Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487786
• Subject: XM_017004419.1
• Aligned Length: 2358
• Identities: 1917
• Gaps: 441

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGAGTTGGATTATGGAATGACCTGCTATGTCTGTGTCATATTGTTCTGCGCAGGGAGCATTATACTGTGCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AACTAGGTGTTCAGTACCAAATAAGAGAGGCTTGAAGATGCAGTGGACGCCAGAGCATGCCCAGTGGCCAGAAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCACTTTGACATCACCTCAACCACTCGGTCTCCTGCCCACAAAGTTGAAGCCTACAGAGGTCATCTGCAGCGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  ACCTATCAGTACGCCTGGGCGAATGATGACATATCTGCTCTGACTGCATCCAACCTACTAAAAAAATATGCAGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GAAGTATTCCGGCATTTTGGAAGGTCCTGTGGACCGACCCGTACTCAGCAACTATTCGGACACACCATCAGGAC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGAAC  6
                                                                                ||||||
Sbjct  371  TAGTGAACGGTCGGAAAAATGAAAGTGAACCCTGGCAGCCTTCCTTGAATTCAGAAGCTGTTTATCCCATGAAC  444

Query    7  TGTGTTCCGGATGTTATCACTGCCAGCAAAGCTGGAGTCAGTTCAGCCCTCCCTCCAGCAGATGTCTCTGCGAG  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGTTCCGGATGTTATCACTGCCAGCAAAGCTGGAGTCAGTTCAGCCCTCCCTCCAGCAGATGTCTCTGCGAG  518

Query   81  TATAGGAAGCTCTCCTGGGGTAGCCAGCAACCTGACAGAACCTAGTTATTCAAGTAGTACCTGTGGAAGCCACA  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATAGGAAGCTCTCCTGGGGTAGCCAGCAACCTGACAGAACCTAGTTATTCAAGTAGTACCTGTGGAAGCCACA  592

Query  155  CTGTACCCAGTCTTCATGCAGGGCTCCCATCTCAGGAATATGCCCCAGGATACAACGGATCATATTTGCATTCT  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGTACCCAGTCTTCATGCAGGGCTCCCATCTCAGGAATATGCCCCAGGATACAACGGATCATATTTGCATTCT  666

Query  229  ACTTATAGTAGCCAGCCAGCACCTGCACTTCCTTCACCTCATCCGTCTCCTTTGCATAGCTCTGGGCTACTACA  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTTATAGTAGCCAGCCAGCACCTGCACTTCCTTCACCTCATCCGTCTCCTTTGCATAGCTCTGGGCTACTACA  740

Query  303  GCCCCCACCACCACCTCCTCCGCCACCAGCCTTGGTCCCAGGCTACAATGGGACTTCTAACCTCTCCAGTTACA  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCCCCACCACCACCTCCTCCGCCACCAGCCTTGGTCCCAGGCTACAATGGGACTTCTAACCTCTCCAGTTACA  814

Query  377  GCTATCCGTCTGCTAGCTATCCTCCTCAGACTGCTGTGGGGTCTGGGTACAGCCCTGGGGGGGCACCGCCTCCG  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCTATCCGTCTGCTAGCTATCCTCCTCAGACTGCTGTGGGGTCTGGGTACAGCCCTGGGGGGGCACCGCCTCCG  888

Query  451  CCTTCAGCGTACCTGCCTTCAGGAATTCCTGCTCCCACCCCCCTACCCCCCACCACTGTTCCTGGCTACACCTA  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTTCAGCGTACCTGCCTTCAGGAATTCCTGCTCCCACCCCCCTACCCCCCACCACTGTTCCTGGCTACACCTA  962

Query  525  CCAGGGCCATGGTTTGACACCTATTGCACCGTCGGCTCTGACAAACAGTTCAGCAAGTTCTCTCAAAAGGAAAG  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGGGCCATGGTTTGACACCTATTGCACCGTCGGCTCTGACAAACAGTTCAGCAAGTTCTCTCAAAAGGAAAG  1036

Query  599  CTTTCTACATGGCAGGGCAAGGAGATATGGACTCCAGTTATGGAAATTACAGCTATGGCCAACAGAGATCTACA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTTTCTACATGGCAGGGCAAGGAGATATGGACTCCAGTTATGGAAATTACAGCTATGGCCAACAGAGATCTACA  1110

Query  673  CAGAGTCCTATGTACAGAATGCCCGACAACAGCATTTCAAACACAAATCGGGGGAATGGCTTTGACAGAAGTGC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAGTCCTATGTACAGAATGCCCGACAACAGCATTTCAAACACAAATCGGGGGAATGGCTTTGACAGAAGTGC  1184

Query  747  TGAAACATCATCCTTAGCATTTAAGCCAACGAAGCAGCTAATGTCCTCTGAACAGCAAAGGAAATTCAGCAGCC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAACATCATCCTTAGCATTTAAGCCAACGAAGCAGCTAATGTCCTCTGAACAGCAAAGGAAATTCAGCAGCC  1258

