Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487794
• Subject: XM_006516895.4
• Aligned Length: 1907
• Identities: 1563
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAGCGGCATG-GCT---GACAGCGCCAACCACCTGCCCTTCTTTTTCGGCAACATCACCCGGGAGG  70
            |||       ||||.|.| |||   ||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATG-------GCGGGAAGTGCTGTGGACAGCGCCAACCACCTGACCTACTTTTTTGGCAACATCACCCGGGAAG  67

Query   71  AGGCAGAAGATTACCTGGTCCAGGGGGGCATGAGTGATGGGCTTTATTTGCTGCGCCAGAGCCGCAACTACCTG  144
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||.||..||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct   68  AGGCTGAAGACTACCTGGTCCAGGGAGGCATGACCGATGGGCTCTACCTGCTACGCCAGAGCCGCAATTACCTG  141

Query  145  GGTGGCTTCGCCCTGTCCGTGGCCCACGGGAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGCGGGAGCTGAATGGCAC  218
            |||||.||.||..||||.|||||.|||...|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||
Sbjct  142  GGTGGTTTTGCTTTGTCGGTGGCTCACAACAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGAGGGAACTTAATGGCAC  215

Query  219  CTACGCCATCGCCGGTGGCAGGACCCATGCCAGCCCCGCCGACCTCTGCCACTACCACTCCCAGGAGTCTGATG  292
            ||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||
Sbjct  216  CTACGCCATCTCCGGGGGCAGGGCCCATGCCAGCCCAGCAGACCTCTGCCATTACCACTCCCAGGAACCTGATG  289

Query  293  GCCTGGTCTGCCTCCTCAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCAAGGGGTGCAGCCCAAGACTGGGCCCTTTGAGGAT  366
            ||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  GCCTTATCTGCCTCCTTAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCCGGGAGTACAGCCCAAGACCGGACCCTTTGAGGAC  363

Query  367  TTGAAGGAAAACCTCATCAGGGAATATGTGAAGCAGACATGGAACCTGCAGGGTCAGGCTCTGGAGCAGGCCAT  440
            .|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  364  CTGAAGGAGAACCTCATCAGGGAATATGTGAAACAGACCTGGAACCTTCAGGGCCAGGCTCTGGAGCAAGCCAT  437

Query  441  CATCAGTCAGAAGCCTCAGCTGGAGAAGCTGATCGCTACCACAGCCCATGAAAAAATGCCTTGGTTCCATGGAA  514
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  438  CATCAGCCAGAAGCCCCAGCTGGAGAAGCTGATCGCCACCACGGCCCATGAGAAGATGCCCTGGTTCCATGGCA  511

Query  515  AAATCTCTCGGGAAGAATCTGAGCAAATTGTCCTGATAGGATCAAAGACAAATGGAAAGTTCCTGATCCGAGCC  588
            |.|||||..|.||.|||||.|||||.|..|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct  512  ACATCTCCAGAGATGAATCAGAGCAGACGGTCCTCATAGGGTCAAAGACCAATGGAAAATTCCTGATCAGGGCC  585

Query  589  AGAGACAACAACGGCTCCTACGCCCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAGGTGCTGCACTATCGCATCGACAAAGA  662
            ||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||||.||||..||
Sbjct  586  AGAGACAACAGCGGCTCCTATGCTCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAAGTATTGCACTACCGCATTGACAGGGA  659

Query  663  CAAGACAGGGAAGCTCTCCATCCCCGAGGGAAAGAAGTTCGACACGCTCTGGCAGCTAGTCGAGCATTATTCTT  736
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  660  CAAGACCGGGAAGCTCTCCATTCCTGAGGGGAAGAAGTTTGACACCCTCTGGCAGCTAGTGGAACATTACTCTT  733

Query  737  ATAAAGCAGATGGTTTGTTAAGAGTTCTTACTGTCCCATGTCAAAAAATCGG-------------CACACAGG-  796
            |.||..|||||||..|..|||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||             |||.|||| 
Sbjct  734  ACAAGCCAGATGGGCTACTAAGAGTCCTCACGGTACCATGCCAAAAGATTGGTGCACAGATGGGCCACCCAGGA  807

Query  797  ----GAAAT---------GTTAATT---------TTGGAGGCCGTCCACAACTTCCAGGTTCCCATCCTGCGTC  848
                .||||         ||.|.||         .||||        |.||..||.|||.||..|||||.| ||
Sbjct  808  AGCCCAAATGCCCATCCCGTGACTTGGTCACCGGGTGGA--------ATAATCTCAAGGATCAAATCCTAC-TC  872

Query  849  CT---------------------------CCCCTGCCCAAGGGAACCGGCAAGAGAGTACTGTGTCATTCAATC  895
            ||                           ||||..|||||||||.|||.|.||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  873  CTTCCCAAAGCCTGGCCACAAAAAGCCTGCCCCACCCCAAGGGAGCCGTCCAGAGAGCACTGTGTCCTTCAACC  946

