Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487794
• Subject: XM_011518946.3
• Aligned Length: 1905
• Identities: 1836
• Gaps: 69

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCAGCGGCATGGCTGACAGCGCCAACCACCTGCCCTTCTTTTTCGGCAACATCACCCGGGAGGAGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGCAGCGGCATGGCTGACAGCGCCAACCACCTGCCCTTCTTTTTCGGCAACATCACCCGGGAGGAGGC  74

Query   75  AGAAGATTACCTGGTCCAGGGGGGCATGAGTGATGGGCTTTATTTGCTGCGCCAGAGCCGCAACTACCTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAAGATTACCTGGTCCAGGGGGGCATGAGTGATGGGCTTTATTTGCTGCGCCAGAGCCGCAACTACCTGGGTG  148

Query  149  GCTTCGCCCTGTCCGTGGCCCACGGGAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGCGGGAGCTGAATGGCACCTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTCGCCCTGTCCGTGGCCCACGGGAGGAAGGCACACCACTACACCATCGAGCGGGAGCTGAATGGCACCTAC  222

Query  223  GCCATCGCCGGTGGCAGGACCCATGCCAGCCCCGCCGACCTCTGCCACTACCACTCCCAGGAGTCTGATGGCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCATCGCCGGTGGCAGGACCCATGCCAGCCCCGCCGACCTCTGCCACTACCACTCCCAGGAGTCTGATGGCCT  296

Query  297  GGTCTGCCTCCTCAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCAAGGGGTGCAGCCCAAGACTGGGCCCTTTGAGGATTTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTCTGCCTCCTCAAGAAGCCCTTCAACCGGCCCCAAGGGGTGCAGCCCAAGACTGGGCCCTTTGAGGATTTGA  370

Query  371  AGGAAAACCTCATCAGGGAATATGTGAAGCAGACATGGAACCTGCAGGGTCAGGCTCTGGAGCAGGCCATCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAAAACCTCATCAGGGAATATGTGAAGCAGACATGGAACCTGCAGGGTCAGGCTCTGGAGCAGGCCATCATC  444

Query  445  AGTCAGAAGCCTCAGCTGGAGAAGCTGATCGCTACCACAGCCCATGAAAAAATGCCTTGGTTCCATGGAAAAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTCAGAAGCCTCAGCTGGAGAAGCTGATCGCTACCACAGCCCATGAAAAAATGCCTTGGTTCCATGGAAAAAT  518

Query  519  CTCTCGGGAAGAATCTGAGCAAATTGTCCTGATAGGATCAAAGACAAATGGAAAGTTCCTGATCCGAGCCAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTCGGGAAGAATCTGAGCAAATTGTCCTGATAGGATCAAAGACAAATGGAAAGTTCCTGATCCGAGCCAGAG  592

Query  593  ACAACAACGGCTCCTACGCCCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAGGTGCTGCACTATCGCATCGACAAAGACAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAACAACGGCTCCTACGCCCTGTGCCTGCTGCACGAAGGGAAGGTGCTGCACTATCGCATCGACAAAGACAAG  666

Query  667  ACAGGGAAGCTCTCCATCCCCGAGGGAAAGAAGTTCGACACGCTCTGGCAGCTAGTCGAGCATTATTCTTATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAGGGAAGCTCTCCATCCCCGAGGGAAAGAAGTTCGACACGCTCTGGCAGCTAGTCGAGCATTATTCTTATAA  740

Query  741  AGCAGATGGTTTGTTAAGAGTTCTTACTGTCCCATGTCAAAAAATCGGCACACAGGGAAATGTTAATTTTGGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCAGATGGTTTGTTAAGAGTTCTTACTGTCCCATGTCAAAAAATCGGCACACAGGGAAATGTTAATTTTGGAG  814

Query  815  GCCGTCCACAACTTCCAGGTTCCCATCCTGC-------------------------------------------  845
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  815  GCCGTCCACAACTTCCAGGTTCCCATCCTGCGACTTGGTCAGCGGGTGGAATAATCTCAAGAATCAAATCATAC  888

Query  846  --------------------------GTCCTCCCCTGCCCAAGGGAACCGGCAAGAGAGTACTGTGTCATTCAA  893
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCCTTCCCAAAGCCTGGCCACAGAAAGTCCTCCCCTGCCCAAGGGAACCGGCAAGAGAGTACTGTGTCATTCAA  962

