Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487852
• Subject: XM_006723828.2
• Aligned Length: 2621
• Identities: 2554
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ATGGGCCCCCCGAGCCTCGTGCTGTGCTTGCTGTCCGCAACTGTGTTCTCCCTGCTGGGTGGAAGCTCGGCCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCCCCCGAGCCTCGTGCTGTGCTTGCTGTCCGCAACTGTGTTCTCCCTGCTGGGTGGAAGCTCGGCCTT  74

Query   75  CCTGTCGCACCACCGCCTGAAAGGCAGGTTTCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGCCCCAACATCATCCTGGTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGTCGCACCACCGCCTGAAAGGCAGGTTTCAGAGGGACCGCAGGAACATCCGCCCCAACATCATCCTGGTGC  148

Query  149  TGACGGACGACCAGGATGTGGAGCTGGGTTCCATGCAGGTGATGAACAAGACCCGGCGCATCATGGAGCAGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGACGGACGACCAGGATGTGGAGCTGGGTTCCATGCAGGTGATGAACAAGACCCGGCGCATCATGGAGCAGGGC  222

Query  223  GGGACGCACTTCATCAACGCCTTCGTGACCACACCCATGTGCTGCCCCTCACGCTCCTCCATCCTCACCGGCAA  296
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  GGGGCGCACTTCATCAACGCCTTCGTGACCACACCCATGTGCTGCCCCTCACGCTCCTCCATCCTCACTGGCAA  296

Query  297  GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAACTGCTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCACAGCACGAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACGTCCACAACCACAACACCTACACCAACAATGAGAACTGCTCCTCGCCCTCCTGGCAGGCACAGCACGAGA  370

Query  371  GCCGCACCTTTGCCGTGTACCTCAATAGCACTGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGGAAGTATCTTAATGAATAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGCACCTTTGCCGTGTACCTCAATAGCACTGGCTACCGGACAGCTTTCTTCGGGAAGTATCTTAATGAATAC  444

Query  445  AACGGCTCCTACGTGCCACCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGACTCCTTAAAAACTCCCGCTTTTATAACTACAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACGGCTCCTACGTGCCACCCGGCTGGAAGGAGTGGGTCGGACTCCTTAAAAACTCCCGCTTTTATAACTACAC  518

Query  519  GCTGTGTCGGAACGGGGTGAAAGAGAAGCACGGCTCCGACTACTCCAAGGATTACCTCACAGACCTCATCACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGTGTCGGAACGGGGTGAAAGAGAAGCACGGCTCCGACTACTCCAAGGATTACCTCACAGACCTCATCACCA  592

Query  593  ATGACAGCGTGAGCTTCTTCCGCACGTCCAAGAAGATGTACCCGCACAGGCCAGTCCTCATGGTCATCAGCCAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGACAGCGTGAGCTTCTTCCGCACGTCCAAGAAGATGTACCCGCACAGGCCAGTCCTCATGGTCATCAGCCAT  666

Query  667  GCAGCCCCCCACGGCCCTGAGGATTCAGCCCCACAATATTCACGCCTCTTCCCAAACGCATCTCAGCACATCAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGCCCCCCACGGCCCTGAGGATTCAGCCCCACAATATTCACGCCTCTTCCCAAACGCATCTCAGCACATCAC  740

Query  741  GCCGAGCTACAACTACGCGCCCAACCCGGACAAACACTGGATCATGCGCTACACGGGGCCCATGAAGCCCATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCGAGCTACAACTACGCGCCCAACCCGGACAAACACTGGATCATGCGCTACACGGGGCCCATGAAGCCCATCC  814

Query  815  ACATGGAATTCACCAACATGCTCCAGCGGAAGCGCTTGCAGACCCTCATGTCGGTGGACGACTCCATGGAGACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATGGAATTCACCAACATGCTCCAGCGGAAGCGCTTGCAGACCCTCATGTCGGTGGACGACTCCATGGAGACG  888

