Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000487812
- Subject:
- NM_016700.4
- Aligned Length:
- 1398
- Identities:
- 924
- Gaps:
- 247
Alignment
Query 1 ATGAGCCTCCATTTCTTATACTACTGCAGTGAACCAACATTGGATGTGAAAATTGCCTTTTGTCAGGGATTCGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAACAAGTGGATGTGTCATATATTGCCAAACATTACAACATGAGCAAAAGCAAAGTTGACAACCAGTTCTACA 148
|||||||.|||||||..|||||||.|.||.||.|
Sbjct 1 ----------------------------------------ATGAGCAGAAGCAAACGTGACAACAATTTTTATA 34
Query 149 GTGTGGAAGTGGGAGACTCAACCTTCACAGTTCTCAAGCGCTACCAGAATCTAAAGCCTATTGGCTCTGGGGCT 222
||||.||..|.|||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||.||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 35 GTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTAAAACGATACCAGAATTTAAAGCCTATAGGCTCAGGAGCT 108
Query 223 CAGGGCATAGTTTGTGCCGCGTATGATGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 296
||.||.|||||.|||||.||.||||||||..|.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.||
Sbjct 109 CAAGGAATAGTGTGTGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAAAGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTCAGCCGGCCATT 182
Query 297 TCAGAACCAAACACATGCCAAGAGAGCGTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 370
||||||.||.||.|||||.|||.|.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 183 TCAGAATCAGACCCATGCTAAGCGCGCCTACCGAGAACTAGTTCTTATGAAGTGTGTTAATCACAAAAATATAA 256
Query 371 TTAGTTTATTAAATGTCTTCACACCCCAGAAAACGCTGGAGGAGTTCCAAGATGTTTACTTAGTAATGGAACTG 444
||.|..|.||.|||||.||||||||.||||||.|.||.||.||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.
Sbjct 257 TTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAGAAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTC 330
Query 445 ATGGATGCCAA-CTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAA 517
||||||||.|| ||| ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||..|||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 331 ATGGATGCAAATCTT-TGCCAAGTGATTCAGATGGAGTTAGATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAAA 403
Query 518 TGTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTC 591
||.|||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 404 TGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCACTCTGCTGGAATTATTCATCGGGACTTAAAGCCTAGTAATATAGTAGTC 477
Query 592 AAGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCC 665
||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct 478 AAATCAGACTGCACTTTGAAGATTCTTGATTTTGGACTGGCGAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCC 551
Query 666 ATATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATAT 739
.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 552 TTATGTGGTGACTCGCTACTACAGAGCACCAGAGGTCATTCTCGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACTTAT 625
Query 740 GGTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAG 813
||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 626 GGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAG 699
Query 814 TGGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAA 887
||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.|.
Sbjct 700 TGGAATAAAGTTATTGAACAGCTCGGAACACCTTGTCCTGAATTCATGAAGAAACTACAACCAACAGTAAGGAC 773
Query 888 CTATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGG 961
.|||||.||.||..||||.||.||.||.|||...|.|||....|||||.|||||.|||...||.||||||||.|
Sbjct 774 TTATGTTGAAAACAGGCCTAAATACGCTGGATATAGCTTTGAGAAACTGTTCCCCGATGTGCTTTTCCCAGCTG 847
Query 962 ACTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCA 1035
||||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||.||||||||.||.||..||.|.
Sbjct 848 ACTCAGAGCATAACAAACTTAAAGCCAGTCAGGCAAGAGATTTGTTATCCAAAATGCTAGTAATAGATGCATCC 921
Query 1036 AAAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGC 1109
|||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.||.||||||||||||||||||||.||..|.||||..||.||
Sbjct 922 AAAAGGATCTCCGTAGATGAAGCTCTCCAGCACCCATACATCAACGTCTGGTATGATCCTTCAGAAGCAGAAGC 995
Query 1110 GCCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCT 1183
.||.|||||..||||....|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct 996 CCCACCACCAAAGATCCCGGACAAGCAGTTAGATGAGAGGGAGCACACAATAGAGGAGTGGAAAGAACTGATAT 1069
Query 1184 ACAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGCACAG 1257
|||||||.||||||.|||..||.|||...|||||.|||||.||..|||.|||.|||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1070 ACAAGGAGGTAATGGATTTGGAGGAACGAACTAAGAATGGAGTCATAAGAGGGCAGCCGTCTCCTTTAGCACAG 1143
Query 1258 GTGCAGCAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGAC 1331
||||||||.
Sbjct 1144 GTGCAGCAA----------------------------------------------------------------- 1152
Query 1332 CAGACCCTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 1397
Sbjct 1153 ------------------------------------------------------------------ 1152