Query  894  TCCGTATGAGCCAGAACTTGCACCCTGGGCTGCAGACAAAGGCCCCCAGAGAGAAGCCCTACCCATGGACACAG  967
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCGTATGAGCCAGAACTTGCACCCTGGGCTGCAGACAAAGGCCCCCAGAGAGAAGCCCTACCCATGGACACAG  1036

Query  968  AGGTGTACGAGAGCCCCTACGCGGACCCCGAGGAGATCAGGCCCAAGGAGGTTTACCTGGACCGAAAGCTGCTG  1041
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTGTACGAGAGCCCCTACGCGGACCCCGAGGAGATCAGGCCCAAGGAGGTTTACCTGGACCGAAAGCTGCTG  1110

Query 1042  ACGCTGGAAGACAAAGAACTGGGCTCTGGTAATTTTGGAACTGTGAAAAAGGGCTACTACCAAATGAAAAAAGT  1115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGCTGGAAGACAAAGAACTGGGCTCTGGTAATTTTGGAACTGTGAAAAAGGGCTACTACCAAATGAAAAAAGT  1184

Query 1116  TGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATACTGAAAAACGAGGCCAATGACCCCGCTCTTAAAGATGAGTTATTAGCAG  1189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGAAAACCGTGGCTGTGAAAATACTGAAAAACGAGGCCAATGACCCCGCTCTTAAAGATGAGTTATTAGCAG  1258

Query 1190  AAGCAAATGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCGTACATCGTGCGGATGATCGGGATATGCGAGGCCGAGTCCTGG  1263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGCAAATGTCATGCAGCAGCTGGACAACCCGTACATCGTGCGGATGATCGGGATATGCGAGGCCGAGTCCTGG  1332

Query 1264  ATGCTGGTTATGGAGATGGCAGAACTTGGTCCCCTCAATAAGTATTTGCAGCAGAACAGACATGTCAAGGATAA  1337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGCTGGTTATGGAGATGGCAGAACTTGGTCCCCTCAATAAGTATTTGCAGCAGAACAGACATGTCAAGGATAA  1406

Query 1338  GAACATCATAGAACTGGTTCATCAGGTTTCCATGGGCATGAAGTACTTGGAGGAGAGCAATTTTGTGCACAGAG  1411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAACATCATAGAACTGGTTCATCAGGTTTCCATGGGCATGAAGTACTTGGAGGAGAGCAATTTTGTGCACAGAG  1480

Query 1412  ATCTGGCTGCAAGAAATGTGTTGCTAGTTACCCAACATTACGCCAAGATCAGTGATTTCGGACTTTCCAAAGCA  1485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATCTGGCTGCAAGAAATGTGTTGCTAGTTACCCAACATTACGCCAAGATCAGTGATTTCGGACTTTCCAAAGCA  1554

Query 1486  CTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCATGGAAAGTGGCCTGTCAAGTGGTACGCTCCGGAATG  1559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCGTGCTGATGAAAACTACTACAAGGCCCAGACCCATGGAAAGTGGCCTGTCAAGTGGTACGCTCCGGAATG  1628

Query 1560  CATCAACTACTACAAGTTCTCCAGCAAAAGCGATGTCTGGAGCTTTGGAGTGTTGATGTGGGAAGCATTCTCCT  1633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATCAACTACTACAAGTTCTCCAGCAAAAGCGATGTCTGGAGCTTTGGAGTGTTGATGTGGGAAGCATTCTCCT  1702

Query 1634  ATGGGCAGAAGCCATATCGAGGGATGAAAGGAAGTGAAGTCACCGCTATGTTAGAGAAAGGAGAGCGGATGGGG  1707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGGCAGAAGCCATATCGAGGGATGAAAGGAAGTGAAGTCACCGCTATGTTAGAGAAAGGAGAGCGGATGGGG  1776

Query 1708  TGCCCTGCAGGGTGTCCAAGAGAGATGTACGATCTCATGAATCTGTGCTGGACATACGATGTGGAAAACAGGCC  1781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TGCCCTGCAGGGTGTCCAAGAGAGATGTACGATCTCATGAATCTGTGCTGGACATACGATGTGGAAAACAGGCC  1850

Query 1782  CGGATTCGCAGCAGTGGAACTGCGGCTGCGCAATTACTACTATGACGTGGTGAAC  1836
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CGGATTCGCAGCAGTGGAACTGCGGCTGCGCAATTACTACTATGACGTGGTGAAC  1905