Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487793
• Subject: XM_006496046.1
• Aligned Length: 3760
• Identities: 3117
• Gaps: 302

Alignment

Query    1  ATGGCGAACGACTCCCCTGCAAAAAGTCTGGTGGACATCGACCTCTCCTCCCTGCGGGATCCTGCTGGGATTTT  74
            ||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAACGACTCTCCCGCGAAGAGCCTGGTGGACATTGACCTGTCGTCCCTGCGGGACCCTGCTGGGATTTT  74

Query   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   75  TGAGCTGGTGGAAGTGGTTGGAAATGGCACCTATGGACAAGTCTATAAGGGTCGACATGTTAAAACGGGTCAGC  148

Query  149  TGGCAGCCATCAAAGTTATGGATGTCACTGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTAAAG  222
            ||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGGCCGCCATCAAGGTTATGGACGTCACCGAGGATGAAGAGGAAGAAATCAAACTGGAGATAAATATGCTGAAG  222

Query  223  AAATACTCTCATCACAGAAACATTGCAACATATTATGGTGCTTTCATCAAAAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296
            ||.||.||||||||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTATTCTCATCATCGAAATATTGCCACGTACTATGGTGCTTTCATTAAGAAGAGCCCTCCAGGACATGATGA  296

Query  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTCTGTGGGGCTGGGTCCATTACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAACTCTGGCTTGTTATGGAGTTTTGTGGGGCTGGGTCCATCACAGACCTTGTGAAGAACACCAAAGGGAACA  370

Query  371  CACTCAAAGAAGACTGGATCGCTTACATCTCCAGAGAAATCCTGAGGGGACTGGCACATCTTCACATTCATCAT  444
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CTCTCAAAGAAGACTGGATTGCTTACATCTCCAGGGAAATCCTCAGGGGATTGGCACATCTCCATATTCACCAC  444

Query  445  GTGATTCACCGGGATATCAAGGGCCAGAATGTGTTGCTGACTGAGAATGCAGAGGTGAAACTTGTTGACTTTGG  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GTTATTCACCGAGATATCAAGGGCCAAAATGTGCTGCTGACCGAGAATGCTGAGGTGAAACTTGTTGATTTTGG  518

Query  519  TGTGAGTGCTCAGCTGGACAGGACTGTGGGGCGGAGAAATACGTTCATAGGCACTCCCTACTGGATGGCTCCTG  592
            |||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGTAAGCGCTCAGCTGGACAGGACGGTTGGACGGAGAAATACGTTCATAGGCACACCCTACTGGATGGCTCCAG  592

Query  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGATGCCACCTATGATTACAGAAGTGATCTTTGGTCTTGTGGCATTACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCATCGCCTGTGATGAGAACCCAGACGCCACTTACGACTACAGAAGTGACCTCTGGTCCTGTGGCATCACA  666

Query  667  GCCATTGAGATGGCAGAAGGTGCTCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCACTGTTTCTCATTCCCAG  740
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  667  GCCATCGAGATGGCTGAAGGGGCCCCCCCTCTCTGTGACATGCATCCAATGAGAGCGCTGTTTCTCATCCCCAG  740

Query  741  AAACCCTCCTCCCCGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCGAAGAAGTTTTTTAGTTTTATAGAAGGGTGCCTGGTGA  814
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  741  AAACCCTCCTCCCAGGCTGAAGTCAAAAAAATGGTCAAAGAAATTTTTCAGCTTTATAGAAGGCTGTCTGGTGA  814

Query  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAGCTTTTGAAACATCCTTTTATAAGGGATCAGCCAAATGAAAGG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGAATTACATGCAGCGGCCCTCTACAGAGCAACTTTTAAAACACCCTTTCATAAGGGATCAGCCCAATGAAAGG  888

Query  889  CAAGTTAGAATCCAGCTTAAGGATCATATAGATCGTACCAGGAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAAACTGAGTA  962
            ||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  889  CAGGTTCGAATCCAGCTTAAGGATCACATAGACCGGACCAGAAAGAAGAGAGGCGAGAAAGATGAGACGGAGTA  962

Query  963  TGAGTACAGTGGGAGTGAGGAAGAAGAGGAGGAAGTGCCTGAACAGGAAGGAGAGCCAAGTTCCATTGTGAACG  1036
            .||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CGAGTACAGCGGGAGCGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCCTGAGCAGGAGGGAGAGCCAAGTTCCATCGTCAATG  1036

