Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487793
- Subject:
- NM_008696.2
- Aligned Length:
- 3931
- Identities:
- 3169
- Gaps:
- 410
Alignment
Query 1 ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT 74
||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT 74
Query 75 TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 75 TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC 148
Query 149 TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG 222
||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 149 TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG 222
Query 223 AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA 296
||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA 296
Query 297 CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA 370
Query 371 CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 371 CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC 444
Query 445 GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG 518
||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG 518
Query 519 TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG 592
|||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 519 TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG 592
Query 593 AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA 666
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 593 AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA 666
Query 667 GCCATTGAGATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG 740
|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 667 GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG 740
Query 741 AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA 814
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 741 AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA 814
Query 815 AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG 888
Query 889 CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA 962
||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 889 CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA 962
Query 963 TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG 1036
.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 963 CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG 1036
Query 1037 TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT 1110
|||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037 TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG 1110
Query 1111 CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG 1184
||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111 CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG 1184
Query 1185 ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA 1258
.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185 GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA 1258
Query 1259 GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG 1332
|.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259 GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG 1332
Query 1333 CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG 1406
||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG 1406
Query 1407 GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC 1480
|||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC 1480
Query 1481 T-----------GGAGTGCCG-ATG----------------------GCGGGAGATGG--AGGAGCA------- 1511
| |||| |||| |.| ||.|.||..|| |||||||
Sbjct 1481 TGCACGACCACAGGAG-GCCGCACGCACAGCAGCAGCCGCCGCCCCCGCAGCAGCAGGACAGGAGCAAACCGAG 1553
Query 1512 ----------------------------------CCGGCAGGCAGAGAGGCTCCAGAGG--CAGTTG---CA-- 1544
||.||.|.|||| ||||..|||| ||||.| ||
Sbjct 1554 CTTTCATGCTCCAGAGCCCAAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGA---GCTCGGGAGGTACAGTGGTCCCACC 1624
Query 1545 ---------ACAAGAACAAGCATATCT--CCTGTCT-------------CTACAGCATGACC----------AT 1584
.|||||||| ||.||| ||||||| ||.||| ||||| ||
Sbjct 1625 TGGCATCTCTCAAGAACA---ATGTCTCCCCTGTCTCGAGATCCCATTCCTTCAG--TGACCCTTCTCCCAAAT 1693
Query 1585 AGGAGGCCGCACCCGCAGCA------CTCGCAGCAGCC---GCCACC--ACCGCAGCAGGAAAGGAGC-AAGCC 1646
.|||||.| ||.|| |||.|||.|.|| .||||| .||||| |..|||.|| .||.|
Sbjct 1694 ------TCGCACAC-CACCATCTCCGCTCTCAGGACCCATGTCCACCTTCCCGCA----GTGAGGGGCTCAGTC 1756
Query 1647 A-AGCT-----TCCA---------TGCTCCCGAGCCCAAAGCCCA-----CT-------------------ACG 1681
| |||| ||.| || |||||||||| |||| || |||
Sbjct 1757 AGAGCTCTGACTCTAAGTCGGAGGTG--CCCGAGCCCA---CCCAAAAGGCTTGGTCTAGATCAGACAGTGACG 1825
Query 1682 A---GCCTGCTGACCGAGCGCGAGAGGTTCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGAT 1752
| |||| ||.|| ||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1826 AGGTGCCT-----CCAAG-------GGTTCCCGTGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGAT 1887
Query 1753 TCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCAGCAGAATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAG 1826
|||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1888 TCCCCACTGCAGGGCGGTGGACAGCAGAATAGCCAAGCAGGACAGAGAAATTCCACCAGCAGTATTGAGCCCCG 1961
Query 1827 GCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGAAGCTGGTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAG 1900
||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1962 GCTTCTTTGGGAGAGAGTGGAAAAGCTGGTCCCCAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAG 2035
Query 1901 GATCCCAGCCCGGGTCTCACCCTGGGTCTCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAG 1974
||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2036 GATCCCAGCCTGGCTCCCATCCTGGGTCTCAGAGCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAG 2109
Query 1975 TCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCGCCTGGAAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACC 2048