Query  821  AGTCCAGTAGGGCTCTGACCCCTCCTTCCTACAGTACTGCTAAAAATTCATTGGGATCAAGATCCAGTGAATCC  894
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTCCAGTAGGGCTCTGACCCCTCCTTCCTACAGTACTGCTAAAAATTCATTGGGATCAAGATCCAGTGAATCC  1332

Query  895  TTTGGGAAGTACACATCGCCAGTAATGAGTGAGCATGGGGACGAGCACAGGCAGCTCCTCTCTCACCCAATGCA  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGGGAAGTACACATCGCCAGTAATGAGTGAGCATGGGGACGAGCACAGGCAGCTCCTCTCTCACCCAATGCA  1406

Query  969  AGGCCCTGGACTCCGTGCAGCTACCTCATCCAACCACTCTGTGGACGAGCAACTGAAGAATACTGACACGCACC  1042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGCCCTGGACTCCGTGCAGCTACCTCATCCAACCACTCTGTGGACGAGCAACTGAAGAATACTGACACGCACC  1480

Query 1043  TCATCGACCTGGTAACCAATGAGATTATCACCCAAGGACCTCCAGTGGACTGGAATGACATTGCTGGTCTCGAC  1116
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCATCGACCTGGTAACCAATGAGATTATCACCCAAGGACCTCCAGTGGACTGGAATGACATTGCTGGTCTCGAC  1554

Query 1117  CTGGTGAAGGCTGTCATTAAAGAGGAGGTTTTATGGCCAGTGTTGAGGTCAGACGCGTTCAGTGGACTGACGGC  1190
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGGTGAAGGCTGTCATTAAAGAGGAGGTTTTATGGCCAGTGTTGAGGTCAGACGCGTTCAGTGGACTGACGGC  1628

Query 1191  CTTACCTCGGAGCATCCTTTTATTTGGACCTCGGGGGACAGGCAAAACATTATTGGGCAGATGCATCGCTAGTC  1264
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTACCTCGGAGCATCCTTTTATTTGGACCTCGGGGGACAGGCAAAACATTATTGGGCAGATGCATCGCTAGTC  1702

Query 1265  AGCTGGGGGCCACATTTTTCAAAATTGCCGGTTCTGGACTAGTCGCCAAGTGGTTAGGAGAAGCAGAGAAAATT  1338
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGCTGGGGGCCACATTTTTCAAAATTGCCGGTTCTGGACTAGTCGCCAAGTGGTTAGGAGAAGCAGAGAAAATT  1776

Query 1339  ATCCATGCCTCTTTTCTTGTGGCCAGGTGTCGCCAGCCCTCGGTGATTTTTGTTAGTGACATTGACATGCTTCT  1412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATCCATGCCTCTTTTCTTGTGGCCAGGTGTCGCCAGCCCTCGGTGATTTTTGTTAGTGACATTGACATGCTTCT  1850

Query 1413  CTCCTCTCAAGTGAATGAGGAACATAGTCCAGTCAGTCGGATGAGAACCGAATTTCTGATGCAACTGGACACTG  1486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTCCTCTCAAGTGAATGAGGAACATAGTCCAGTCAGTCGGATGAGAACCGAATTTCTGATGCAACTGGACACTG  1924

Query 1487  TACTAACTTCGGCTGAGGACCAAATCGTAGTAATTTGTGCCACCAGTAAACCAGAAGAAATAGATGAATCCCTT  1560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TACTAACTTCGGCTGAGGACCAAATCGTAGTAATTTGTGCCACCAGTAAACCAGAAGAAATAGATGAATCCCTT  1998

Query 1561  CGGAGGTACTTCATGAAACGACTTTTAATCCCACTTCCTGACAGCACAGCGAGGCACCAGATAATAGTACAACT  1634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGAGGTACTTCATGAAACGACTTTTAATCCCACTTCCTGACAGCACAGCGAGGCACCAGATAATAGTACAACT  2072

Query 1635  GCTCTCACAGCACAATTACTGTCTCAATGACAAGGAGTTTGCACTGCTCGTCCAGCGCACAGAAGGCTTTTCTG  1708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCTCTCACAGCACAATTACTGTCTCAATGACAAGGAGTTTGCACTGCTCGTCCAGCGCACAGAAGGCTTTTCTG  2146

Query 1709  GACTAGATGTGGCTCATTTGTGTCAGGAAGCAGTGGTGGGCCCCCTCCATGCCATGCCAGCCACAGACCTTTCA  1782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GACTAGATGTGGCTCATTTGTGTCAGGAAGCAGTGGTGGGCCCCCTCCATGCCATGCCAGCCACAGACCTTTCA  2220

Query 1783  GCCATTATGCCCAGCCAGTTGAGGCCCGTTACATATCAAGACTTTGAAAATGCTTTCTGCAAGATTCAGCCTAG  1856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GCCATTATGCCCAGCCAGTTGAGGCCCGTTACATATCAAGACTTTGAAAATGCTTTCTGCAAGATTCAGCCTAG  2294

Query 1857  CATATCTCAAAAGGAGCTTGATATGTATGTTGAATGGAACAAAATGTTTGGTTGCAGTCAGTTG  1920
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 2295  CATATCTCAAAAGGAGCTTGATATGTATGTTGAATGGAACAAAATGTTTGGTTGCAGTCAG---  2355