Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487794
• Subject: XM_006516897.4
• Aligned Length: 1846
• Identities: 1556
• Gaps: 38

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAGCGGCATG-GCT---GACAGCGCCAACCACCTGCCCTTCTTTTTCGGCAACATCACCCGGGAGG  70
            |||       ||||.|.| |||   ||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATG-------GCGGGAAGTGCTGTGGACAGCGCCAACCACCTGACCTACTTTTTTGGCAACATCACCCGGGAAG  67

Query   71  AGGCAGAAGATTACCTGGTCCAGGGGGGCATGAGTGATGGGCTTTATTTGCTGCGCCAGAGCCGCAACTACCTG  144
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||.||..||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct   68  AGGCTGAAGACTACCTGGTCCAGGGAGGCATGACCGATGGGCTCTACCTGCTACGCCAGAGCCGCAATTACCTG  141

Query  145  GGTGGCTTCGCCCTGTCCGTGGCCCACGGGAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGCGGGAGCTGAATGGCAC  218
            |||||.||.||..||||.|||||.|||...|||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||
Sbjct  142  GGTGGTTTTGCTTTGTCGGTGGCTCACAACAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGAGGGAACTTAATGGCAC  215

Query  219  CTACGCCATCGCCGGTGGCAGGACCCATGCCAGCCCCGCCGACCTCTGCCACTACCACTCCCAGGAGTCTGATG  292
            ||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||
Sbjct  216  CTACGCCATCTCCGGGGGCAGGGCCCATGCCAGCCCAGCAGACCTCTGCCATTACCACTCCCAGGAACCTGATG  289

Query  293  GCCTGGTCTGCCTCCTCAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCAAGGGGTGCAGCCCAAGACTGGGCCCTTTGAGGAT  366
            ||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  GCCTTATCTGCCTCCTTAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCCGGGAGTACAGCCCAAGACCGGACCCTTTGAGGAC  363

Query  367  TTGAAGGAAAACCTCATCAGGGAATATGTGAAGCAGACATGGAACCTGCAGGGTCAGGCTCTGGAGCAGGCCAT  440
            .|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  364  CTGAAGGAGAACCTCATCAGGGAATATGTGAAACAGACCTGGAACCTTCAGGGCCAGGCTCTGGAGCAAGCCAT  437

Query  441  CATCAGTCAGAAGCCTCAGCTGGAGAAGCTGATCGCTACCACAGCCCATGAAAAAATGCCTTGGTTCCATGGAA  514
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  438  CATCAGCCAGAAGCCCCAGCTGGAGAAGCTGATCGCCACCACGGCCCATGAGAAGATGCCCTGGTTCCATGGCA  511

Query  515  AAATCTCTCGGGAAGAATCTGAGCAAATTGTCCTGATAGGATCAAAGACAAATGGAAAGTTCCTGATCCGAGCC  588
            |.|||||..|.||.|||||.|||||.|..|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct  512  ACATCTCCAGAGATGAATCAGAGCAGACGGTCCTCATAGGGTCAAAGACCAATGGAAAATTCCTGATCAGGGCC  585

Query  589  AGAGACAACAACGGCTCCTACGCCCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAGGTGCTGCACTATCGCATCGACAAAGA  662
            ||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||||.||||..||
Sbjct  586  AGAGACAACAGCGGCTCCTATGCTCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAAGTATTGCACTACCGCATTGACAGGGA  659

Query  663  CAAGACAGGGAAGCTCTCCATCCCCGAGGGAAAGAAGTTCGACACGCTCTGGCAGCTAGTCGAGCATTATTCTT  736
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  660  CAAGACCGGGAAGCTCTCCATTCCTGAGGGGAAGAAGTTTGACACCCTCTGGCAGCTAGTGGAACATTACTCTT  733

Query  737  ATAAAGCAGATGGTTTGTTAAGAGTTCTTACTGTCCCATGTCAAAAAATCGGCACACAGGGAAATGTTAATTTT  810
            |.||..|||||||..|..|||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.||..|||||    |||        
Sbjct  734  ACAAGCCAGATGGGCTACTAAGAGTCCTCACGGTACCATGCCAAAAGATTGGTGCACAG----ATG--------  795

Query  811  GGAGGCCGTCCACAACTTCCAGGTTCCCATCCTGCGT-CCT-CCCCTGCCCAAGGGAACCGGCAAGAGAGTACT  882
               ||||..|||..|...|||..|.|||||||  ||| ||| ||||..|||||||||.|||.|.||||||.|||
Sbjct  796  ---GGCCACCCAGGAAGCCCAAATGCCCATCC--CGTGCCTGCCCCACCCCAAGGGAGCCGTCCAGAGAGCACT  864

