Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487806
• Subject: XM_006524695.3
• Aligned Length: 2388
• Identities: 1945
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA  74
            ||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCTACGGAGAGCGGCCCTGGGACAAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACCTCCCA  74

Query   75  AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA  148
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct   75  AATGTCTACAACGCAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCAAATGCAGCCAGCACCAATCCTCCACCCCCAGAGA  148

Query  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGACAGACAAACCAACTGCAATATCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222

Query  223  TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGAAACACCAGTTTGCGTGGCCTTTCCAGCAGCCCGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296

Query  297  GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370
            |||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATTATTAAAACACCCATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370

Query  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTATAACAAGCCTGGAGATGACATCGTCTTA  444

Query  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT  518
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAGAAGCTCTTCTTGCAAAAAATCAATGAACTGCCTACAGAAGAAACTGAGATCATGAT  518

Query  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAG---GGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTAC  589
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||   ||.|||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGAGGGAGGAAAGAAACAGGTAGGGCAGCAAAGCCTGGTGTATCCACGGTAC  592

Query  590  CAAACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAA---TCCTCCTCCTGTGCAGGCC  660
            |||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||.|||   ||||||.||||||||||||
Sbjct  593  CAAACACAACTCAAGCATCAACTTCTCCGCAGACCCAGACGCCTCAGCAGAACCCTCCTCCACCTGTGCAGGCC  666

Query  661  ACGCCTCACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCA  734
            ||..||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.||||.|.||||||||||||.|||||||.||.||
Sbjct  667  ACAACTCACCCCTTTCCTGCTGTCACCCCAGACCTCATTGCCCAGCCTCCTGTCATGACAATGGTGCCCCCTCA  740

Query  735  GCCACTGCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGA  808
            ||||||.|||||.||..|.||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||.|||||.||.||||
Sbjct  741  GCCACTTCAGACTCCTTCACCGGTACCCCCCCAGCCACCACCCCCACCTGCTCCAGTTCCACAGCCTGTGCAGA  814

Query  809  GCCACCCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACC  882
            |.|||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  GTCACCCGCCCATCATTGCGACCACCCCCCAGCCTGTGAAGACAAAGAAAGGGGTGAAGAGGAAAGCAGATACC  888

Query  883  ACCACCCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGG  956
            ||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct  889  ACCACCCCTACCACCATCGACCCCATTCATGAGCCACCCTCACTGGCCCCAGAGCCCAAGACCGCCAAGCTGGG  962

Query  957  CCAGCGGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCAC  1030
            .|..|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||..|
Sbjct  963  TCCTCGGCGGGAGAGCAGCAGACCTGTGAAGCCTCCAAAGAAGGATGTACCGGACTCACAGCAGCACCCAGGGC  1036

Query 1031  CAGAGAAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAG  1104
            |||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CAGAGAAGAGCAGCAAGATCTCTGAGCAGCTAAAGTGCTGCAGTGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAA  1110

Query 1105  CACGCCGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACAT  1178
            ||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATGCTGCCTATGCCTGGCCTTTCTACAAGCCTGTGGATGTGGAGGCACTGGGTCTGCACGACTACTGTGACAT  1184

Query 1179  CATCAAGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGT  1252
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||.|.|||||.|||||.|
Sbjct 1185  CATCAAACATCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTAGAGTCCCGAGAGTACAGAGATGCCCAGGAAT  1258

Query 1253  TTGGTGCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATG  1326
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259  TTGGTGCTGATGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTACAAGTACAACCCCCCTGACCATGAAGTGGTAGCCATG  1332

Query 1327  GCCCGCAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGC  1400
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||..|
Sbjct 1333  GCTCGAAAACTCCAGGATGTGTTTGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCTGATGAGCCTGAAGAGCCAGTTGTTAC  1406

Query 1401  CGTGTCCTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATA  1474
            .||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407  AGTGTCCTCTCCTGCAGTGCCACCCCCTACAAAGGTGGTAGCCCCACCCTCATCTAGTGACAGCAGCAGCGACA  1480

Query 1475  GCTCCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAG  1548
            |.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1481  GTTCTTCCGACAGCGACAGTTCCACTGACGACTCTGAGGAAGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAACTCCAGGAA  1554

Query 1549  CAGCTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAA  1622
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGCTCAAGGCCGTGCATGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCACAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAA  1628

Query 1623  AGACAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCA  1696
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1629  GGACAAGAAGGAAAAGAAAAAGGAAAAGCACAAAAAGAAAGAAGAAGTGGAGGAAAATAAAAAAAGCAAAACCA  1702

Query 1697  AGGAACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCC  1770
            ||||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||
Sbjct 1703  AGGAACTTCCTCCCAAAAAGACAAAGAAAAATAACAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAACCAGTACCC  1776

Query 1771  ATGAAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAA  1844
            |.|||||.||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1777  ACGAAGACCAAGCCGCCTCCCACATATGAATCAGAAGAGGAGGATAAGTGTAAGCCCATGTCTTATGAGGAGAA  1850

Query 1845  GCGGCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCAC  1918
            |||||||||.||..|.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||.
Sbjct 1851  GCGGCAGCTAAGTCTAGATATCAACAAACTTCCTGGTGAGAAGCTAGGCCGTGTAGTACACATAATTCAGTCAA  1924

Query 1919  GGGAGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTG  1992
            ||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1925  GGGAACCATCACTTAAAAACTCCAACCCCGATGAGATTGAGATTGACTTTGAGACCCTGAAGCCATCTACACTA  1998

Query 1993  CGTGAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGAT  2066
            ||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1999  CGAGAGTTGGAGCGATATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAAAAAGTTGACGTGAT  2072

Query 2067  TGCCGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACA  2140
            |||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCTGGTTCTTCCAAGATGAAGGGATTCTCATCCTCTGAGTCGGAGAGCACCAGCGAATCCAGCTCCTCTGACA  2146

Query 2141  GCGAAGACTCCGAAACAGCTTTCTGCACCAGTGGAGACTTCGTGTCCCCAGGGCCTTCCCCGTATCACAGTCAC  2214
            |.||||||||.||||||| .|.||||.                                               
Sbjct 2147  GTGAAGACTCTGAAACAG-GTCCTGCC-----------------------------------------------  2172

Query 2215  GTGCAGTGCGGCCGCTTCAGGGAGATGCTTCGCTGGTTTCTGGTGGATGTGGAGCAGACTGCAGCTGGCCAGCC  2288
                                                                                      
Sbjct 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172

Query 2289  GCATCGCCAGTCTGCTGCTGGCCCTGCCATCACCTGGGCCCCAGCCATTGCCTACCCCTCCCCAGAGTGTGCTC  2362
                                                                                      
Sbjct 2173  --------------------------------------------------------------------------  2172

Query 2363  GTTGCTGTGTTGGCTGCTCC  2382
                                
Sbjct 2173  --------------------  2172