Query 1037  TGCCTGGTGAGTCTACTCTTCGCCGAGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAACGTTCCGAGGCTCTT  1110
            |||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TGCCTGGAGAGTCAACTCTGCGACGTGATTTCCTGAGACTGCAGCAGGAGAACAAGGAGCGGTCTGAGGCTCTG  1110

Query 1111  CGGAGACAACAGTTACTACAGGAGCAACAGCTCCGGGAGCAGGAAGAATATAAAAGGCAACTGCTGGCAGAGAG  1184
            ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGAGACAGCAGCTTCTGCAGGAGCAGCAGCTCCGGGAGCAGGAGGAGTATAAGAGGCAGCTGCTGGCTGAGAG  1184

Query 1185  ACAGAAGCGGATTGAGCAGCAGAAAGAACAGAGGCGACGGCTAGAAGAGCAACAAAGGAGAGAGCGGGAAGCTA  1258
            .||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1185  GCAGAAGCGGATTGAACAGCAGAAAGAACAGAGGAGGCGGCTGGAAGAGCAACAAAGAAGAGAACGGGAAGCCA  1258

Query 1259  GAAGGCAGCAGGAACGTGAACAGCGAAGGAGAGAACAAGAAGAAAAGAGGCGTCTAGAGGAGTTGGAGAGAAGG  1332
            |.|||||||||||.|||||.|||||..||.|.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||.||..||
Sbjct 1259  GGAGGCAGCAGGAGCGTGAGCAGCGGCGGCGTGAACAAGAGGAGAAGAGGCGTCTCGAGGAACTGGAAAGGCGG  1332

Query 1333  CGCAAAGAAGAAGAGGAGAGGAGACGGGCAGAAGAAGAAAAGAGGAGAGTTGAAAGAGAACAGGAGTATATCAG  1406
            ||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  CGTAAAGAAGAGGAAGAGAGGAGACGGGCAGAAGAGGAGAAGAGGAGAGTGGAGAGGGAACAGGAGTACATCAG  1406

Query 1407  GCGACAGCTAGAAGAGGAGCAGCGGCACTTGGAAGTCCTTCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480
            |||.||||||||.|||||||||||||||.||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGCAGCTAGAGGAGGAGCAGCGGCACCTGGAGATCCTGCAGCAGCAGCTGCTCCAGGAGCAGGCCATGTTAC  1480

Query 1481  TGGAGTGCCGATGGCGGGAGATGGAGGAGCACCGGCAGGCAGAGAGGCTCCAGAGGCAGTTGCAACAAGAACAA  1554
            |                                                                         
Sbjct 1481  T-------------------------------------------------------------------------  1481

Query 1555  GCATATCTCCTGTCTCTACAGCATGACCATAGGAGGCCGCACCCGCAGCACTCGCAGCAGCCGCCACCACCGCA  1628
                                |||.|||||.||||||||||||.|.|||||   |||||.||||||.||.|.|||
Sbjct 1482  --------------------GCACGACCACAGGAGGCCGCACGCACAGCA---GCAGCCGCCGCCCCCGCAGCA  1532

Query 1629  GCAGGAAAGGAGCAAGCCAAGCTTCCATGCTCCCGAGCCCAAAGCC-CACTACGAGCCTGCTGACCGAGCGCGA  1701
            ||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||| ||||| |||||.||.|||||||||.||||.||.
Sbjct 1533  GCAGGACAGGAGCAAACCGAGCTTTCATGCTCCAGAGCCC-AAGCCTCACTATGACCCTGCTGACAGAGCTCGG  1605

Query 1702  GAGGTTCCTGTGAGAACAACATCTCGCTCCCCTGTTCTGTCCCGTCGAGATTCCCCACTGCAGGGCAGTGGGCA  1775
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 1606  GAGGTTCCCGTGAGAACGACCTCTCGTTCCCCTGTCCTCTCCCGTCGGGATTCCCCACTGCAGGGCGGTGGACA  1679

Query 1776  GCAGAATAGCCAGGCAGGACAGAGAAACTCCACCAGCAGTATTGAGCCCAGGCTTCTGTGGGAGAGAGTGGAGA  1849
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||   |||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1680  GCAGAATAGCCAAGCAGGACAGAGAAATTCCAC---CAGTATTGAGCCCCGGCTTCTTTGGGAGAGAGTGGAAA  1750