||||||||.||||||||.|..||||.|||||.|||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||
Sbjct 2110 TCTGAAGGTTCTCCATCGCCACGCCAGGAAAGTGCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCC 2183
Query 2049 CCTCAAGCCTGC---------TGATCTGACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCAC 2113
.||||||||||| .||..||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2184 TCTCAAGCCTGCGGGAGAAGTGGACTTGACTGCGTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCAC 2257
Query 2114 CTCACAAAGTAACGGACTACTCCTCATCCAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAG 2187
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2258 CTCACAAAGTAACAGACTACTCATCCTCCAGTGAGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAA 2331
Query 2188 CAGGAAGGGGCTGACGAGTCCACCTCAGGACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGG 2261
|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||
Sbjct 2332 CAGGAGGGGGCTGATGATTCTACCTCGGGACCAGAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGG 2405
Query 2262 TGAAACGGAATCTGTGAAAACCATGATTGTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGG 2335
||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 2406 TGAAACAGAATCTGTGAAAACAATGATCGTTCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGG 2479
Query 2336 AGGGCACTCTAATCGTCCGCCAGAGTACAGTTGACCAAAAGCGTGCCAGCCATCATGAGAGCAATGGCTTTGCC 2409
|||||||.||.||||||||||
Sbjct 2480 AGGGCACCCTCATCGTCCGCC----------------------------------------------------- 2500
Query 2410 GGTCGCATTCACCTCTTGCCAGATCTCTTACAGCAAAGCCATTCCTCCTCCACTTCCTCCACCTCCTCCTCCCC 2483
Sbjct 2501 -------------------------------------------------------------------------- 2500
Query 2484 ATCCTCCAGCCAGCCGACACCCACCATGTCCCCACAGACACCCCAGGACAAGCTCACTGCTAATGAGACTCAGT 2557
|||||||||
Sbjct 2501 -----------------------------------------------------------------AGACTCAGT 2509
Query 2558 CCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTACAG 2631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2510 CCGCTAGTAGCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTACAG 2583
Query 2632 ATTTCTCCATCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCCAT 2705
||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2584 ATCTCTCCATCTAGTGGGACGACAGTGACTTCCGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCCAT 2657
Query 2706 AAGGCAAGATCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACACCC 2779
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2658 AAGGCAAGATCCTACTCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATACCC 2731
Query 2780 CGGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGCTA 2853
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 2732 CCGAGATTCGTAAATACAAGAAGAGATTTAACTCAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGCTG 2805
Query 2854 GTGGGTACAGAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGAAG 2927
||.|||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.||||||
Sbjct 2806 GTTGGTACAGAGAGCGGTCTGATGCTCTTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGAAG 2879
Query 2928 ACGATTTCAACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTAC 3001
|||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880 ACGGTTCCAGCAAATGGATGTGCTCGAAGGCCTAAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTAC 2953
Query 3002 GTGTCTACTATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGATGG 3075
|||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 2954 GTGTCTACTATTTATCCTGGCTAAGAAATAAGATTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGTGG 3027
Query 3076 ACAACCGTAGGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTGAT 3149
||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 3028 ACCACTGTGGGCGACTTGGAAGGGTGCGTGCACTATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTAAT 3101
Query 3150 TGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCAT 3223
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3102 TGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAGTCTATGCATGGGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCAT 3175
Query 3224 TTGGAGAATTGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTAT 3297
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3176 TTGGAGAACTGCTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTAT 3249
Query 3298 GGATCCTGTGCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATAT 3371
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3250 GGATCCTGTGCGGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATAT 3323
Query 3372 CCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATACAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATG 3445
.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 3324 TCAGTGTAGCATCAAACCCCATGCAATCATTATCCTCCCCAACACGGATGGGATGGAGCTGCTGGTGTGCTACG 3397
Query 3446 AAGATGAGGGGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAGGATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCT 3519
||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3398 AAGACGAGGGGGTTTACGTTAACACGTACGGAAGGATCACCAAGGACGTGGTTCTGCAGTGGGGAGAGATGCCG 3471
Query 3520 ACATCAGTAGCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGA 3593
|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3472 ACATCTGTAGCATATATCCGGTCGAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCAATAGAGATACGATCTGTGGA 3545
Query 3594 AACTGGTCACTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACA 3667
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 3546 AACTGGTCACTTGGATGGTGTATTTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACTAAAGTTCCTGTGTGAACGCAATGACA 3619
Query 3668 AGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTT 3741
||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3620 AGGTGTTCTTTGCCTCCGTCCGCTCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTT 3693
Query 3742 CTGAGCTGG 3750
|||||||||
Sbjct 3694 CTGAGCTGG 3702