATATTCTTAAGGAAGTTAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTTTTACGACAATTGAAGCATCCTAATACTATTGAGTACAAAGGCTGTTACTTGAAAGAACACACTGCTTGGTT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGTGATGGAATATTGCTTAGGCTCAGCCTCTGATTTATTAGAAGTTCATAAAAAACCACTTCAGGAAGTGGAGA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCGCTGCCATTACTCATGGAGCCTTGCATGGACTAGCCTACCTACATTCTCATGCATTGATTCATAGGGATATT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 AAAGCAGGAAATATTCTTCTAACAGAGCCAGGTCAGGTAAAACTAGCTGATTTTGGATCTGCTTCAATGGCTTC 518
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGGCTTC 8
Query 519 TCCTGCCAACTCCTTCGTGGGCACACCTTACTGGATGGCTCCAGAGGTGATCTTAGCTATGGATGAAGGACAGT 592
|||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 9 TCCCGCCAACTCCTTTGTGGGGACTCCTTACTGGATGGCCCCAGAGGTAATCTTAGCTATGGACGAAGGGCAGT 82
Query 593 ATGATGGGAAAGTTGATATTTGGTCACTTGGCATCACTTGTATTGAATTGGCGGAACGGAAGCCGCCCCTTTTC 666
|.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 83 ACGACGGGAAAGTTGACATCTGGTCGCTTGGCATCACCTGCATAGAGTTGGCGGAGCGGAAGCCCCCCCTCTTC 156
Query 667 AACATGAATGCAATGAGTGCCTTATATCACATTGCCCAGAATGACTCCCCAACGTTACAGTCTAATGAATGGAC 740
||||||||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||.|||||||.|..||||||||
Sbjct 157 AACATGAACGCCATGAGCGCCCTCTACCACATCGCTCAGAATGACTCCCCCACGCTACAGTCCAGGGAATGGAC 230
Query 741 AGACTCCTTTAGGAGATTTGTTGATTACTGCTTGCAGAAAATACCTCAGGAAAGGCCAACATCAGCAGAACTAT 814
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|..|.|..||.||.|
Sbjct 231 AGACTCCTTCAGGAGATTCGTTGATTACTGCTTGCACAAAATACCTCAGGAAAGACCAGCCGCGGTGGAGCTGT 304
Query 815 TAAGGCATGACTTTGTTCGACGAGACCGGCCACTACG--TGTCCTCATTGACCTCATACAGAGGACAAAAGATG 886
|..||||||||||..||||..|.||.||||||| || .|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 305 TGCGGCATGACTTCATTCGGAGGGAGCGGCCAC--CGAAGGTCCTCATTGATCTCATACAGAGGACAAAAGATG 376
Query 887 CAGTTCGTGAGCTAGATAACCTACAGTACCGAAAAATGAAAAAAATACTTTTCCAAGAGACACGGAATGGACCC 960
|.||.||.|||||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 377 CTGTCCGAGAGCTGGACAACCTGCAGTACAGGAAAATGAAGAAGATCCTCTTCCAGGAGACTCGGAACGGACCC 450
Query 961 TTGAATGAGTCACAGGAGGATGAGGAAGACAGTGAACATGGAACCAGCCTGAACAGGGAAATGGACAGCCTGGG 1034
|||||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.||.||||.||.|||||||.|.||..|||||||.|||||
Sbjct 451 TTGAATGAGTCGCAAGAAGAAGAAGAAGATGGTGAGCAAGGAAGCAACCTGAACCGAGAGGTGGACAGTCTGGG 524
Query 1035 CAGCAACCATTCCATTCCAAGCATGTCCGTGAGCACAGGCAGCCAGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAAG 1108
|||||.|||.||||||||.||||..||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 525 CAGCATCCACTCCATTCCCAGCACATCAGTGAGCACAGGCAGCCGGAGCAGCAGTGTGAACAGCATGCAGGAGG 598
Query 1109 TCATGGACGAGAGCAGTTCCGAACTTGTCATGATGCACGATGACGAAAGCACAATCAATTCCAGCTCCTCCGTC 1182
|||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|||||..|||.||||||.|||||...
Sbjct 599 TCATGGATGAGAGCAGCTCTGAGCTCGTCATGATGCAGGAGGATGAAGGCACAGCCAACTCCAGCGCCTCCACG 672
Query 1183 GTGCATAAGAAAGATCATGTATTCATAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCAATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTAC 1256
||.||.|||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 673 GTACACAAGAAGGATCATGTATTCGTAAGGGATGAGGCGGGCCACGGCGATCCCAGGCCTGAGCCGCGGCCTAC 746
Query 1257 CCAGTCAGTTCAGAGCCAGGCCCTCCACTACCGGAACAGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCAGCATCTTTGG 1330
|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 747 CCAGTCAGTTCAGAGCCGGGCCCTCCACTATCGGAACCGAGAGCGCTTTGCCACGATCAAATCCGCGTCTTTGG 820
Query 1331 TTACACGACAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGTTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGG 1404
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 821 TTACACGGCAGATCCATGAGCATGAGCAGGAGAACGAGCTGCGGGAACAGATGTCAGGTTATAAGCGGATGCGG 894
Query 1405 CGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGACGAGCACCGCCTCAAGCT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 895 CGCCAGCACCAGAAGCAGCTGATCGCCCTGGAGAACAAGCTGAAGGCTGAGATGGATGAGCACCGCCTCAAGCT 968
Query 1479 ACAGAAGGAGGTGGAGACGCATGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTA 1552
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 969 CCAGAAGGAGGTGGAGACGCACGCCAACAACTCGTCCATCGAGCTGGAGAAGCTGGCCAAGAAGCAAGTGGCTA 1042
Query 1553 TCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCTGCAGCAGATGAGAAGAAGTTCCAGCAACAGATCTTGGCCCAGCAGAAG 1626
.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 1043 CCATAGAAAAGGAGGCAAAGGTAGCCGCAGCGGATGAGAAGAAGTTCCAGCAGCAGATCCTGGCCCAGCAGAAG 1116
Query 1627 AAAGATTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTATAAGATTTGTAAGGAAAAAATAAAAGAGGAAAT 1700
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1117 AAGGACTTGACAACTTTCTTAGAAAGTCAGAAGAAGCAGTACAAGATTTGTAAGGAGAAAATAAAAGAGGAAAT 1190
Query 1701 GAATGAGGACCATAGCACACCCAAGAAAGAGAAGCAAGAGCGGATCTCCAAACATAAAGAGAACTTGCAGCACA 1774
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1191 GAACGAGGACCATAGCACACCCAAGAAGGAGAAGCAGGAGCGGATATCGAAGCATAAAGAAAACCTGCAGCACA 1264
Query 1775 CACAGGCTGAAGAGGAAGCCCACCTTCTCACTCAACAGAGACTGTACTACGACAAAAATTGTCGTTTCTTCAAG 1848
|.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||.||.||||||||.
