Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000487873
Subject:
NM_031268.6
Aligned Length:
1668
Identities:
1287
Gaps:
381

Alignment

Query    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74

Query   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148

Query  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222

Query  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296

Query  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGA------------------------------------------  328

Query  371  TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA  444
                                                                                      
Sbjct  329  --------------------------------------------------------------------------  328

Query  445  TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA  518
                                                                                      
Sbjct  329  --------------------------------------------------------------------------  328

Query  519  AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG  592
                                                                                      
Sbjct  329  --------------------------------------------------------------------------  328

Query  593  GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA  666
                                                                                      
Sbjct  329  --------------------------------------------------------------------------  328

Query  667  GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  740
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  -------------------------------------------CCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  359

Query  741  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  360  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  433

Query  815  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  434  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  507

Query  889  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  508  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  581

Query  963  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  582  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  655

Query 1037  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  656  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  729

Query 1111  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  803

Query 1185  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  877

Query 1259  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  878  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  951

Query 1333  GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  952  GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT  1025

Query 1407  ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1026  ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC  1099

Query 1481  TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG  1173

Query 1555  CCTAACAGGACGTATTATCTGATGGACCCCAGCGGGAACGCACACAAGTGGTGCAGGAAGATCCAGGAGGTTTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  CCTAACAGGACGTATTATCTGATGGACCCCAGCGGGAACGCACACAAGTGGTGCAGGAAGATCCAGGAGGTTTG  1247

Query 1629  GAGGCAGCGATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG  1668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  GAGGCAGCGATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG  1287