Query  896  CGTATGAGCCA----GAACTTGCACCCTGGGCTGCAGACAAAGGCCCCCAGAGAGAAGCCCTACCCATGGACAC  965
            |.|||||||||    ||    |..|||||||...||||||.|||||..||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  947  CCTATGAGCCAACGGGA----GGGCCCTGGGGCCCAGACAGAGGCCTTCAGAGAGAAGCCCTGCCCATGGACAC  1016

Query  966  AGAGGTGTACGAGAGCCCCTACGCGGACCCCGAGGAGATCAGGCCCAAGGAGGTTTACCTGGACCGAAAGCTGC  1039
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||.|.|..||||
Sbjct 1017  AGAGGTGTACGAGAGCCCTTATGCTGACCCTGAAGAGATCCGGCCCAAAGAGGTCTACCTGGACAGGAGCCTGC  1090

Query 1040  TGACGCTGGAAGACAAAGAACTGGGCTCTGGTAATTTTGGAACTGTGAAAAAGGGCTACTACCAAATGAAAAAA  1113
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1091  TGACCCTGGAGGACAATGAACTGGGCTCCGGTAACTTCGGGACTGTGAAAAAGGGATACTACCAAATGAAAAAA  1164

Query 1114  GTTGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATACTGAAAAACGAGGCCAATGACCCCGCTCTTAAAGATGAGTTATTAGC  1187
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||.|..|.||
Sbjct 1165  GTTGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATCCTGAAGAACGAGGCCAACGACCCGGCTTTGAAGGACGAGCTGCTGGC  1238

Query 1188  AGAAGCAAATGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCGTACATCGTGCGGATGATCGGGATATGCGAGGCCGAGTCCT  1261
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 1239  AGAGGCGAACGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCCTACATTGTGCGCATGATCGGAATCTGCGAGGCGGAGTCCT  1312

Query 1262  GGATGCTGGTTATGGAGATGGCAGAACTTGGTCCCCTCAATAAGTATTTGCAGCAGAACAGACATGTCAAGGAT  1335
            ||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.||..|.||||||
Sbjct 1313  GGATGCTGGTGATGGAGATGGCGGAGCTGGGGCCGCTCAACAAGTACCTGCAGCAGAACAGGCACATTAAGGAT  1386

Query 1336  AAGAACATCATAGAACTGGTTCATCAGGTTTCCATGGGCATGAAGTACTTGGAGGAGAGCAATTTTGTGCACAG  1409
            ||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1387  AAGAACATCATAGAGCTGGTTCACCAGGTTTCCATGGGGATGAAGTATTTGGAAGAGAGCAACTTTGTGCACAG  1460

Query 1410  AGATCTGGCTGCAAGAAATGTGTTGCTAGTTACCCAACATTACGCCAAGATCAGTGATTTCGGACTTTCCAAAG  1483
            ||||||||||||..|.||.|||.|.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1461  AGATCTGGCTGCGCGGAACGTGCTTCTGGTCACACAGCACTATGCCAAGATCAGCGATTTCGGTCTTTCCAAAG  1534

Query 1484  CACTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCATGGAAAGTGGCCTGTCAAGTGGTACGCTCCGGAA  1557
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1535  CCCTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCACGGGAAGTGGCCCGTGAAGTGGTACGCCCCCGAA  1608

Query 1558  TGCATCAACTACTACAAGTTCTCCAGCAAAAGCGATGTCTGGAGCTTTGGAGTGTTGATGTGGGAAGCATTCTC  1631
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||
Sbjct 1609  TGCATCAACTACTACAAGTTCTCCAGTAAGAGTGACGTCTGGAGCTTCGGAGTCCTGATGTGGGAAGCGTTCTC  1682

Query 1632  CTATGGGCAGAAGCCATATCGAGGGATGAAAGGAAGTGAAGTCACCGCTATGTTAGAGAAAGGAGAGCGGATGG  1705
            |||||||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1683  CTATGGGCAGAAGCCCTACAGAGGGATGAAAGGGAGCGAAGTGACCGCCATGCTGGAGAAAGGAGAGCGGATGG  1756

Query 1706  GGTGCCCTGCAGGGTGTCCAAGAGAGATGTACGATCTCATGAATCTGTGCTGGACATACGATGTGGAAAACAGG  1779
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1757  GGTGCCCTGCAGGATGCCCGAGAGAGATGTACGACCTGATGAACCTGTGCTGGACTTACGATGTGGAGAACAGG  1830

Query 1780  CCCGGATTCGCAGCAGTGGAACTGCGGCTGCGCAATTACTACTATGACGTGGTGAAC  1836
            ||.||||||.||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1831  CCAGGATTCACAGCTGTGGAACTGAGGCTTCGCAATTACTACTACGACGTGGTTAAC  1887