Sbjct 1265 CGCAGGCCGAGGAGGAAGCCCACCTGCTCACTCAACAGAGGCTGTACTACGACAGAAACTGCCGCTTCTTCAAA 1338
Query 1849 CGGAAAATAATGATCAAGCGGCACGAGGTGGAGCAGCAGAACATTCGGGAGGAACTAAATAAAAAGAGGACCCA 1922
||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct 1339 CGGAAAATAATGATCAAGCGCCACGAGGTGGAACAGCAGAACATTCGGGAGGAATTAAATAAGAAGAGGACCCA 1412
Query 1923 GAAGGAGATGGAGCATGCCATGCTAATCCGGCACGACGAGTCCACCCGAGAGCTAGAGTACAGGCAGCTGCACA 1996
||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1413 GAAGGAAATGGAGCACGCCATGCTGATCCGGCATGATGAATCCACCCGAGAGCTGGAGTACAGGCAGCTGCACA 1486
Query 1997 CGTTACAGAAGCTACGCATGGATCTGATCCGTTTACAGCACCAGACGGAACTGGAAAACCAGCTGGAGTACAAT 2070
|..|.||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1487 CCCTGCAGAAGCTCCGCATGGATCTGATCCGGCTGCAGCACCAGACGGAACTGGAGAACCAGCTGGAGTACAAT 1560
Query 2071 AAGAGGCGAGAAAGAGAACTGCACAGAAAGCATGTCATGGAACTTCGGCAACAGCCAAAAAACTTAAAGGCCAT 2144
||||||||.||..|.||.||||||.|.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1561 AAGAGGCGGGAGCGGGAGCTGCACCGGAAGCACGTCATGGAGCTTCGGCAACAGCCGAAAAACTTAAAGGCCAT 1634
Query 2145 GGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTATAAAGCACTCAAGAATC 2218
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1635 GGAAATGCAAATTAAAAAACAGTTTCAGGACACTTGCAAAGTACAGACCAAACAGTACAAAGCCCTCAAAAATC 1708
Query 2219 ACCAGTTGGAAGTTACTCCAAAGAATGAGCACAAAACAATCTTAAAGACACTGAAAGATGAGCAGACAAGAAAA 2292
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 1709 ACCAGTTGGAAGTCACTCCAAAGAATGAGCACAAAGCAATCCTAAAGACACTGAAGGACGAGCAGACGAGGAAG 1782
Query 2293 CTTGCCATTTTGGCAGAGCAGTATGAACAGAGTATAAATGAAATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGATGA 2366
||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1783 CTGGCCATTTTGGCCGAGCAGTATGAACAGAGTATAAACGAGATGATGGCCTCTCAAGCGTTACGGCTAGACGA 1856
Query 2367 GGCTCAAGAAGCAGAATGCCAGGCCTTGAGGCTACAGCTCCAGCAGGAAATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGA 2440
|||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857 GGCACAAGAGGCAGAGTGCCAGGCCTTGAGACTACAGCTCCAGCAGGAGATGGAGCTGCTCAACGCCTACCAGA 1930
Query 2441 GCAAAATCAAGATGCAAACAGAGGCACAACATGAACGTGAGCTCCAGAAGCTAGAGCAGAGAGTGTCTCTGCGC 2514
|||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1931 GCAAAATCAAGATGCAAACGGAGGCCCAGCACGAGCGCGAGCTACAGAAGCTAGAGCAGAGGGTGTCCCTGCGC 2004
Query 2515 AGAGCACACCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTTCAGAAGGAACGCAGCGAGAGAATAAAGAA 2588
|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||.
Sbjct 2005 AGAGCGCATCTTGAGCAGAAGATTGAAGAGGAGCTGGCTGCCCTGCAGAAGGAACGCAGTGAGAGGATCAAGAC 2078
Query 2589 CCTATTGGAAAGGCAAGAGCGAGAGATTGAAACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGATTTGGGAATTTGG 2662
.||..||||.||.|||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2079 TCTCCTGGAGAGACAAGAGCGAGAGACCGAGACTTTTGACATGGAGAGCCTCAGAATGGGCTTTGGGAATTTGG 2152
Query 2663 TTACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTACAGA 2694
|.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2153 TGACATTAGATTTTCCTAAGGAGGACTATAGA 2184