Query  889  ATTTACAACATGCTGGTTGAGACGGGCGAGCTGGACAACACGTACATCGTATACACCGCCGACCACGGTTACCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTTACAACATGCTGGTTGAGACGGGCGAGCTGGACAACACGTACATCGTATACACCGCCGACCACGGTTACCA  962

Query  963  CATCGGCCAGTTTGGCCTGGTGAAAGGGAAATCCATGCCATATGAGTTTGACATCAGGGTCCCGTTCTACGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCGGCCAGTTTGGCCTGGTGAAAGGGAAATCCATGCCATATGAGTTTGACATCAGGGTCCCGTTCTACGTGA  1036

Query 1037  GGGGCCCCAACGTGGAAGCCGGCTGTCTGAATCCCCACATCGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGGCCCCAACGTGGAAGCCGGCTGTCTGAATCCCCACATCGTCCTCAACATTGACCTGGCCCCCACCATCCTG  1110

Query 1111  GACATTGCAGGCCTGGACATACCTGCGGATATGGACGGGAAATCCATCCTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACATTGCAGGCCTGGACATACCTGCGGATATGGACGGGAAATCCATCCTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCC  1184

Query 1185  GGTGAATCGGTTTCACTTGAAAAAGAAGATGAGGGTCTGGCGGGACTCCTTCTTGGTGGAGAGAGGCAAGCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGAATCGGTTTCACTTGAAAAAGAAGATGAGGGTCTGGCGGGACTCCTTCTTGGTGGAGAGAGGCAAGCTGC  1258

Query 1259  TACACAAGAGAGACAATGACAAGGTGGACGCCCAGGAGGAGAACTTTCTGCCCAAGTACCAGCGTGTGAAGGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TACACAAGAGAGACAATGACAAGGTGGACGCCCAGGAGGAGAACTTTCTGCCCAAGTACCAGCGTGTGAAGGAC  1332

Query 1333  CTGTGTCAGCGTGCTGAGTACCAGACGGCGTGTGAGCAGCTGGGACAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCCAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGTGTCAGCGTGCTGAGTACCAGACGGCGTGTGAGCAGCTGGGACAGAAGTGGCAGTGTGTGGAGGACGCCAC  1406

Query 1407  GGGGAAGCTGAAGCTGCATAAGTGCAAGGGCCCCATGCGGCTGGGCGGCAGCAGAGCCCTCTCCAACCTCGTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGAAGCTGAAGCTGCATAAGTGCAAGGGCCCCATGCGGCTGGGCGGCAGCAGAGCCCTCTCCAACCTCGTGC  1480

Query 1481  CCAAGTACTACGGGCAGGGCAGCGAGGCCTGCACCTGTGACAGCGGGGACTACAAGCTCAGCCTGGCCGGACGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAAGTACTACGGGCAGGGCAGCGAGGCCTGCACCTGTGACAGCGGGGACTACAAGCTCAGCCTGGCCGGACGC  1554

Query 1555  CGGAAAAAACTCTTCAAGAAGAAGTACAAGGCCAGCTATGTCCGCAGTCGCTCCATCCGCTCAGTGGCCATCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CGGAAAAAACTCTTCAAGAAGAAGTACAAGGCCAGCTATGTCCGCAGTCGCTCCATCCGCTCAGTGGCCATCGA  1628

Query 1629  GGTGGACGGCAGGGTGTACCACGTAGGCCTGGGTGATGCCGCCCAGCCCCGAAACCTCACCAAGCGGCACTGGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGTGGACGGCAGGGTGTACCACGTAGGCCTGGGTGATGCCGCCCAGCCCCGAAACCTCACCAAGCGGCACTGGC  1702

Query 1703  CAGGGGCCCCTGAGGACCAAGATGACAAGGATGGTGGGGACTTCAGTGGCACTGGAGGCCTTCCCGACTACTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGGGGCCCCTGAGGACCAAGATGACAAGGATGGTGGGGACTTCAGTGGCACTGGAGGCCTTCCCGACTACTCA  1776