Query 1850  AGCTGGTGCCCAGACCTGGCAGTGGCAGCTCCTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCCGGGTCTCACCCT  1923
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1751  AGCTGGTCCCCAGGCCAGGCAGTGGCAGCTCTTCAGGGTCCAGCAACTCAGGATCCCAGCCTGGCTCCCATCCT  1824

Query 1924  GGGTCTCAGAGTGGCTCCGGGGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGCTCTCCATCTCAGCG  1997
            |||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|..||
Sbjct 1825  GGGTCTCAGAGCGGCTCCGGTGAACGCTTCAGAGTGAGATCATCATCCAAGTCTGAAGGTTCTCCATCGCCACG  1898

Query 1998  CCTGGAAAATGCAGTGAAAAAACCTGAAGATAAAAAGGAAGTTTTCAGACCCCTCAAGCCTGC---------TG  2062
            ||.|||||.|||||..|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.|.||.|||||||||||         .|
Sbjct 1899  CCAGGAAAGTGCAGCCAAAAAGCCTGACGATAAGAAAGAAGTATTCCGGCCTCTCAAGCCTGCGGGAGAAGTGG  1972

Query 2063  ATCTGACCGCACTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTACGGCCACCTCACAAAGTAACGGACTACTCC  2136
            |..||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1973  ACTTGACTGCGTTGGCCAAAGAGCTTCGAGCAGTGGAAGATGTTCGGCCACCTCACAAAGTAACAGACTACTCA  2046

Query 2137  TCATCCAGTGAGGAGTCGGGGACGACGGATGAGGAGGACGACGATGTGGAGCAGGAAGGGGCTGACGAGTCCAC  2210
            ||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||
Sbjct 2047  TCCTCCAGTGAGGAGTCTGGGACCACAGATGAGGAGGAGGAGGACGTGGAACAGGAGGGGGCTGATGATTCTAC  2120

Query 2211  CTCAGGACCAGAGGACACCAGAGCAGCGTCATCTCTGAATTTGAGCAATGGTGAAACGGAATCTGTGAAAACCA  2284
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2121  CTCGGGACCAGAAGACACCAGAGCAGCGTCATCTCCGAACCTGAGCAACGGTGAAACAGAATCTGTGAAAACAA  2194

Query 2285  TGATTGTCCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCGGCCATGACCCCATCCAAGGAGGGCACTCTAATCGTCCGCCAG  2358
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||  
Sbjct 2195  TGATCGTTCATGATGATGTAGAAAGTGAGCCAGCCATGACCCCGTCCAAGGAGGGCACCCTCATCGTCCGCC--  2266

Query 2359  AGTACAGTTGACCAAAAGCGTGCCAGCCATCATGAGAGCAATGGCTTTGCCGGTCGCATTCACCTCTTGCCAGA  2432
                                                                                      
Sbjct 2267  --------------------------------------------------------------------------  2266

Query 2433  TCTCTTACAGCAAAGCCATTCCTCCTCCACTTCCTCCACCTCCTCCTCCCCATCCTCCAGCCAGCCGACACCCA  2506
                                                                                      
Sbjct 2267  --------------------------------------------------------------------------  2266

Query 2507  CCATGTCCCCACAGACACCCCAGGACAAGCTCACTGCTAATGAGACTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAA  2580
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2267  ------------------------------------------AGACTCAGTCCGCTAGTAGCACACTCCAGAAA  2298

Query 2581  CACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGATTACTACAGATTTCTCCATCTAGCGGAACAAC  2654
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 2299  CACAAATCTTCCTCCTCCTTTACACCTTTTATAGACCCCAGGTTACTACAGATCTCTCCATCTAGTGGGACGAC  2372

Query 2655  AGTGACATCTGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGATGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGATCCTACCCGGAAAG  2728
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2373  AGTGACTTCCGTGGTGGGATTTTCCTGTGATGGGCTGAGACCAGAAGCCATAAGGCAAGATCCTACTCGGAAAG  2446

Query 2729  GCTCAGTGGTCAATGTGAATCCTACCAACACTAGGCCACAGAGTGACACCCCGGAGATTCGTAAATACAAGAAG  2802
            |||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2447  GCTCAGTGGTCAATGTGAACCCCACGAACACTAGGCCACAGAGTGATACCCCCGAGATTCGTAAATACAAGAAG  2520

