Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487786
- Subject:
- NM_001267846.1
- Aligned Length:
- 2248
- Identities:
- 1775
- Gaps:
- 332
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGTGGACGCCGGAGCATGCCCAGTGGCCAGAACAGCACTTTGACATCACCTCGACCACTCGGTCTCCCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCACAAAGTTGAAGCCTATAGAGGTCATTTACAGCGCACCTACCAGTATGCCTGGGCGAATGATGACATATCTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTCTGACTGCGTCCAACCTTCTGAAAAAATATGCAGAGAAGTATTCTGGCATTTTGGAAGGTCCCGTAGACCGA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCTGTACTCAGCAATTATTCAGACACACCATCAGGACTCGTGAATGGTCGGAAAAATGATAGCGAACCCTGGCA 296
Query 1 -------------------------------ATGAACTGTGTTCCGGATGTTATCACTGCCAGCAAAGCTGGAG 43
|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 GCCTTCCTTGAATTCAGAAGCCGTTTATCCTATGAACTGTGTCCCGGATGTCATCACTGCCAGCAAAGCTGGTG 370
Query 44 TCAGTTCAGCCCTCCCTCCAGCAGATGTCTCTGCGAGTATAGGAAGCTCTCCTGGGGTAGCCAGCAACCTGACA 117
||||.||||||||||||||||.|||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371 TCAGCTCAGCCCTCCCTCCAGTAGACGTCTCGGCAAGTATAGGGAGCTCCCCTGGGGTGGCCAGCAACCTGACA 444
Query 118 GAACCTAGTTATTCAAGTAGTACCTGTGGAAGCCACACTGTACCCAGTCTTCATGCAGGGCTCCCATCTCAGGA 191
||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGCCAAGTTACTCAAGTAGTACCTGTGGAAGCCACACAGTACCTAGTCTTCATGCGGGGCTCCCATCTCAGGA 518
Query 192 ATATGCCCCAGGATACAACGGATCATATTTGCATTCTACTTATAGTAGCCA-GCCAGCACCTGCACTTCCTTCA 264
||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||| |||| ||||||||||||||||.
Sbjct 519 ATATGCTCCGGGATACAACGGCTCATATTTGCATTCTACCTACAGCAGCCAGGCCA-CACCTGCACTTCCTTCG 591
Query 265 CCTCATCCGTCTCCTTTGCATAGCTCTGGGCTACTACAGCCCCCACCACCACCTCCTCCGCCACCAGCCTTGGT 338
|||||||||||.||.||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 592 CCTCATCCGTCCCCGTTGCATAGTTCTGGGCTTTTGCAGCCACCACCCCCTCCTCCTCCCCCACCAGCCCTGGT 665
Query 339 CCCAGGCTACAATGGGACTTCTAACCTCTCCAGTTACAGCTATCCGTCTGCTAGCTATCCTCCTCAGACTGCTG 412
||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666 CCCAGGCTACAACGGGACTTCCAATCTCTCCAGTTACAGTTATCCCTCTGCTAGCTATCCTCCTCAGACTGCCG 739
Query 413 TGGGGTCTGGGTACAGCCCTGGGGGGGCACCGCCTCCGCCTTCAGCGTACCTGCCTTCAGGAATTCCTGCTCCC 486
||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 TGGGGTCTGGGTACAGCCCTGGCGGAGCACCCCCTCCTCCTTCAGCATACCTGCCTTCAGGAATTCCTGCTCCC 813
Query 487 ACCCCCCTACCCCCCACCACTGTTCCTGGCTACACCTACCAGGGCCATGGTTTGACACCTATTGCACCGTCGGC 560
|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 814 ACCCCTCTGCCCCCCACTACCGTTCCTGGCTACACCTACCAAGGTCATGGTTTGACACCCATTGCACCCTCTGC 887
Query 561 TCTGACAAACAGTTCAGCAAGTTCTCTCAAAAGGAAAGCTTTCTACATGGCAGGGCAAGGAGATATGGACTCCA 634
||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 888 TCTGACCAACAATTCAGCAAGTTCTCTCAAAAGGAAAGCTTTCTATATGGCAGGGCAAGGAGACATGGACTCCA 961
Query 635 GTTATGGAAATTACAGCTATGGCCAACAGAGATCTACACAGAGTCCTATGTACAGAATGCCCGACAACAGCATT 708
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTTACGGAAATTACAGCTATGGCCAACAGAGATCGACACAGAGTCCTATGTACCGAATGCCCGACAACAGCATT 1035
Query 709 TCAAACACAAATCGGGGGAATGGCTTTGACAGAAGTGCTGAAACATCATCCTTAGCATTTAAGCCAACGAAGCA 782
||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1036 TCAAACTCGAATCGGGGGAATGGCTTTGACAGAAATGCTGAAACATCATCCTTAGCATTTAAGCCAACAAAGCA 1109
Query 783 GCTAATGTCCTCTGAACAGCAAAGGAAATTCAGCAGCCAGTCCAGTAGGGCTCTGACCCCTCCTTCCTACAGTA 856
|||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1110 GCTGATGCCCTCTGAGCAGCAAAGGAAATTCAGCAGCCAGTCCAGTAGGGCTCTGACCCCTCCTTCCTATAGTA 1183
