Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487873
• Subject: XM_017023274.1
• Aligned Length: 1727
• Identities: 1545
• Gaps: 169

Alignment

Query    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------ATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  67

Query  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   68  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  141

Query  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  142  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  215

Query  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG  289

Query  371  TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  290  TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA  363

Query  445  TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA  437

Query  519  AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG  511

Query  593  GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA  585

Query  667  GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  659

Query  741  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  733

Query  815  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  807

Query  889  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  881

Query  963  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  955

Query 1037  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  1029

Query 1111  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  1103

Query 1185  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  1177

Query 1259  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  1251

Query 1333  GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  GGAAACCCTTGGCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTT  1325

Query 1407  ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  ATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTC  1399

Query 1481  TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  TGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG  1473

Query 1555  -----------CCTAACAGGACGTATTATCTG-----------ATGG-----------ACCCCAGCGGGAACGC  1595
                       ||   |||   |.||| ||||           ||||           |||.| |.||||| ||
Sbjct 1474  GTGAGTCTGTTCC---CAG---GGATT-TCTGTGTGCAGGGTAATGGGAGGGCTTTGCACCAC-GTGGGAA-GC  1538

Query 1596  A--CACAAG---TGGTGC---AGGAAGATCCAG-GAGGTTTGGAGGCAGC-----------------GATACCA  1643
            |  ||||.|   ||  ||   |||.||   ||| |.||.|.|| ||||||                 .||.|||
Sbjct 1539  AGCCACAGGCCTTG--GCCAGAGGGAG---CAGCGGGGATCGG-GGCAGCTGCCTCGCCCTTTCCGACATCCCA  1606

Query 1644  GAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAG  1668
            ||  |.|||..||            
Sbjct 1607  GA--CGCCCACAC------------  1617