Query 2803  AGGTTTAACTCTGAGATTCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAATTTGCTAGTGGGTACAGAGAGTGGCCTGAT  2876
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2521  AGATTTAACTCAGAGATCCTGTGTGCTGCCTTATGGGGAGTGAACTTGCTGGTTGGTACAGAGAGCGGTCTGAT  2594

Query 2877  GCTGCTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAGGTCTATCCTCTTATCAACCGAAGACGATTTCAACAAATGGACGTAC  2950
            |||..||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||.|||||||||.||.||.||||||||.||.|
Sbjct 2595  GCTCTTGGACAGAAGTGGCCAAGGGAAAGTATACCCTCTGATCAGCCGAAGACGGTTCCAGCAAATGGATGTGC  2668

Query 2951  TTGAGGGCTTGAATGTCTTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACTATTTGTCCTGGTTA  3024
            |.||.|||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 2669  TCGAAGGCCTAAATGTCCTGGTGACAATATCTGGCAAAAAGGATAAGTTACGTGTCTACTATTTATCCTGGCTA  2742

Query 3025  AGAAATAAAATACTTCACAATGATCCAGAAGTTGAGAAGAAGCAGGGATGGACAACCGTAGGGGATTTGGAAGG  3098
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2743  AGAAATAAGATTCTTCATAATGATCCAGAGGTTGAGAAGAAGCAGGGGTGGACCACTGTGGGCGACTTGGAAGG  2816

Query 3099  ATGTGTACATTATAAAGTTGTAAAATATGAAAGAATCAAATTTCTGGTGATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAG  3172
            .||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2817  GTGCGTGCACTATAAAGTCGTAAAATATGAAAGAATCAAGTTTCTGGTAATTGCTTTGAAGAGTTCTGTGGAAG  2890

Query 3173  TCTATGCGTGGGCACCAAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAATTGGTACATAAGCCA  3246
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2891  TCTATGCATGGGCACCGAAGCCATATCACAAATTTATGGCCTTTAAGTCATTTGGAGAACTGCTACATAAGCCA  2964

Query 3247  TTACTGGTGGATCTCACTGTTGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGTGCTGGATTCCATGC  3320
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2965  TTACTGGTGGATCTCACTGTGGAGGAAGGCCAGAGGTTGAAAGTGATCTATGGATCCTGTGCGGGATTCCATGC  3038

Query 3321  TGTTGATGTGGATTCAGGATCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATATCCAGTGTAGCATCAAACCCCATG  3394
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 3039  TGTTGATGTGGATTCAGGCTCAGTCTATGACATTTATCTACCAACACATATTCAGTGTAGCATCAAACCCCATG  3112

Query 3395  CAATCATCATCCTCCCCAATACAGATGGAATGGAGCTTCTGGTGTGCTATGAAGATGAGGGGGTTTATGTAAAC  3468
            |||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 3113  CAATCATTATCCTCCCCAACACGGATGGGATGGAGCTGCTGGTGTGCTACGAAGACGAGGGGGTTTACGTTAAC  3186

Query 3469  ACATATGGAAGGATCACCAAGGATGTAGTTCTACAGTGGGGAGAGATGCCTACATCAGTAGCATATATTCGATC  3542
            ||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 3187  ACGTACGGAAGGATCACCAAGGACGTGGTTCTGCAGTGGGGAGAGATGCCGACATCTGTAGCATATATCCGGTC  3260

Query 3543  CAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCCATAGAGATCCGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTGT  3616
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3261  GAATCAGACAATGGGCTGGGGAGAGAAGGCAATAGAGATACGATCTGTGGAAACTGGTCACTTGGATGGTGTAT  3334

Query 3617  TCATGCACAAAAGGGCTCAAAGACTAAAATTCTTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCTGTTCGG  3690
            |.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 3335  TTATGCACAAAAGGGCTCAGAGACTAAAGTTCCTGTGTGAACGCAATGACAAGGTGTTCTTTGCCTCCGTCCGC  3408

Query 3691  TCTGGTGGCAGCAGTCAGGTTTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3750
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3409  TCTGGTGGCAGCAGCCAGGTCTATTTCATGACCTTAGGCAGGACTTCTCTTCTGAGCTGG  3468