Query 857 CTGCTAAAAATTCATTGGGATCAAGATCCAGTGAATCCTTTGGGAAGTACACATCGCCAGTAATGAGTGAGCAT 930
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1184 CTGCTAAAAATTCATTGGGATCAAGGTCCAGTGAATCCTTTGGGAAGTATACGTCGCCAGTCATGAGTGAGCAC 1257
Query 931 GGGGACGAGCACAGGCAGCTCCTCTCTCACCCAATGCAAGGCCCTGGACTCCGTGCAGCTACCTCATCCAACCA 1004
||.|||||.||..|||||||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GGAGACGACCATCGGCAGCTCCTCGCTCATCCAATACAAGGTCCCGGACTCCGTGCAGCTACCTCATCCAACCA 1331
Query 1005 CTCTGTGGACGAGCAACTGAAGAATACTGACACGCACCTCATCGACCTGGTAACCAATGAGATTATCACCCAAG 1078
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1332 CTCTGTGGACGAGCAACTGAAGAATACTGACACACACCTCATTGACCTGGTCACCAATGAGATCATCACCCAAG 1405
Query 1079 GACCTCCAGTGGACTGGAATGACATTGCTGGTCTCGACCTGGTGAAGGCTGTCATTAAAGAGGAGGTTTTATGG 1152
|||||||.||||||||||..|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1406 GACCTCCTGTGGACTGGAGCGACATAGCTGGTCTTGACCTGGTGAAGGCGGTTATTAAGGAGGAGGTTTTGTGG 1479
Query 1153 CCAGTGTTGAGGTCAGACGCGTTCAGTGGACTGACGGCCTTACCTCGGAGCATCCTTTTATTTGGACCTCGGGG 1226
||||||.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||.|.|||||||||.|.||.|||||||||||
Sbjct 1480 CCAGTGCTGAGGTCAGATGCATTCAGTGGGCTGACCGCCTTACCTAGAAGCATCCTTCTCTTCGGACCTCGGGG 1553
Query 1227 GACAGGCAAAACATTATTGGGCAGATGCATCGCTAGTCAGCTGGGGGCCACATTTTTCAAAATTGCCGGTTCTG 1300
.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1554 TACAGGCAAAACACTTTTGGGCAGATGCATAGCTAGTCAGCTAGGGGCCACGTTTTTCAAAATTGCCGGTTCCG 1627
Query 1301 GACTAGTCGCCAAGTGGTTAGGAGAAGCAGAGAAAATTATCCATGCCTCTTTTCTTGTGGCCAGGTGTCGCCAG 1374
||||.||.||.||||||.||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 GACTCGTTGCAAAGTGGATAGGAGAAGCGGAGAAAATCATCCACGCCTCTTTTCTTGTGGCCAGGTGTCGCCAG 1701
Query 1375 CCCTCGGTGATTTTTGTTAGTGACATTGACATGCTTCTCTCCTCTCAAGTGAATGAGGAACATAGTCCAGTCAG 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||
Sbjct 1702 CCCTCGGTGATTTTTGTTAGTGACATTGACATGCTTCTCTCCTCTCAAGTGAGCGAGGAACACAGTCCAGTCAG 1775
Query 1449 TCGGATGAGAACCGAATTTCTGATGCAACTGGACACTGTACTAACTTCGGCTGAGGACCAAATCGTAGTAATTT 1522
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1776 TCGGATGAGAACCGAATTTCTGATGCAGCTGGACACTGTACTGACTTCGGCTGAGGACCAAATCGTAGTCATTT 1849
Query 1523 GTGCCACCAGTAAACCAGAAGAAATAGATGAATCCCTTCGGAGGTACTTCATGAAACGACTTTTAATCCCACTT 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1850 GTGCCACCAGTAAACCAGAAGAAATAGATGAATCTCTTCGGAGGTACTTCATGAAAAGACTTTTAATCCCACTT 1923
Query 1597 CCTGACAGCACAGCGAGGCACCAGATAATAGTACAACTGCTCTCACAGCACAATTACTGTCTCAATGACAAGGA 1670
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 CCTGACAGCACAGCGAGGCACCAGATAATAGTACAGCTGCTCACACAGCACAATTACTGTCTCAATGACAAGGA 1997
Query 1671 GTTTGCACTGCTCGTCCAGCGCACAGAAGGCTTTTCTGGACTAGATGTGGCTCATTTGTGTCAGGAAGCAGTGG 1744
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1998 GTTTGCACTGCTTGTCCAGCGCACAGAAGGCTTTTCTGGACTAGACGTGGCTCATTTGTGTCAGGAAGCAGCAG 2071
Query 1745 TGGGCCCCCTCCATGCCATGCCAGCCACAGACCTTTCAGCCATTATGCCCAGCCAGTTGAGGCCCGTTACATAT 1818
||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2072 TGGGACCTCTCCATGCTATGCCAGCTACAGACCTTTCAGCCATTATGCCCAGCCAGTTAAGGCCCGTTACATAT 2145
Query 1819 CAAGACTTTGAAAATGCTTTCTGCAAGATTCAGCCTAGCATATCTCAAAAGGAGCTTGATATGTATGTTGAATG 1892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CAAGACTTTGAAAATGCTTTCTGCAAGATTCAGCCTAGCATATCTCAAAAAGAGCTTGATATGTATGTTGAATG 2219
Query 1893 GAACAAAATGTTTGGTTGCAGTCAGTTG 1920
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 GAACAAAATGTTTGGTTGCAGTCAG--- 2244