Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487793
• Subject: XM_006496045.1
• Aligned Length: 3922
• Identities: 3120
• Gaps: 461

Alignment

Query    1  ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT  74
            ||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT  74

Query   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC  148

Query  149  TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG  222
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG  222

Query  223  AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296
            ||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296

Query  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370

Query  371  CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC  444

Query  445  GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG  518

Query  519  TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG  592
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG  592

Query  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA  666

Query  667  GCCATTGAGATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG  740
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG  740

Query  741  AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA  814
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA  814

Query  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG  888

Query  889  CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA  962
            ||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA  962

Query  963  TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG  1036
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG  1036

Query 1037  TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT  1110
            |||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG  1110

Query 1111  CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG  1184
            ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG  1184

Query 1185  ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA  1258
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA  1258

Query 1259  GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG  1332
            |.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259  GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG  1332

Query 1333  CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG  1406
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG  1406

Query 1407  GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480
            |||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480

Query 1481  TGGAGTGCCGATGGCGGGAGATGGAGGAGCACCGGCAGGCAGAGAGGCTCCAGAGGCAGTTGCAACAAGAACAA  1554
            |                                                                         
Sbjct 1481  T-------------------------------------------------------------------------  1481

Query 1555  GCATATCTCCTGTCTCTACAGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCA  1628
                                |||.|||||.||||||||||||.|.|||||   |||||.||||||.||.|.|||
Sbjct 1482  --------------------GCACGACCACAGGAGGCCGCACGCACAGCA---GCAGCCGCCGCCCCCGCAGCA  1532

Query 1629  GCAGGAAAGGAGCAAGCCAAGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCC-CACTACGAGCCTGCTGACCGAGC----  1697
            ||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||| ||||| |||||.||.|||||||||.||||    
Sbjct 1533  GCAGGACAGGAGCAAACCGAGCTTTCATGCTCCAGAGCCC-AAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGAGCTCGG  1605

Query 1698  --------------------------------------------------------------------------  1697
                                                                                      
Sbjct 1606  GAGGTGGAAGATAGATTTAGAAAGACTAACCACAGCTCCCCTGAGGCCCAGGCTAAGCAAACGGGCAGAGGACT  1679

Query 1698  --------------------------------------------------------------------------  1697
                                                                                      
Sbjct 1680  GGAGCCACCCGTGCCTTCCCGGTCAGAGTCTTTTTCCAATGGCAACTCCGAGTCTGTGCACCCTGCCCTGCAGA  1753

Query 1698  ----------GCGAGAGGTTCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTG  1761
                      ||.|.|||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1754  GACCAGCGGAGCCACAGGTTCCCGTGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGATTCCCCACTG  1827

Query 1762  CAGGGCAGTGGGCAGCAGAATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTG  1835
            ||||||.||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1828  CAGGGCGGTGGACAGCAGAATAGCCAAGCAGGACAGAGAAATTCCACCAGCAGTATTGAGCCCCGGCTTCTTTG  1901

Query 1836  GGAGAGAGTGGAGAAGCTGGTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGC  1909
            ||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1902  GGAGAGAGTGGAAAAGCTGGTCCCCAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGC  1975

Query 1910  CCGGGTCTCACCCTGGGTCTCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGC  1983
            |.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1976  CTGGCTCCCATCCTGGGTCTCAGAGCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGT  2049

Query 1984  TCTCCATCTCAGCGCCTGGAAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCC  2057
            ||||||||.|..||||.|||||.|||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.||||||||
Sbjct 2050  TCTCCATCGCCACGCCAGGAAAGTGCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCCTCTCAAGCC  2123

Query 2058  TGC---------TGATCTGACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAG  2122
            |||         .||..||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2124  TGCGGGAGAAGTGGACTTGACTGCGTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCACCTCACAAAG  2197

Query 2123  TAACGGACTACTCCTCATCCAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGG  2196
            ||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 2198  TAACAGACTACTCATCCTCCAGTGAGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAACAGGAGGGG  2271

Query 2197  GCTGACGAGTCCACCTCAGGACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGA  2270
            |||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||.||
Sbjct 2272  GCTGATGATTCTACCTCGGGACCAGAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGGTGAAACAGA  2345