Query  883  GTGTCATTCAATCCGTATGAGCCA----GAACTTGCACCCTGGGCTGCAGACAAAGGCCCCCAGAGAGAAGCCC  952
            |||||.|||||.||.|||||||||    ||    |..|||||||...||||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct  865  GTGTCCTTCAACCCCTATGAGCCAACGGGA----GGGCCCTGGGGCCCAGACAGAGGCCTTCAGAGAGAAGCCC  934

Query  953  TACCCATGGACACAGAGGTGTACGAGAGCCCCTACGCGGACCCCGAGGAGATCAGGCCCAAGGAGGTTTACCTG  1026
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|||||||.|||||.||||||
Sbjct  935  TGCCCATGGACACAGAGGTGTACGAGAGCCCTTATGCTGACCCTGAAGAGATCCGGCCCAAAGAGGTCTACCTG  1008

Query 1027  GACCGAAAGCTGCTGACGCTGGAAGACAAAGAACTGGGCTCTGGTAATTTTGGAACTGTGAAAAAGGGCTACTA  1100
            |||.|.|..||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1009  GACAGGAGCCTGCTGACCCTGGAGGACAATGAACTGGGCTCCGGTAACTTCGGGACTGTGAAAAAGGGATACTA  1082

Query 1101  CCAAATGAAAAAAGTTGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATACTGAAAAACGAGGCCAATGACCCCGCTCTTAAAG  1174
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||.|.||.|
Sbjct 1083  CCAAATGAAAAAAGTTGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATCCTGAAGAACGAGGCCAACGACCCGGCTTTGAAGG  1156

Query 1175  ATGAGTTATTAGCAGAAGCAAATGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCGTACATCGTGCGGATGATCGGGATATGC  1248
            |.|||.|..|.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 1157  ACGAGCTGCTGGCAGAGGCGAACGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCCTACATTGTGCGCATGATCGGAATCTGC  1230

Query 1249  GAGGCCGAGTCCTGGATGCTGGTTATGGAGATGGCAGAACTTGGTCCCCTCAATAAGTATTTGCAGCAGAACAG  1322
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||..|||||||||||||
Sbjct 1231  GAGGCGGAGTCCTGGATGCTGGTGATGGAGATGGCGGAGCTGGGGCCGCTCAACAAGTACCTGCAGCAGAACAG  1304

Query 1323  ACATGTCAAGGATAAGAACATCATAGAACTGGTTCATCAGGTTTCCATGGGCATGAAGTACTTGGAGGAGAGCA  1396
            .||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1305  GCACATTAAGGATAAGAACATCATAGAGCTGGTTCACCAGGTTTCCATGGGGATGAAGTATTTGGAAGAGAGCA  1378

Query 1397  ATTTTGTGCACAGAGATCTGGCTGCAAGAAATGTGTTGCTAGTTACCCAACATTACGCCAAGATCAGTGATTTC  1470
            |.|||||||||||||||||||||||..|.||.|||.|.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1379  ACTTTGTGCACAGAGATCTGGCTGCGCGGAACGTGCTTCTGGTCACACAGCACTATGCCAAGATCAGCGATTTC  1452

Query 1471  GGACTTTCCAAAGCACTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCATGGAAAGTGGCCTGTCAAGTG  1544
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1453  GGTCTTTCCAAAGCCCTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCACGGGAAGTGGCCCGTGAAGTG  1526

Query 1545  GTACGCTCCGGAATGCATCAACTACTACAAGTTCTCCAGCAAAAGCGATGTCTGGAGCTTTGGAGTGTTGATGT  1618
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||..||||||
Sbjct 1527  GTACGCCCCCGAATGCATCAACTACTACAAGTTCTCCAGTAAGAGTGACGTCTGGAGCTTCGGAGTCCTGATGT  1600

Query 1619  GGGAAGCATTCTCCTATGGGCAGAAGCCATATCGAGGGATGAAAGGAAGTGAAGTCACCGCTATGTTAGAGAAA  1692
            |||||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||||.|||.|.||||||
Sbjct 1601  GGGAAGCGTTCTCCTATGGGCAGAAGCCCTACAGAGGGATGAAAGGGAGCGAAGTGACCGCCATGCTGGAGAAA  1674

Query 1693  GGAGAGCGGATGGGGTGCCCTGCAGGGTGTCCAAGAGAGATGTACGATCTCATGAATCTGTGCTGGACATACGA  1766
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1675  GGAGAGCGGATGGGGTGCCCTGCAGGATGCCCGAGAGAGATGTACGACCTGATGAACCTGTGCTGGACTTACGA  1748

Query 1767  TGTGGAAAACAGGCCCGGATTCGCAGCAGTGGAACTGCGGCTGCGCAATTACTACTATGACGTGGTGAAC  1836
            ||||||.||||||||.||||||.||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1749  TGTGGAGAACAGGCCAGGATTCACAGCTGTGGAACTGAGGCTTCGCAATTACTACTACGACGTGGTTAAC  1818