Query 1777  GCCGCCAACCCCATTAAAGTGACACATC---GGTGCTACATCCTAGAGAACGACACAGTCCAGTGTGACCTGGA  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCGCCAACCCCATTAAAGTGACACATCGCAGGTGCTACATCCTAGAGAACGACACAGTCCAGTGTGACCTGGA  1850

Query 1848  CCTGTACAAGTCCCTGCAGGCCTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCACGAGATTGAAACCCTGCAGAACA  1921
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTGTACAAGTCCCTGCAGGCCTGGAAAGACCACAAGCTGCACATCGACCACGAGATTGAAACCCTGCAGAACA  1924

Query 1922  AAATTAAGAACCTGAGGGAAGTCCGAGGTCACCTGAAGAAAAAGCGGCCAGAAGAATGTGACTGTCACAAAATC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AAATTAAGAACCTGAGGGAAGTCCGAGGTCACCTGAAGAAAAAGCGGCCAGAAGAATGTGACTGTCACAAAATC  1998

Query 1996  AGCTACCACACCCAGCACAAAGGCCGCCTCAAGCACAGAGGCTCCAGTCTGCATCCTTTCAGGAAGGGCCTGCA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCTACCACACCCAGCACAAAGGCCGCCTCAAGCACAGAGGCTCCAGTCTGCATCCTTTCAGGAAGGGCCTGCA  2072

Query 2070  AGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGTTGCGGGAGCAGAAGCGCAAGAAGAAACTCCGCAAGCTGCTCAAGCGCCTGC  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGAGAAGGACAAGGTGTGGCTGTTGCGGGAGCAGAAGCGCAAGAAGAAACTCCGCAAGCTGCTCAAGCGCCTGC  2146

Query 2144  AGAACAACGACACGTGCAGCATGCCAGGCCTCACGTGCTTCACCCACGACAACCAGCACTGGCAGACGGCGCCT  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAACAACGACACGTGCAGCATGCCAGGCCTCACGTGCTTCACCCACGACAACCAGCACTGGCAGACGGCGCCT  2220

Query 2218  TTCTGGACACTGGGGCCTTTCTGTGCCTGCACCAGCGCCAACAATAACACGTACTGGTGCATGAGGACCATCAA  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTCTGGACACTGGGGCCTTTCTGTGCCTGCACCAGCGCCAACAATAACACGTACTGGTGCATGAGGACCATCAA  2294

Query 2292  TGAGACTCACAATTTCCTCTTCTGTGAATTTGCAACTGGCTTCCTAGAGTACTTTGATCTCAACACAGACCCCT  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGAGACTCACAATTTCCTCTTCTGTGAATTTGCAACTGGCTTCCTAGAGTACTTTGATCTCAACACAGACCCCT  2368

Query 2366  ACCAGCTGATGAATGCAGTGAACACACTGGACAGGGATGTCCTCAACCAGCTACACGTACAGCTCATGGAGCTG  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACCAGCTGATGAATGCAGTGAACACACTGGACAGGGATGTCCTCAACCAGCTACACGTACAGCTCATGGAGCTG  2442

Query 2440  AGGAGCTGCAAGGGTTACAAGCAGTGTAACCCCCGGACTCGAAACATGGACCTGGGACTTAAAGATGGAGGAAG  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AGGAGCTGCAAGGGTTACAAGCAGTGTAACCCCCGGACTCGAAACATGGACCTGGGACTTAAAGATGGAGGAAG  2516

Query 2514  CTATGAGCAATACAG------------------------------------------------------GGGAC  2533
            |||||||||||||||                                                      |||||
Sbjct 2517  CTATGAGCAATACAGGCAGTTTCAGCGTCGAAAGTGGCCAGAAATGAAGAGACCTTCTTCCAAATCACTGGGAC  2590

Query 2534  AACTGTGGGAAGGCTGGGAAGGTTAAAAGCT  2564
            |||||||||||||||||||||||        
Sbjct 2591  AACTGTGGGAAGGCTGGGAAGGT--------  2613