Query 2271  ATCTGTGAAAACCATGATTGTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTC  2344
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2346  ATCTGTGAAAACAATGATCGTTCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGGAGGGCACCC  2419

Query 2345  TAATCGTCCGCCAGAGTACAGTTGACCAAAAGCGTGCCAGCCATCATGAGAGCAATGGCTTTGCCGGTCGCATT  2418
            |.||||||||||                                                              
Sbjct 2420  TCATCGTCCGCC--------------------------------------------------------------  2431

Query 2419  CACCTCTTGCCAGATCTCTTACAGCAAAGCCATTCCTCCTCCACTTCCTCCACCTCCTCCTCCCCATCCTCCAG  2492
                                                                                      
Sbjct 2432  --------------------------------------------------------------------------  2431

Query 2493  CCAGCCGACACCCACCATGTCCCCACAGACACCCCAGGACAAGCTCACTGCTAATGAGACTCAGTCCGCTAGTA  2566
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 2432  --------------------------------------------------------AGACTCAGTCCGCTAGTA  2449

Query 2567  GCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTACAGATTTCTCCA  2640
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2450  GCACACTCCAGAAACACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTACAGATCTCTCCA  2523

Query 2641  TCTAGCGGAACAACAGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGA  2714
            |||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2524  TCTAGTGGGACGACAGTGACTTCCGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGA  2597

Query 2715  TCCTACCCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACACCCCGGAGATTC  2788
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2598  TCCTACTCGGAAAGGCTCAGTGGTCAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATACCCCCGAGATTC  2671

Query 2789  GTAAATACAAGAAGAGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGCTAGTGGGTACA  2862
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 2672  GTAAATACAAGAAGAGATTTAACTCAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGCTGGTTGGTACA  2745

Query 2863  GAGAGTGGCCTGATGCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGAAGACGATTTCA  2936
            |||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.|||||||||.||.||
Sbjct 2746  GAGAGCGGTCTGATGCTCTTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGAAGACGGTTCCA  2819

Query 2937  ACAAATGGACGTACTTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACT  3010
            .||||||||.||.||.||.|||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2820  GCAAATGGATGTGCTCGAAGGCCTAAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACT  2893

Query 3011  ATTTGTCCTGGTTAAGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGATGGACAACCGTA  3084
            ||||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct 2894  ATTTATCCTGGCTAAGAAATAAGATTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGTGGACCACTGTG  2967

Query 3085  GGGGATTTGGAAGGATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTGATTGCTTTGAA  3158
            ||.||.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2968  GGCGACTTGGAAGGGTGCGTGCACTATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTAATTGCTTTGAA  3041

Query 3159  GAGTTCTGTGGAAGTCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAAT  3232
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3042  GAGTTCTGTGGAAGTCTATGCATGGGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAAC  3115

Query 3233  TGGTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGT  3306
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3116  TGCTACATAAGCCATTACTGGTGGATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGT  3189

Query 3307  GCTGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATATCCAGTGTAG  3380
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 3190  GCGGGATTCCATGCTGTTGATGTGGATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATATTCAGTGTAG  3263

Query 3381  CATCAAACCCCATGCAATCATCATCCTCCCCAATACAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGG  3454
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 3264  CATCAAACCCCATGCAATCATTATCCTCCCCAACACGGATGGGATGGAGCTGCTGGTGTGCTACGAAGACGAGG  3337

Query 3455  GGGTTTATGTAAACACATATGGAAGGATCACCAAGGATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTA  3528
            |||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 3338  GGGTTTACGTTAACACGTACGGAAGGATCACCAAGGACGTGGTTCTGCAGTGGGGAGAGATGCCGACATCTGTA  3411

Query 3529  GCATATATTCGATCCAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCA  3602
            ||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3412  GCATATATCCGGTCGAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCAATAGAGATACGATCTGTGGAAACTGGTCA  3485

Query 3603  CTTGGATGGTGTGTTCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCT  3676
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3486  CTTGGATGGTGTATTTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACTAAAGTTCCTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCT  3559

Query 3677  TTGCCTCTGTTCGGTCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3750
            |||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3560  TTGCCTCCGTCCGCTCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3633