Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487873
• Subject: XM_017023271.2
• Aligned Length: 1829
• Identities: 1621
• Gaps: 190

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATG-GCC--AGGAC  11
                                                                        .|| |||  |||||
Sbjct    1  ATGTTGAAGATGTGGGTTAGTGAAATTGAGACCTGGCGCTTCCTGAGGCTGGCAGCCCGGTTGAGCCTGAGGAC  74

Query   12  CA---------------CCAGCCAGC------------------------TGTATGACGCCGTGCCCATCCAGT  46
            ||               .|||.|.||                        .|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGACTTGAGGCAGTTGGCAGTCCGCGCCTCGTTGCCCTCTGTCTGCCCTGGTATGACGCCGTGCCCATCCAGT  148

Query   47  CCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATCCCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATCCCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGC  222

Query  121  ATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCGCCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCGCCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCT  296

Query  195  GCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCTCGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGG  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCTCGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGG  370

Query  269  AAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGCTCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGCTCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAG  444

Query  343  AAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGGTCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGGTCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCA  518

Query  417  CCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACATTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACATTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAA  592

Query  491  ATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAAAATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAG  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAAAATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAG  666

Query  565  ATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACGGCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACGGCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTT  740

Query  639  AAATGAAGATATGCACATCCAGATCACAGATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCA  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAATGAAGATATGCACATCCAGATCACAGATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCA  814

Query  713  GGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGT  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGT  888

Query  787  TCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGA  962

Query  861  GTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACC  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACC  1036

Query  935  TCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTT  1110

Query 1009  AAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTA  1184

Query 1083  CCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCA  1258

Query 1157  TGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGC  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGC  1332

Query 1231  AACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAA  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAA  1406

Query 1305  GAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGA  1480

Query 1379  TGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTA  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTA  1554

Query 1453  TATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAA  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAA  1628

Query 1527  GAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG-----------CCTAACAGGACGTATTATCTG-----------ATG  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||           ||   |||   |.||| ||||           |||
Sbjct 1629  GAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACGGTGAGTCTGTTCC---CAG---GGATT-TCTGTGTGCAGGGTAATG  1695

Query 1579  G-----------ACCCCAGCGGGAACGCA--CACAAG---TGGTGC---AGGAAGATCCAG-GAGGTTTGGAGG  1632
            |           |||.| |.||||| |||  ||||.|   ||  ||   |||.||   ||| |.||.|.|| ||
Sbjct 1696  GGAGGGCTTTGCACCAC-GTGGGAA-GCAGCCACAGGCCTTG--GCCAGAGGGAG---CAGCGGGGATCGG-GG  1761

Query 1633  CAGC-----------------GATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG  1668
            ||||                 .||.|||||  |.|||..||            
Sbjct 1762  CAGCTGCCTCGCCCTTTCCGACATCCCAGA--CGCCCACAC------------  1800